MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 336

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187124	GTAC	2	8	8	15	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NT_187124	CGTC	2	8	564	571	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NT_187124	AAAG	2	8	687	694	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187124	AGTC	2	8	1350	1357	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NT_187124	GCTG	2	8	1368	1375	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NT_187124	CGTC	2	8	2739	2746	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NT_187124	AATT	2	8	2985	2992	50 %	50 %	0 %	0 %	409247665
8	NT_187124	CATC	2	8	3089	3096	25 %	25 %	0 %	50 %	409247665
9	NT_187124	TGAA	2	8	4035	4042	50 %	25 %	25 %	0 %	409247667
10	NT_187124	CAGC	2	8	4058	4065	25 %	0 %	25 %	50 %	409247667
11	NT_187124	GACA	2	8	5278	5285	50 %	0 %	25 %	25 %	409247668
12	NT_187124	TGGC	2	8	5380	5387	0 %	25 %	50 %	25 %	409247669
13	NT_187124	GCTG	2	8	5388	5395	0 %	25 %	50 %	25 %	409247669
14	NT_187124	TCTT	2	8	6053	6060	0 %	75 %	0 %	25 %	409247670
15	NT_187124	TGCG	2	8	7562	7569	0 %	25 %	50 %	25 %	409247671
16	NT_187124	AAAG	2	8	9000	9007	75 %	0 %	25 %	0 %	409247671
17	NT_187124	CAGT	2	8	10316	10323	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NT_187124	GTCA	2	8	11067	11074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NT_187124	GTAA	2	8	11137	11144	50 %	25 %	25 %	0 %	409247673
20	NT_187124	TGCT	2	8	11570	11577	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NT_187124	GCGG	2	8	11774	11781	0 %	0 %	75 %	25 %	409247674
22	NT_187124	GTCT	2	8	12066	12073	0 %	50 %	25 %	25 %	409247674
23	NT_187124	CAGC	2	8	12654	12661	25 %	0 %	25 %	50 %	409247675
24	NT_187124	TCGA	2	8	12766	12773	25 %	25 %	25 %	25 %	409247675
25	NT_187124	CAGC	2	8	14664	14671	25 %	0 %	25 %	50 %	409247677
26	NT_187124	TCAA	2	8	14819	14826	50 %	25 %	0 %	25 %	409247677
27	NT_187124	GGCG	2	8	14998	15005	0 %	0 %	75 %	25 %	409247677
28	NT_187124	GATA	2	8	15540	15547	50 %	25 %	25 %	0 %	409247678
29	NT_187124	TATG	2	8	15893	15900	25 %	50 %	25 %	0 %	409247678
30	NT_187124	GCGA	2	8	16226	16233	25 %	0 %	50 %	25 %	409247678
31	NT_187124	ATCA	2	8	16236	16243	50 %	25 %	0 %	25 %	409247678
32	NT_187124	CTAT	2	8	16693	16700	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NT_187124	ACGC	2	8	16813	16820	25 %	0 %	25 %	50 %	409247679
34	NT_187124	ATCG	2	8	16855	16862	25 %	25 %	25 %	25 %	409247679
35	NT_187124	GGTC	2	8	18203	18210	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NT_187124	TGTT	2	8	18992	18999	0 %	75 %	25 %	0 %	409247680
37	NT_187124	CGAC	2	8	19010	19017	25 %	0 %	25 %	50 %	409247680
38	NT_187124	TGCG	2	8	20189	20196	0 %	25 %	50 %	25 %	409247680
39	NT_187124	AGAA	2	8	20363	20370	75 %	0 %	25 %	0 %	409247680
40	NT_187124	TAAA	2	8	23089	23096	75 %	25 %	0 %	0 %	409247683
41	NT_187124	CTTT	2	8	23620	23627	0 %	75 %	0 %	25 %	409247684
42	NT_187124	AAGA	2	8	23710	23717	75 %	0 %	25 %	0 %	409247684
43	NT_187124	CGCC	2	8	24681	24688	0 %	0 %	25 %	75 %	409247685
44	NT_187124	TGCG	2	8	25082	25089	0 %	25 %	50 %	25 %	409247685
45	NT_187124	CAAT	2	8	25997	26004	50 %	25 %	0 %	25 %	409247686
