MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 217

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187124	CAC	2	6	31	36	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NT_187124	AAG	2	6	65	70	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187124	GGA	2	6	328	333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187124	AAC	2	6	583	588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NT_187124	AGC	2	6	673	678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NT_187124	CAT	2	6	679	684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NT_187124	GTT	2	6	782	787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187124	TGA	2	6	1125	1130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187124	CAA	2	6	1152	1157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NT_187124	GGT	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187124	TTA	2	6	1383	1388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187124	CGG	2	6	1507	1512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NT_187124	ATG	2	6	1583	1588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187124	ACC	2	6	1778	1783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NT_187124	TGG	2	6	1838	1843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187124	TCC	2	6	1864	1869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NT_187124	GGA	2	6	1881	1886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187124	AGG	2	6	1919	1924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187124	GGT	2	6	2001	2006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187124	CGG	2	6	2088	2093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NT_187124	TCA	2	6	2116	2121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NT_187124	CGT	2	6	2196	2201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NT_187124	GAC	3	9	2427	2435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NT_187124	GGC	2	6	2606	2611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NT_187124	GGT	2	6	2620	2625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187124	GAA	2	6	2730	2735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187124	CCG	2	6	2823	2828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NT_187124	GGC	2	6	2832	2837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NT_187124	GCG	2	6	4299	4304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NT_187124	GTA	2	6	4343	4348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187124	GAT	2	6	4356	4361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187124	ATT	2	6	6918	6923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187124	ATG	2	6	6991	6996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187124	AAC	2	6	7023	7028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NT_187124	AAC	2	6	7081	7086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NT_187124	AAT	2	6	7095	7100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187124	ATT	2	6	7106	7111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187124	GTT	2	6	7179	7184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187124	GCG	2	6	7226	7231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NT_187124	TCC	2	6	7246	7251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NT_187124	GCC	2	6	10309	10314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NT_187124	GCG	2	6	10395	10400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NT_187124	GTC	2	6	11058	11063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NT_187124	AGG	2	6	11378	11383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187124	ACA	2	6	11444	11449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NT_187124	TGG	2	6	11502	11507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187124	GGC	2	6	11539	11544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NT_187124	GCC	2	6	12275	12280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NT_187124	AGC	2	6	13978	13983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NT_187124	ATT	2	6	13996	14001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187124	CAG	2	6	16495	16500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NT_187124	TTG	2	6	16571	16576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187124	GCT	2	6	16650	16655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NT_187124	GCT	2	6	16665	16670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NT_187124	GCC	2	6	16723	16728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NT_187124	GCA	2	6	16731	16736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NT_187124	TCG	2	6	16746	16751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NT_187124	CTG	2	6	18235	18240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NT_187124	CAC	2	6	18336	18341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NT_187124	CAC	2	6	18387	18392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NT_187124	GGA	2	6	18472	18477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187124	CGG	2	6	20418	20423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NT_187124	AGG	2	6	26088	26093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187124	AAC	2	6	26132	26137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NT_187124	ATA	2	6	26173	26178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187124	GCC	2	6	26900	26905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NT_187124	CGT	2	6	26933	26938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NT_187124	TTG	2	6	28400	28405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187124	CGG	2	6	35846	35851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NT_187124	TAA	2	6	42712	42717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187124	TGT	2	6	42744	42749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187124	ATG	2	6	42793	42798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187124	GTC	2	6	45910	45915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NT_187124	CAG	2	6	47591	47596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NT_187124	GTT	2	6	49040	49045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187124	TCC	2	6	49094	49099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NT_187124	GAG	2	6	49106	49111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187124	ATA	2	6	51317	51322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187124	TTC	2	6	52686	52691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NT_187124	GGC	2	6	52884	52889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NT_187124	TCA	2	6	52897	52902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NT_187124	GGC	2	6	54582	54587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NT_187124	CTT	2	6	59950	59955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NT_187124	CAA	2	6	60031	60036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NT_187124	CTA	2	6	60069	60074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NT_187124	GTC	2	6	60090	60095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NT_187124	AGG	2	6	60214	60219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187124	TCG	2	6	61085	61090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NT_187124	GGC	2	6	61127	61132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NT_187124	CGG	2	6	61151	61156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NT_187124	TGC	2	6	61210	61215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NT_187124	ATT	2	6	63109	63114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187124	GCC	2	6	63187	63192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NT_187124	ATT	2	6	63437	63442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187124	GTT	2	6	63445	63450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187124	GTT	2	6	63534	63539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187124	TAT	2	6	64413	64418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187124	TGA	2	6	64468	64473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187124	ATT	2	6	64484	64489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187124	TAA	2	6	67390	67395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187124	CTT	2	6	67432	67437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NT_187124	TCA	2	6	67518	67523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NT_187124	AAT	2	6	67686	67691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187124	GAT	2	6	67695	67700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NT_187124	TGA	2	6	68352	68357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187124	AGC	2	6	68384	68389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NT_187124	TCA	2	6	71638	71643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NT_187124	GTT	2	6	71668	71673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NT_187124	ATG	2	6	72305	72310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NT_187124	GCC	2	6	72367	72372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NT_187124	AAT	2	6	73590	73595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NT_187124	CTT	2	6	73617	73622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NT_187124	TTA	2	6	73656	73661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NT_187124	TAC	2	6	73687	73692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NT_187124	AGA	2	6	73697	73702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187124	CAG	2	6	74694	74699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NT_187124	GCC	2	6	75844	75849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NT_187124	TAT	2	6	76982	76987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NT_187124	GGC	2	6	77988	77993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NT_187124	CAT	2	6	78028	78033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NT_187124	CTG	2	6	81469	81474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NT_187124	CGT	2	6	82279	82284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NT_187124	ATC	2	6	85833	85838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NT_187124	ACT	2	6	85894	85899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NT_187124	TTA	2	6	88637	88642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NT_187124	GGT	2	6	88727	88732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NT_187124	ATT	3	9	88820	88828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NT_187124	CTA	2	6	88832	88837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NT_187124	TTA	2	6	88872	88877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NT_187124	TGG	2	6	88930	88935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NT_187124	ATT	2	6	88942	88947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NT_187124	TGG	2	6	88987	88992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NT_187124	GCT	2	6	89086	89091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NT_187124	CGC	2	6	89224	89229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NT_187124	CGG	2	6	89301	89306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NT_187124	GAG	2	6	91532	91537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NT_187124	AAT	2	6	91564	91569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NT_187124	GGC	2	6	92657	92662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NT_187124	AGC	2	6	93558	93563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NT_187124	TGA	2	6	94804	94809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NT_187124	AGG	2	6	94815	94820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.