MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 285

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187124	AATT	2	8	2985	2992	50 %	50 %	0 %	0 %	409247665
2	NT_187124	CATC	2	8	3089	3096	25 %	25 %	0 %	50 %	409247665
3	NT_187124	TGAA	2	8	4035	4042	50 %	25 %	25 %	0 %	409247667
4	NT_187124	CAGC	2	8	4058	4065	25 %	0 %	25 %	50 %	409247667
5	NT_187124	GACA	2	8	5278	5285	50 %	0 %	25 %	25 %	409247668
6	NT_187124	TGGC	2	8	5380	5387	0 %	25 %	50 %	25 %	409247669
7	NT_187124	GCTG	2	8	5388	5395	0 %	25 %	50 %	25 %	409247669
8	NT_187124	TCTT	2	8	6053	6060	0 %	75 %	0 %	25 %	409247670
9	NT_187124	TGCG	2	8	7562	7569	0 %	25 %	50 %	25 %	409247671
10	NT_187124	AAAG	2	8	9000	9007	75 %	0 %	25 %	0 %	409247671
11	NT_187124	GTAA	2	8	11137	11144	50 %	25 %	25 %	0 %	409247673
12	NT_187124	GCGG	2	8	11774	11781	0 %	0 %	75 %	25 %	409247674
13	NT_187124	GTCT	2	8	12066	12073	0 %	50 %	25 %	25 %	409247674
14	NT_187124	CAGC	2	8	12654	12661	25 %	0 %	25 %	50 %	409247675
15	NT_187124	TCGA	2	8	12766	12773	25 %	25 %	25 %	25 %	409247675
16	NT_187124	CAGC	2	8	14664	14671	25 %	0 %	25 %	50 %	409247677
17	NT_187124	TCAA	2	8	14819	14826	50 %	25 %	0 %	25 %	409247677
18	NT_187124	GGCG	2	8	14998	15005	0 %	0 %	75 %	25 %	409247677
19	NT_187124	GATA	2	8	15540	15547	50 %	25 %	25 %	0 %	409247678
20	NT_187124	TATG	2	8	15893	15900	25 %	50 %	25 %	0 %	409247678
21	NT_187124	GCGA	2	8	16226	16233	25 %	0 %	50 %	25 %	409247678
22	NT_187124	ATCA	2	8	16236	16243	50 %	25 %	0 %	25 %	409247678
23	NT_187124	ACGC	2	8	16813	16820	25 %	0 %	25 %	50 %	409247679
24	NT_187124	ATCG	2	8	16855	16862	25 %	25 %	25 %	25 %	409247679
25	NT_187124	TGTT	2	8	18992	18999	0 %	75 %	25 %	0 %	409247680
26	NT_187124	CGAC	2	8	19010	19017	25 %	0 %	25 %	50 %	409247680
27	NT_187124	TGCG	2	8	20189	20196	0 %	25 %	50 %	25 %	409247680
28	NT_187124	AGAA	2	8	20363	20370	75 %	0 %	25 %	0 %	409247680
29	NT_187124	TAAA	2	8	23089	23096	75 %	25 %	0 %	0 %	409247683
30	NT_187124	CTTT	2	8	23620	23627	0 %	75 %	0 %	25 %	409247684
31	NT_187124	AAGA	2	8	23710	23717	75 %	0 %	25 %	0 %	409247684
32	NT_187124	CGCC	2	8	24681	24688	0 %	0 %	25 %	75 %	409247685
33	NT_187124	TGCG	2	8	25082	25089	0 %	25 %	50 %	25 %	409247685
34	NT_187124	CAAT	2	8	25997	26004	50 %	25 %	0 %	25 %	409247686
35	NT_187124	TTTC	2	8	26999	27006	0 %	75 %	0 %	25 %	409247688
36	NT_187124	AACA	2	8	27371	27378	75 %	0 %	0 %	25 %	409247688
37	NT_187124	CAGC	2	8	27607	27614	25 %	0 %	25 %	50 %	409247688
38	NT_187124	ATAA	2	8	28520	28527	75 %	25 %	0 %	0 %	409247689
39	NT_187124	TGCC	2	8	28555	28562	0 %	25 %	25 %	50 %	409247689
40	NT_187124	CAGG	2	8	28772	28779	25 %	0 %	50 %	25 %	409247689
41	NT_187124	CGCC	2	8	28831	28838	0 %	0 %	25 %	75 %	409247689
42	NT_187124	CGCA	2	8	30503	30510	25 %	0 %	25 %	50 %	409247690
43	NT_187124	GTCG	2	8	30632	30639	0 %	25 %	50 %	25 %	409247690
44	NT_187124	CAGT	2	8	31150	31157	25 %	25 %	25 %	25 %	409247690
45	NT_187124	CTGC	2	8	31369	31376	0 %	25 %	25 %	50 %	409247690
46	NT_187124	CCAG	2	8	31630	31637	25 %	0 %	25 %	50 %	409247690
