MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187126	CG	3	6	1377	1382	0 %	0 %	50 %	50 %	409247809
2	NT_187126	GC	3	6	1725	1730	0 %	0 %	50 %	50 %	409247809
3	NT_187126	GC	3	6	2539	2544	0 %	0 %	50 %	50 %	409247810
4	NT_187126	GC	3	6	2969	2974	0 %	0 %	50 %	50 %	409247810
5	NT_187126	CG	3	6	3229	3234	0 %	0 %	50 %	50 %	409247811
6	NT_187126	GC	3	6	3458	3463	0 %	0 %	50 %	50 %	409247811
7	NT_187126	GC	3	6	4237	4242	0 %	0 %	50 %	50 %	409247812
8	NT_187126	AC	3	6	4490	4495	50 %	0 %	0 %	50 %	409247812
9	NT_187126	GC	3	6	4795	4800	0 %	0 %	50 %	50 %	409247812
10	NT_187126	CG	3	6	5031	5036	0 %	0 %	50 %	50 %	409247812
11	NT_187126	GT	3	6	5445	5450	0 %	50 %	50 %	0 %	409247812
12	NT_187126	GC	3	6	5572	5577	0 %	0 %	50 %	50 %	409247812
13	NT_187126	AG	4	8	5874	5881	50 %	0 %	50 %	0 %	409247812
14	NT_187126	TA	3	6	6143	6148	50 %	50 %	0 %	0 %	409247813
15	NT_187126	TA	3	6	6161	6166	50 %	50 %	0 %	0 %	409247813
16	NT_187126	GC	3	6	6393	6398	0 %	0 %	50 %	50 %	409247814
17	NT_187126	CT	3	6	7818	7823	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NT_187126	GC	3	6	8179	8184	0 %	0 %	50 %	50 %	409247815
19	NT_187126	TC	3	6	9217	9222	0 %	50 %	0 %	50 %	409247817
20	NT_187126	TC	3	6	9454	9459	0 %	50 %	0 %	50 %	409247818
21	NT_187126	CG	3	6	9983	9988	0 %	0 %	50 %	50 %	409247819
22	NT_187126	TG	3	6	10601	10606	0 %	50 %	50 %	0 %	409247819
23	NT_187126	GC	3	6	11017	11022	0 %	0 %	50 %	50 %	409247819
24	NT_187126	GT	3	6	11504	11509	0 %	50 %	50 %	0 %	409247820
25	NT_187126	CG	3	6	12081	12086	0 %	0 %	50 %	50 %	409247820
26	NT_187126	CG	3	6	12977	12982	0 %	0 %	50 %	50 %	409247820
27	NT_187126	GA	4	8	13180	13187	50 %	0 %	50 %	0 %	409247820
28	NT_187126	AG	3	6	13633	13638	50 %	0 %	50 %	0 %	409247821
29	NT_187126	GT	3	6	14185	14190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187126	CG	4	8	14596	14603	0 %	0 %	50 %	50 %	409247822
31	NT_187126	TC	3	6	14611	14616	0 %	50 %	0 %	50 %	409247822
32	NT_187126	CG	3	6	15230	15235	0 %	0 %	50 %	50 %	409247823
33	NT_187126	GC	4	8	17095	17102	0 %	0 %	50 %	50 %	409247826
34	NT_187126	AC	3	6	17401	17406	50 %	0 %	0 %	50 %	409247827
35	NT_187126	GC	3	6	17797	17802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NT_187126	CG	3	6	18630	18635	0 %	0 %	50 %	50 %	409247829
37	NT_187126	GC	3	6	18887	18892	0 %	0 %	50 %	50 %	409247829
38	NT_187126	GC	3	6	19084	19089	0 %	0 %	50 %	50 %	409247829
39	NT_187126	GC	3	6	19414	19419	0 %	0 %	50 %	50 %	409247829
40	NT_187126	TC	3	6	19945	19950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NT_187126	GC	3	6	20188	20193	0 %	0 %	50 %	50 %	409247830
42	NT_187126	GC	3	6	20527	20532	0 %	0 %	50 %	50 %	409247830
43	NT_187126	AG	3	6	21369	21374	50 %	0 %	50 %	0 %	409247831
44	NT_187126	GC	3	6	22181	22186	0 %	0 %	50 %	50 %	409247831
45	NT_187126	CG	3	6	22243	22248	0 %	0 %	50 %	50 %	409247831
46	NT_187126	CG	3	6	22325	22330	0 %	0 %	50 %	50 %	409247831
47	NT_187126	AG	3	6	22333	22338	50 %	0 %	50 %	0 %	409247831
48	NT_187126	GT	3	6	22786	22791	0 %	50 %	50 %	0 %	409247833
49	NT_187126	GC	3	6	23188	23193	0 %	0 %	50 %	50 %	409247833
50	NT_187126	CG	3	6	24501	24506	0 %	0 %	50 %	50 %	409247835
51	NT_187126	AT	3	6	24815	24820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187126	CG	4	8	25344	25351	0 %	0 %	50 %	50 %	409247836
53	NT_187126	AC	3	6	25699	25704	50 %	0 %	0 %	50 %	409247836
54	NT_187126	GC	3	6	26099	26104	0 %	0 %	50 %	50 %	409247837
55	NT_187126	TC	3	6	26116	26121	0 %	50 %	0 %	50 %	409247837
56	NT_187126	TG	3	6	26866	26871	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187126	TA	3	6	27034	27039	50 %	50 %	0 %	0 %	409247840
58	NT_187126	GC	3	6	27223	27228	0 %	0 %	50 %	50 %	409247840
