MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187121	CAGGA	2	10	729	738	40 %	0 %	40 %	20 %	409247506
2	NT_187121	ACCGC	2	10	904	913	20 %	0 %	20 %	60 %	409247506
3	NT_187121	ATAAC	2	10	1539	1548	60 %	20 %	0 %	20 %	409247506
4	NT_187121	ATTTT	2	10	1635	1644	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187121	GACCG	2	10	2467	2476	20 %	0 %	40 %	40 %	409247508
6	NT_187121	GCGCC	2	10	4377	4386	0 %	0 %	40 %	60 %	409247508
7	NT_187121	GCCGC	2	10	5662	5671	0 %	0 %	40 %	60 %	409247509
8	NT_187121	CATCG	2	10	5696	5705	20 %	20 %	20 %	40 %	409247509
9	NT_187121	TCACA	2	10	6269	6278	40 %	20 %	0 %	40 %	409247510
10	NT_187121	AAACG	2	10	8990	8999	60 %	0 %	20 %	20 %	409247512
11	NT_187121	CGGTA	2	10	9442	9451	20 %	20 %	40 %	20 %	409247512
12	NT_187121	GAAGC	2	10	9860	9869	40 %	0 %	40 %	20 %	409247512
13	NT_187121	ACGGT	2	10	11249	11258	20 %	20 %	40 %	20 %	409247513
14	NT_187121	TGCTC	2	10	12446	12455	0 %	40 %	20 %	40 %	409247514
15	NT_187121	TTTCA	2	10	13377	13386	20 %	60 %	0 %	20 %	409247514
16	NT_187121	GAGAG	2	10	21476	21485	40 %	0 %	60 %	0 %	409247522
17	NT_187121	GCGCA	2	10	23473	23482	20 %	0 %	40 %	40 %	409247523
18	NT_187121	AGTAA	2	10	23597	23606	60 %	20 %	20 %	0 %	409247523
19	NT_187121	TCCCG	2	10	28032	28041	0 %	20 %	20 %	60 %	409247528
20	NT_187121	CGCAA	2	10	28081	28090	40 %	0 %	20 %	40 %	409247529
21	NT_187121	GCACC	2	10	29034	29043	20 %	0 %	20 %	60 %	409247529
22	NT_187121	AAGCA	2	10	30977	30986	60 %	0 %	20 %	20 %	409247530

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.