47	NT_187124	CGGG	2	8	31997	32004	0 %	0 %	75 %	25 %	409247691
48	NT_187124	CTGC	2	8	32209	32216	0 %	25 %	25 %	50 %	409247691
49	NT_187124	GCAG	2	8	32233	32240	25 %	0 %	50 %	25 %	409247691
50	NT_187124	TAAT	2	8	32461	32468	50 %	50 %	0 %	0 %	409247691
51	NT_187124	CTTG	2	8	32879	32886	0 %	50 %	25 %	25 %	409247692
52	NT_187124	CAGC	2	8	33909	33916	25 %	0 %	25 %	50 %	409247692
53	NT_187124	CGGT	2	8	33961	33968	0 %	25 %	50 %	25 %	409247692
54	NT_187124	CCAG	2	8	33977	33984	25 %	0 %	25 %	50 %	409247692
55	NT_187124	CAGC	2	8	34850	34857	25 %	0 %	25 %	50 %	409247693
56	NT_187124	GATC	2	8	35121	35128	25 %	25 %	25 %	25 %	409247694
57	NT_187124	CATC	2	8	35475	35482	25 %	25 %	0 %	50 %	409247694
58	NT_187124	CAAA	2	8	35601	35608	75 %	0 %	0 %	25 %	409247694
59	NT_187124	GAAC	2	8	35612	35619	50 %	0 %	25 %	25 %	409247694
60	NT_187124	CGGG	2	8	36835	36842	0 %	0 %	75 %	25 %	409247695
61	NT_187124	TCTT	2	8	36868	36875	0 %	75 %	0 %	25 %	409247695
62	NT_187124	AGAA	2	8	38373	38380	75 %	0 %	25 %	0 %	409247697
63	NT_187124	GCCA	2	8	38751	38758	25 %	0 %	25 %	50 %	409247698
64	NT_187124	CTTT	2	8	39004	39011	0 %	75 %	0 %	25 %	409247698
65	NT_187124	GAAA	2	8	39182	39189	75 %	0 %	25 %	0 %	409247698
66	NT_187124	CTTG	2	8	39297	39304	0 %	50 %	25 %	25 %	409247698
67	NT_187124	ACCA	2	8	39374	39381	50 %	0 %	0 %	50 %	409247698
68	NT_187124	CGCC	2	8	40150	40157	0 %	0 %	25 %	75 %	409247700
69	NT_187124	GTTG	2	8	41022	41029	0 %	50 %	50 %	0 %	409247701
70	NT_187124	CATC	2	8	41241	41248	25 %	25 %	0 %	50 %	409247701
71	NT_187124	ATCA	2	8	41391	41398	50 %	25 %	0 %	25 %	409247702
72	NT_187124	GGCT	2	8	41910	41917	0 %	25 %	50 %	25 %	409247703
73	NT_187124	GCCC	2	8	42490	42497	0 %	0 %	25 %	75 %	409247703
74	NT_187124	ATGG	2	8	43154	43161	25 %	25 %	50 %	0 %	409247705
75	NT_187124	CAGG	2	8	43274	43281	25 %	0 %	50 %	25 %	409247705
76	NT_187124	CAGC	2	8	44241	44248	25 %	0 %	25 %	50 %	409247706
77	NT_187124	GATT	2	8	44762	44769	25 %	50 %	25 %	0 %	409247707
78	NT_187124	CGCC	2	8	45253	45260	0 %	0 %	25 %	75 %	409247708
79	NT_187124	CGCC	2	8	45316	45323	0 %	0 %	25 %	75 %	409247708
80	NT_187124	AATG	2	8	45352	45359	50 %	25 %	25 %	0 %	409247708
81	NT_187124	CAGC	2	8	45480	45487	25 %	0 %	25 %	50 %	409247708
82	NT_187124	AAGG	2	8	45941	45948	50 %	0 %	50 %	0 %	409247709
83	NT_187124	CGAA	2	8	46798	46805	50 %	0 %	25 %	25 %	409247709
84	NT_187124	CACG	2	8	48032	48039	25 %	0 %	25 %	50 %	409247710
85	NT_187124	GATC	2	8	48194	48201	25 %	25 %	25 %	25 %	409247710
86	NT_187124	TGGT	2	8	48325	48332	0 %	50 %	50 %	0 %	409247710
87	NT_187124	CTTC	2	8	48554	48561	0 %	50 %	0 %	50 %	409247711
88	NT_187124	AAAG	2	8	49159	49166	75 %	0 %	25 %	0 %	409247712
89	NT_187124	ACGC	2	8	49673	49680	25 %	0 %	25 %	50 %	409247712
90	NT_187124	TTTG	2	8	49870	49877	0 %	75 %	25 %	0 %	409247712
91	NT_187124	TATT	2	8	50838	50845	25 %	75 %	0 %	0 %	409247713
92	NT_187124	ATTG	2	8	50852	50859	25 %	50 %	25 %	0 %	409247713
93	NT_187124	CAAT	2	8	51102	51109	50 %	25 %	0 %	25 %	409247713
94	NT_187124	GCCG	2	8	51579	51586	0 %	0 %	50 %	50 %	409247714
