MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 216

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187130	TTG	3	9	1354	1362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187130	ATA	2	6	1369	1374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187130	ATG	2	6	4164	4169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187130	TAA	2	6	4430	4435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187130	AGG	2	6	4569	4574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187130	GCA	2	6	4582	4587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NT_187130	CCG	2	6	5613	5618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NT_187130	CTA	2	6	5691	5696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NT_187130	ATG	2	6	7297	7302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187130	ATT	3	9	7748	7756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187130	ATT	3	9	7891	7899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187130	AAG	2	6	7958	7963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187130	TCA	2	6	8121	8126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NT_187130	TGA	2	6	8589	8594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187130	TCA	2	6	8647	8652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NT_187130	TGA	2	6	8724	8729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187130	ATA	2	6	8746	8751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187130	GGC	2	6	8779	8784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NT_187130	AAT	2	6	8904	8909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187130	AGA	3	9	11927	11935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187130	TTG	2	6	11938	11943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187130	GGC	2	6	11978	11983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NT_187130	TTA	2	6	15622	15627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187130	CTT	2	6	15709	15714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NT_187130	CGG	2	6	15746	15751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NT_187130	CAA	2	6	16903	16908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NT_187130	AGA	2	6	17549	17554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187130	GGC	2	6	17563	17568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NT_187130	GGC	2	6	18822	18827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NT_187130	GAG	2	6	21098	21103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187130	ATC	2	6	21139	21144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NT_187130	AGG	2	6	21225	21230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187130	TTG	2	6	21281	21286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187130	GAC	2	6	23091	23096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NT_187130	CTG	2	6	26159	26164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NT_187130	CGC	2	6	26205	26210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NT_187130	GGA	2	6	26678	26683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187130	CCT	2	6	27160	27165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NT_187130	GAT	2	6	30961	30966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187130	GCC	2	6	30988	30993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NT_187130	TGC	2	6	33383	33388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NT_187130	GCT	2	6	33411	33416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NT_187130	TAA	2	6	33476	33481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187130	CGT	2	6	34082	34087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NT_187130	GCC	2	6	36755	36760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NT_187130	ATG	2	6	36800	36805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187130	TTG	2	6	36827	36832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187130	ACC	2	6	36845	36850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NT_187130	ATG	2	6	36981	36986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187130	AGC	2	6	37037	37042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NT_187130	TTG	2	6	37113	37118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187130	ATG	2	6	37182	37187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187130	TTA	2	6	37390	37395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187130	GGC	2	6	37413	37418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NT_187130	GGA	2	6	37427	37432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187130	ATA	2	6	39393	39398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187130	CAG	3	9	39410	39418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NT_187130	ATG	2	6	40256	40261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187130	GTT	2	6	40332	40337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187130	CAG	2	6	40356	40361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NT_187130	GTT	3	9	41516	41524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187130	TCA	2	6	41569	41574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NT_187130	TTC	2	6	42447	42452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NT_187130	TAG	2	6	43491	43496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187130	CGA	2	6	43569	43574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NT_187130	TGC	2	6	43792	43797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NT_187130	CGC	2	6	43840	43845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NT_187130	ACG	2	6	43869	43874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NT_187130	CGG	2	6	43903	43908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NT_187130	CGC	2	6	45146	45151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NT_187130	AAG	2	6	45160	45165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187130	TGA	2	6	46921	46926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187130	TAA	2	6	47004	47009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NT_187130	CGT	2	6	47036	47041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NT_187130	CAC	2	6	47828	47833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NT_187130	GCC	2	6	53568	53573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NT_187130	AGG	2	6	53608	53613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187130	ATT	2	6	53637	53642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187130	TAT	2	6	55007	55012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187130	GCC	2	6	56287	56292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NT_187130	AAC	2	6	56303	56308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NT_187130	TGT	2	6	62889	62894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187130	CAG	2	6	62941	62946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NT_187130	ATG	2	6	66146	66151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NT_187130	CGG	2	6	68165	68170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NT_187130	AAC	2	6	68214	68219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NT_187130	CGC	2	6	68548	68553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NT_187130	ACA	2	6	68587	68592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NT_187130	AAT	2	6	68600	68605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NT_187130	ATA	2	6	70732	70737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187130	ATT	2	6	70810	70815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187130	TAA	2	6	70855	70860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187130	TGT	2	6	73562	73567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187130	CTT	2	6	80617	80622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NT_187130	GGC	2	6	80642	80647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NT_187130	TAA	2	6	80734	80739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187130	AAG	2	6	80750	80755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187130	TGA	2	6	80762	80767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187130	CAA	2	6	81646	81651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NT_187130	TGA	2	6	81728	81733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187130	GGA	2	6	81829	81834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187130	CGC	2	6	81890	81895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NT_187130	CTC	2	6	81905	81910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NT_187130	CGG	2	6	81912	81917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NT_187130	GAT	2	6	81966	81971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187130	TCA	2	6	82008	82013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NT_187130	ATT	2	6	82063	82068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187130	AGC	2	6	82174	82179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NT_187130	TGA	2	6	82189	82194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NT_187130	AGC	2	6	82221	82226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NT_187130	CAA	2	6	82293	82298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NT_187130	AGG	2	6	82414	82419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187130	CGC	2	6	82526	82531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NT_187130	CAA	2	6	83371	83376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NT_187130	CAT	2	6	83377	83382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NT_187130	TAA	2	6	83488	83493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NT_187130	TGA	2	6	83545	83550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NT_187130	ATC	2	6	83552	83557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NT_187130	TCA	2	6	83576	83581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NT_187130	TAA	2	6	83619	83624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NT_187130	CAG	2	6	83679	83684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NT_187130	CAG	2	6	84638	84643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NT_187130	ACA	2	6	84755	84760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NT_187130	CAC	3	9	84778	84786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NT_187130	ACC	2	6	84791	84796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NT_187130	AAC	2	6	84904	84909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NT_187130	CGG	2	6	84928	84933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NT_187130	GTG	2	6	89636	89641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NT_187130	CGC	2	6	90505	90510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NT_187130	ATG	2	6	92027	92032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NT_187130	CGG	2	6	92079	92084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NT_187130	CGT	2	6	92173	92178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NT_187130	ATC	2	6	92182	92187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NT_187130	AAT	2	6	93296	93301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NT_187130	GGA	2	6	93933	93938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NT_187130	ATA	2	6	94591	94596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NT_187130	TAA	2	6	94625	94630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NT_187130	CAT	2	6	94684	94689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NT_187130	TCG	2	6	94690	94695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NT_187130	TCG	2	6	95419	95424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.