46	NT_187124	ATGA	2	8	26116	26123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187124	GGAT	2	8	26914	26921	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187124	TTTC	2	8	26999	27006	0 %	75 %	0 %	25 %	409247688
49	NT_187124	AACA	2	8	27371	27378	75 %	0 %	0 %	25 %	409247688
50	NT_187124	CAGC	2	8	27607	27614	25 %	0 %	25 %	50 %	409247688
51	NT_187124	ATAA	2	8	28520	28527	75 %	25 %	0 %	0 %	409247689
52	NT_187124	TGCC	2	8	28555	28562	0 %	25 %	25 %	50 %	409247689
53	NT_187124	CAGG	2	8	28772	28779	25 %	0 %	50 %	25 %	409247689
54	NT_187124	CGCC	2	8	28831	28838	0 %	0 %	25 %	75 %	409247689
55	NT_187124	CGCA	2	8	30503	30510	25 %	0 %	25 %	50 %	409247690
56	NT_187124	GTCG	2	8	30632	30639	0 %	25 %	50 %	25 %	409247690
57	NT_187124	CAGT	2	8	31150	31157	25 %	25 %	25 %	25 %	409247690
58	NT_187124	CTGC	2	8	31369	31376	0 %	25 %	25 %	50 %	409247690
59	NT_187124	CCAG	2	8	31630	31637	25 %	0 %	25 %	50 %	409247690
60	NT_187124	CGGG	2	8	31997	32004	0 %	0 %	75 %	25 %	409247691
61	NT_187124	CTGC	2	8	32209	32216	0 %	25 %	25 %	50 %	409247691
62	NT_187124	GCAG	2	8	32233	32240	25 %	0 %	50 %	25 %	409247691
63	NT_187124	TAAT	2	8	32461	32468	50 %	50 %	0 %	0 %	409247691
64	NT_187124	CTTG	2	8	32879	32886	0 %	50 %	25 %	25 %	409247692
65	NT_187124	CAGC	2	8	33909	33916	25 %	0 %	25 %	50 %	409247692
66	NT_187124	CGGT	2	8	33961	33968	0 %	25 %	50 %	25 %	409247692
67	NT_187124	CCAG	2	8	33977	33984	25 %	0 %	25 %	50 %	409247692
68	NT_187124	CAGC	2	8	34850	34857	25 %	0 %	25 %	50 %	409247693
69	NT_187124	GATC	2	8	35121	35128	25 %	25 %	25 %	25 %	409247694
70	NT_187124	CATC	2	8	35475	35482	25 %	25 %	0 %	50 %	409247694
71	NT_187124	CAAA	2	8	35601	35608	75 %	0 %	0 %	25 %	409247694
72	NT_187124	GAAC	2	8	35612	35619	50 %	0 %	25 %	25 %	409247694
73	NT_187124	TCTG	2	8	35882	35889	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NT_187124	CGGG	2	8	36835	36842	0 %	0 %	75 %	25 %	409247695
75	NT_187124	TCTT	2	8	36868	36875	0 %	75 %	0 %	25 %	409247695
76	NT_187124	AGAA	2	8	38373	38380	75 %	0 %	25 %	0 %	409247697
77	NT_187124	GCCA	2	8	38751	38758	25 %	0 %	25 %	50 %	409247698
78	NT_187124	CTTT	2	8	39004	39011	0 %	75 %	0 %	25 %	409247698
79	NT_187124	GAAA	2	8	39182	39189	75 %	0 %	25 %	0 %	409247698
80	NT_187124	CTTG	2	8	39297	39304	0 %	50 %	25 %	25 %	409247698
81	NT_187124	ACCA	2	8	39374	39381	50 %	0 %	0 %	50 %	409247698
82	NT_187124	CGCC	2	8	40150	40157	0 %	0 %	25 %	75 %	409247700
83	NT_187124	GTTG	2	8	41022	41029	0 %	50 %	50 %	0 %	409247701
84	NT_187124	CATC	2	8	41241	41248	25 %	25 %	0 %	50 %	409247701
85	NT_187124	ATCA	2	8	41391	41398	50 %	25 %	0 %	25 %	409247702
86	NT_187124	GGCT	2	8	41910	41917	0 %	25 %	50 %	25 %	409247703
87	NT_187124	GCCC	2	8	42490	42497	0 %	0 %	25 %	75 %	409247703
88	NT_187124	GGAT	2	8	42803	42810	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187124	ATGG	2	8	43154	43161	25 %	25 %	50 %	0 %	409247705
90	NT_187124	CAGG	2	8	43274	43281	25 %	0 %	50 %	25 %	409247705
91	NT_187124	CAGC	2	8	44241	44248	25 %	0 %	25 %	50 %	409247706
92	NT_187124	GATT	2	8	44762	44769	25 %	50 %	25 %	0 %	409247707
93	NT_187124	CGCC	2	8	45253	45260	0 %	0 %	25 %	75 %	409247708
94	NT_187124	CGCC	2	8	45316	45323	0 %	0 %	25 %	75 %	409247708
95	NT_187124	AATG	2	8	45352	45359	50 %	25 %	25 %	0 %	409247708