95	NT_187124	GGAT	2	8	52504	52511	25 %	25 %	50 %	0 %	409247714
96	NT_187124	TTAA	2	8	52939	52946	50 %	50 %	0 %	0 %	409247715
97	NT_187124	CCAA	2	8	53635	53642	50 %	0 %	0 %	50 %	409247716
98	NT_187124	CGCC	2	8	53759	53766	0 %	0 %	25 %	75 %	409247716
99	NT_187124	TCGT	2	8	53992	53999	0 %	50 %	25 %	25 %	409247717
100	NT_187124	ATCT	2	8	54343	54350	25 %	50 %	0 %	25 %	409247717
101	NT_187124	CCAG	2	8	55059	55066	25 %	0 %	25 %	50 %	409247719
102	NT_187124	ATCG	2	8	55816	55823	25 %	25 %	25 %	25 %	409247719
103	NT_187124	TATC	2	8	56385	56392	25 %	50 %	0 %	25 %	409247720
104	NT_187124	GTGG	2	8	56674	56681	0 %	25 %	75 %	0 %	409247720
105	NT_187124	GACG	2	8	57532	57539	25 %	0 %	50 %	25 %	409247721
106	NT_187124	GATC	2	8	57994	58001	25 %	25 %	25 %	25 %	409247721
107	NT_187124	TGTC	2	8	58489	58496	0 %	50 %	25 %	25 %	409247722
108	NT_187124	GGTC	2	8	58869	58876	0 %	25 %	50 %	25 %	409247722
109	NT_187124	GCAG	2	8	58991	58998	25 %	0 %	50 %	25 %	409247722
110	NT_187124	CAGC	2	8	59106	59113	25 %	0 %	25 %	50 %	409247722
111	NT_187124	TGGC	2	8	59234	59241	0 %	25 %	50 %	25 %	409247722
112	NT_187124	GGTC	2	8	60608	60615	0 %	25 %	50 %	25 %	409247723
113	NT_187124	CAAC	2	8	60746	60753	50 %	0 %	0 %	50 %	409247723
114	NT_187124	TACG	2	8	60829	60836	25 %	25 %	25 %	25 %	409247723
115	NT_187124	GAAT	2	8	61581	61588	50 %	25 %	25 %	0 %	409247724
116	NT_187124	ATTA	2	8	61756	61763	50 %	50 %	0 %	0 %	409247724
117	NT_187124	AGCG	2	8	61829	61836	25 %	0 %	50 %	25 %	409247724
118	NT_187124	TAAT	2	8	62828	62835	50 %	50 %	0 %	0 %	409247725
119	NT_187124	CTTG	2	8	63012	63019	0 %	50 %	25 %	25 %	409247725
120	NT_187124	ATTT	2	8	63583	63590	25 %	75 %	0 %	0 %	409247727
121	NT_187124	AGGT	2	8	64319	64326	25 %	25 %	50 %	0 %	409247728
122	NT_187124	TAAT	2	8	64609	64616	50 %	50 %	0 %	0 %	409247729
123	NT_187124	GTTT	2	8	66437	66444	0 %	75 %	25 %	0 %	409247731
124	NT_187124	TCGA	2	8	66580	66587	25 %	25 %	25 %	25 %	409247731
125	NT_187124	GGCG	2	8	66719	66726	0 %	0 %	75 %	25 %	409247731
126	NT_187124	GTCC	2	8	67175	67182	0 %	25 %	25 %	50 %	409247731
127	NT_187124	GGCT	2	8	67261	67268	0 %	25 %	50 %	25 %	409247731
128	NT_187124	GCGG	2	8	67927	67934	0 %	0 %	75 %	25 %	409247732
129	NT_187124	GGCT	2	8	68818	68825	0 %	25 %	50 %	25 %	409247733
130	NT_187124	ACCC	2	8	69580	69587	25 %	0 %	0 %	75 %	409247735
131	NT_187124	ACGG	2	8	69706	69713	25 %	0 %	50 %	25 %	409247735
132	NT_187124	GCCA	2	8	70365	70372	25 %	0 %	25 %	50 %	409247735
133	NT_187124	GCGG	2	8	70420	70427	0 %	0 %	75 %	25 %	409247735
134	NT_187124	ATCG	2	8	70685	70692	25 %	25 %	25 %	25 %	409247735
135	NT_187124	TGAA	2	8	72152	72159	50 %	25 %	25 %	0 %	409247737
136	NT_187124	GTAT	2	8	72604	72611	25 %	50 %	25 %	0 %	409247738
137	NT_187124	CAAA	2	8	72887	72894	75 %	0 %	0 %	25 %	409247738
138	NT_187124	GCGG	2	8	73044	73051	0 %	0 %	75 %	25 %	409247738
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284	NT_187124	GGGC	2	8	144113	144120	0 %	0 %	75 %	25 %	409247800
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.