MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187124	GGTAAA	2	12	8731	8742	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	409247671
2	NT_187124	CATAGC	2	12	10801	10812	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409247672
3	NT_187124	GTACGC	2	12	15697	15708	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409247678
4	NT_187124	GGTCCA	2	12	16902	16913	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409247679
5	NT_187124	TGCAGA	2	12	19166	19177	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409247680
6	NT_187124	ATCGGC	2	12	19213	19224	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409247680
7	NT_187124	GATGCG	2	12	19606	19617	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409247680
8	NT_187124	CATGAC	2	12	19917	19928	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409247680
9	NT_187124	TATCCG	2	12	20304	20315	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409247680
10	NT_187124	TGCTGT	2	12	20627	20638	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	409247681
11	NT_187124	CAGCGG	2	12	20911	20922	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409247681
12	NT_187124	GCGCCA	2	12	23008	23019	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409247683
13	NT_187124	TTAGCG	2	12	28333	28344	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409247688
14	NT_187124	GATATT	2	12	30049	30060	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	409247690
15	NT_187124	AATGGT	2	12	43028	43039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247704
16	NT_187124	TTCCCC	2	12	43450	43461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409247706
17	NT_187124	TGCGCG	2	12	44186	44197	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409247706
18	NT_187124	TCTTCC	2	12	45045	45056	0 %	50 %	0 %	50 %	409247708
19	NT_187124	GCTTTG	2	12	46116	46127	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	409247709
20	NT_187124	CCATGC	2	12	46655	46666	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409247709
21	NT_187124	TTTGTT	2	12	47267	47278	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	409247709
22	NT_187124	CCAGCC	2	12	58087	58098	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	409247721
23	NT_187124	TATTGA	2	12	59376	59387	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	409247722
24	NT_187124	CGATGC	2	12	59703	59714	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409247722
25	NT_187124	GCAGGA	2	12	60536	60547	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	409247723
26	NT_187124	CCAGCG	2	12	70855	70866	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409247735
27	NT_187124	CGCTGG	2	12	76211	76222	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409247741
28	NT_187124	GAAGCT	2	12	76854	76865	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409247741
29	NT_187124	CAATGC	2	12	80258	80269	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409247744
30	NT_187124	TGATAC	2	12	81290	81301	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	409247745
31	NT_187124	TACCGG	2	12	84614	84625	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409247750
32	NT_187124	TTTACC	2	12	93745	93756	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	409247759
33	NT_187124	GCTTTC	2	12	93848	93859	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	409247759
34	NT_187124	TTCGCC	2	12	96531	96542	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	409247762
35	NT_187124	GTTTCT	2	12	102322	102333	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	409247768
36	NT_187124	GCACGC	2	12	107934	107945	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409247772
37	NT_187124	CTGGTA	2	12	112694	112705	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409247777
38	NT_187124	GCGCAG	2	12	122222	122233	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409247784
39	NT_187124	GCGGCA	2	12	122968	122979	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409247784
40	NT_187124	CGCCAG	2	12	125761	125772	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409247786
41	NT_187124	CTTTCA	2	12	127420	127431	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	409247788
42	NT_187124	CTGCAT	2	12	127730	127741	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409247788
43	NT_187124	CGCTGG	2	12	128050	128061	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409247788
44	NT_187124	GCAGCG	2	12	128077	128088	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409247788
45	NT_187124	ACGTCA	2	12	134048	134059	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409247791
46	NT_187124	ATCGCG	2	12	138618	138629	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409247795
47	NT_187124	CCAGCG	2	12	139549	139560	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409247796
48	NT_187124	TTGCCG	2	12	142078	142089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247799
49	NT_187124	TTTTAG	2	12	142265	142276	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	409247799

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.