MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187122	TGTTT	2	10	1698	1707	0 %	80 %	20 %	0 %	409247535
2	NT_187122	GAAAA	2	10	1866	1875	80 %	0 %	20 %	0 %	409247535
3	NT_187122	CCGCG	2	10	4770	4779	0 %	0 %	40 %	60 %	409247538
4	NT_187122	TGGCG	2	10	5390	5399	0 %	20 %	60 %	20 %	409247540
5	NT_187122	ATGCG	2	10	5681	5690	20 %	20 %	40 %	20 %	409247540
6	NT_187122	TTCAT	2	10	6499	6508	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NT_187122	AGTGA	2	10	8065	8074	40 %	20 %	40 %	0 %	409247543
8	NT_187122	AGCGC	2	10	8743	8752	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NT_187122	GCCGG	2	10	11730	11739	0 %	0 %	60 %	40 %	409247547
10	NT_187122	ACCAG	2	10	13538	13547	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NT_187122	GCGCC	2	10	14678	14687	0 %	0 %	40 %	60 %	409247549
12	NT_187122	TTTAA	2	10	14958	14967	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187122	GGCGT	2	10	15247	15256	0 %	20 %	60 %	20 %	409247550
14	NT_187122	GCAAA	2	10	15425	15434	60 %	0 %	20 %	20 %	409247550
15	NT_187122	TTCCG	2	10	18447	18456	0 %	40 %	20 %	40 %	409247552
16	NT_187122	CGCTT	2	10	22565	22574	0 %	40 %	20 %	40 %	409247555
17	NT_187122	TTCAC	2	10	25796	25805	20 %	40 %	0 %	40 %	409247558
18	NT_187122	GCAGC	2	10	26046	26055	20 %	0 %	40 %	40 %	409247558
19	NT_187122	CTGCT	2	10	27492	27501	0 %	40 %	20 %	40 %	409247560
20	NT_187122	TGGCC	2	10	27746	27755	0 %	20 %	40 %	40 %	409247560
21	NT_187122	ATCAG	2	10	27942	27951	40 %	20 %	20 %	20 %	409247561
22	NT_187122	CGCGC	2	10	27957	27966	0 %	0 %	40 %	60 %	409247561
23	NT_187122	TCGAT	2	10	29757	29766	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NT_187122	GAAAC	2	10	29836	29845	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NT_187122	AAGCG	2	10	30641	30650	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NT_187122	AAGTG	2	10	30983	30992	40 %	20 %	40 %	0 %	409247565
27	NT_187122	CACGC	2	10	35626	35635	20 %	0 %	20 %	60 %	409247569
28	NT_187122	TGACG	2	10	41485	41494	20 %	20 %	40 %	20 %	409247573
29	NT_187122	TTCCG	2	10	45261	45270	0 %	40 %	20 %	40 %	409247576
30	NT_187122	CGATG	2	10	46059	46068	20 %	20 %	40 %	20 %	409247577
31	NT_187122	ACGCG	2	10	47475	47484	20 %	0 %	40 %	40 %	409247578
32	NT_187122	AAGCG	2	10	48746	48755	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.