59	NT_187126	GC	3	6	27528	27533	0 %	0 %	50 %	50 %	409247841
60	NT_187126	GT	3	6	28971	28976	0 %	50 %	50 %	0 %	409247842
61	NT_187126	CG	3	6	29093	29098	0 %	0 %	50 %	50 %	409247842
62	NT_187126	TG	3	6	29151	29156	0 %	50 %	50 %	0 %	409247842
63	NT_187126	CG	3	6	29444	29449	0 %	0 %	50 %	50 %	409247842
64	NT_187126	CT	3	6	30106	30111	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NT_187126	CG	3	6	33479	33484	0 %	0 %	50 %	50 %	409247847
66	NT_187126	GC	3	6	34267	34272	0 %	0 %	50 %	50 %	409247848
67	NT_187126	CG	3	6	35972	35977	0 %	0 %	50 %	50 %	409247850
68	NT_187126	CG	3	6	36263	36268	0 %	0 %	50 %	50 %	409247850
69	NT_187126	GC	3	6	36535	36540	0 %	0 %	50 %	50 %	409247850
70	NT_187126	GC	3	6	37532	37537	0 %	0 %	50 %	50 %	409247850
71	NT_187126	TG	3	6	37761	37766	0 %	50 %	50 %	0 %	409247850
72	NT_187126	CG	3	6	38431	38436	0 %	0 %	50 %	50 %	409247850
73	NT_187126	CT	3	6	41184	41189	0 %	50 %	0 %	50 %	409247851
74	NT_187126	GC	3	6	41194	41199	0 %	0 %	50 %	50 %	409247851
75	NT_187126	AG	3	6	42534	42539	50 %	0 %	50 %	0 %	409247851
76	NT_187126	CG	3	6	42974	42979	0 %	0 %	50 %	50 %	409247851
77	NT_187126	TA	4	8	43975	43982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187126	AT	3	6	45249	45254	50 %	50 %	0 %	0 %	409247854
79	NT_187126	TA	3	6	45551	45556	50 %	50 %	0 %	0 %	409247854
80	NT_187126	TA	4	8	45596	45603	50 %	50 %	0 %	0 %	409247854
81	NT_187126	GC	3	6	46143	46148	0 %	0 %	50 %	50 %	409247855
82	NT_187126	GC	3	6	46192	46197	0 %	0 %	50 %	50 %	409247855
83	NT_187126	GC	3	6	46588	46593	0 %	0 %	50 %	50 %	409247855
84	NT_187126	GA	3	6	47016	47021	50 %	0 %	50 %	0 %	409247855
85	NT_187126	GC	3	6	47169	47174	0 %	0 %	50 %	50 %	409247855
86	NT_187126	CG	3	6	47769	47774	0 %	0 %	50 %	50 %	409247856
87	NT_187126	CG	3	6	48616	48621	0 %	0 %	50 %	50 %	409247858
88	NT_187126	GC	3	6	49860	49865	0 %	0 %	50 %	50 %	409247860
89	NT_187126	GC	3	6	49892	49897	0 %	0 %	50 %	50 %	409247860
90	NT_187126	CG	3	6	50856	50861	0 %	0 %	50 %	50 %	409247860
91	NT_187126	GC	4	8	50913	50920	0 %	0 %	50 %	50 %	409247860
92	NT_187126	GC	3	6	51454	51459	0 %	0 %	50 %	50 %	409247860
93	NT_187126	AG	3	6	52459	52464	50 %	0 %	50 %	0 %	409247862
94	NT_187126	GC	3	6	52558	52563	0 %	0 %	50 %	50 %	409247862
95	NT_187126	CG	3	6	52948	52953	0 %	0 %	50 %	50 %	409247862
96	NT_187126	CG	3	6	53155	53160	0 %	0 %	50 %	50 %	409247862
97	NT_187126	GC	3	6	53848	53853	0 %	0 %	50 %	50 %	409247863
98	NT_187126	GC	3	6	54081	54086	0 %	0 %	50 %	50 %	409247863
99	NT_187126	TC	3	6	54554	54559	0 %	50 %	0 %	50 %	409247864
100	NT_187126	GC	3	6	54822	54827	0 %	0 %	50 %	50 %	409247864
101	NT_187126	GC	3	6	54874	54879	0 %	0 %	50 %	50 %	409247864
102	NT_187126	CG	3	6	56150	56155	0 %	0 %	50 %	50 %	409247867
103	NT_187126	GC	3	6	56169	56174	0 %	0 %	50 %	50 %	409247867
104	NT_187126	CG	4	8	56411	56418	0 %	0 %	50 %	50 %	409247867
105	NT_187126	GC	3	6	57093	57098	0 %	0 %	50 %	50 %	409247868
106	NT_187126	AG	4	8	57242	57249	50 %	0 %	50 %	0 %	409247868
107	NT_187126	CT	4	8	57317	57324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NT_187126	CG	3	6	57467	57472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NT_187126	AG	3	6	58550	58555	50 %	0 %	50 %	0 %	409247869
110	NT_187126	GC	3	6	59240	59245	0 %	0 %	50 %	50 %	409247870
111	NT_187126	GC	3	6	60289	60294	0 %	0 %	50 %	50 %	409247871
112	NT_187126	GC	3	6	61136	61141	0 %	0 %	50 %	50 %	409247871
113	NT_187126	CA	3	6	61674	61679	50 %	0 %	0 %	50 %	409247872
114	NT_187126	CA	3	6	62337	62342	50 %	0 %	0 %	50 %	409247872
115	NT_187126	GT	3	6	62614	62619	0 %	50 %	50 %	0 %	409247872
116	NT_187126	AG	3	6	63189	63194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.