96	NT_187124	CAGC	2	8	45480	45487	25 %	0 %	25 %	50 %	409247708
97	NT_187124	AAGG	2	8	45941	45948	50 %	0 %	50 %	0 %	409247709
98	NT_187124	CGAA	2	8	46798	46805	50 %	0 %	25 %	25 %	409247709
99	NT_187124	GGTC	2	8	47539	47546	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NT_187124	CACG	2	8	48032	48039	25 %	0 %	25 %	50 %	409247710
101	NT_187124	GATC	2	8	48194	48201	25 %	25 %	25 %	25 %	409247710
102	NT_187124	TGGT	2	8	48325	48332	0 %	50 %	50 %	0 %	409247710
103	NT_187124	CTTC	2	8	48554	48561	0 %	50 %	0 %	50 %	409247711
104	NT_187124	AAAG	2	8	49159	49166	75 %	0 %	25 %	0 %	409247712
105	NT_187124	ACGC	2	8	49673	49680	25 %	0 %	25 %	50 %	409247712
106	NT_187124	TTTG	2	8	49870	49877	0 %	75 %	25 %	0 %	409247712
107	NT_187124	CGAA	2	8	50170	50177	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NT_187124	TATT	2	8	50838	50845	25 %	75 %	0 %	0 %	409247713
109	NT_187124	ATTG	2	8	50852	50859	25 %	50 %	25 %	0 %	409247713
110	NT_187124	CAAT	2	8	51102	51109	50 %	25 %	0 %	25 %	409247713
111	NT_187124	GCCG	2	8	51579	51586	0 %	0 %	50 %	50 %	409247714
112	NT_187124	GGAT	2	8	52504	52511	25 %	25 %	50 %	0 %	409247714
113	NT_187124	TTAA	2	8	52939	52946	50 %	50 %	0 %	0 %	409247715
114	NT_187124	CCAA	2	8	53635	53642	50 %	0 %	0 %	50 %	409247716
115	NT_187124	CGCC	2	8	53759	53766	0 %	0 %	25 %	75 %	409247716
116	NT_187124	CGAA	2	8	53937	53944	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NT_187124	TCGT	2	8	53992	53999	0 %	50 %	25 %	25 %	409247717
118	NT_187124	ATCT	2	8	54343	54350	25 %	50 %	0 %	25 %	409247717
119	NT_187124	CCAG	2	8	55059	55066	25 %	0 %	25 %	50 %	409247719
120	NT_187124	ATCG	2	8	55816	55823	25 %	25 %	25 %	25 %	409247719
121	NT_187124	TATC	2	8	56385	56392	25 %	50 %	0 %	25 %	409247720
122	NT_187124	GTGG	2	8	56674	56681	0 %	25 %	75 %	0 %	409247720
123	NT_187124	GACG	2	8	57532	57539	25 %	0 %	50 %	25 %	409247721
124	NT_187124	GATC	2	8	57994	58001	25 %	25 %	25 %	25 %	409247721
125	NT_187124	TGTC	2	8	58489	58496	0 %	50 %	25 %	25 %	409247722
126	NT_187124	GGTC	2	8	58869	58876	0 %	25 %	50 %	25 %	409247722
127	NT_187124	GCAG	2	8	58991	58998	25 %	0 %	50 %	25 %	409247722
128	NT_187124	CAGC	2	8	59106	59113	25 %	0 %	25 %	50 %	409247722
129	NT_187124	TGGC	2	8	59234	59241	0 %	25 %	50 %	25 %	409247722
130	NT_187124	ACCT	2	8	59992	59999	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NT_187124	GGTC	2	8	60608	60615	0 %	25 %	50 %	25 %	409247723
132	NT_187124	CAAC	2	8	60746	60753	50 %	0 %	0 %	50 %	409247723
133	NT_187124	TACG	2	8	60829	60836	25 %	25 %	25 %	25 %	409247723
134	NT_187124	GAAT	2	8	61581	61588	50 %	25 %	25 %	0 %	409247724
135	NT_187124	ATTA	2	8	61756	61763	50 %	50 %	0 %	0 %	409247724
136	NT_187124	AGCG	2	8	61829	61836	25 %	0 %	50 %	25 %	409247724
137	NT_187124	TAAT	2	8	62828	62835	50 %	50 %	0 %	0 %	409247725
138	NT_187124	CTTG	2	8	63012	63019	0 %	50 %	25 %	25 %	409247725
139	NT_187124	ATTT	2	8	63583	63590	25 %	75 %	0 %	0 %	409247727
140	NT_187124	AGGT	2	8	64319	64326	25 %	25 %	50 %	0 %	409247728
141	NT_187124	TAAT	2	8	64609	64616	50 %	50 %	0 %	0 %	409247729
142	NT_187124	GTTT	2	8	66437	66444	0 %	75 %	25 %	0 %	409247731
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.