MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187120	CGCCAC	2	12	2396	2407	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	409247157
2	NT_187120	GCTACC	2	12	4960	4971	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409247158
3	NT_187120	ATTTCT	2	12	5527	5538	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	409247159
4	NT_187120	CCGATA	2	12	10116	10127	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409247165
5	NT_187120	TACGCG	2	12	10303	10314	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409247165
6	NT_187120	CGTCAG	2	12	14616	14627	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409247169
7	NT_187120	CGCTGG	2	12	17806	17817	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409247172
8	NT_187120	CGCTGA	2	12	19898	19909	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409247176
9	NT_187120	GATATT	2	12	20584	20595	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	409247176
10	NT_187120	ATATTG	2	12	21867	21878	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	409247177
11	NT_187120	GTCTGG	2	12	22089	22100	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	409247177
12	NT_187120	CAGCAA	2	12	24566	24577	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	409247180
13	NT_187120	TCAGCG	2	12	24889	24900	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409247180
14	NT_187120	CCAGCC	2	12	27874	27885	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	409247182
15	NT_187120	TCGGCT	2	12	34814	34825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247187
16	NT_187120	GTGAAG	2	12	36632	36643	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	409247190
17	NT_187120	AAAGAT	2	12	43749	43760	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	409247196
18	NT_187120	TGCCGG	2	12	43850	43861	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409247196
19	NT_187120	TGCGCG	2	12	46882	46893	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409247197
20	NT_187120	TGGGCG	2	12	48114	48125	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	409247197
21	NT_187120	GACCTC	2	12	54571	54582	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409247202
22	NT_187120	TTTCCC	2	12	61343	61354	0 %	50 %	0 %	50 %	409247208
23	NT_187120	AAGATA	2	12	62066	62077	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	409247209
24	NT_187120	GCCAGC	2	12	62714	62725	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409247209
25	NT_187120	CCATCG	2	12	64222	64233	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409247210
26	NT_187120	ACATCA	2	12	72120	72131	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	409247215
27	NT_187120	CTGTCG	2	12	76141	76152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247220
28	NT_187120	TTCCGC	2	12	84030	84041	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	409247227
29	NT_187120	CCAGCG	2	12	84545	84556	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409247227
30	NT_187120	ACGGCG	2	12	84784	84795	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409247227
31	NT_187120	CAGCGG	2	12	85453	85464	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409247228
32	NT_187120	TCTTTA	2	12	89579	89590	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	409247233
33	NT_187120	CTTCAT	2	12	96014	96025	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	409247240
34	NT_187120	GCCACC	2	12	96106	96117	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	409247240
35	NT_187120	CTTCGT	2	12	98118	98129	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	409247243
36	NT_187120	GCTAAA	2	12	99608	99619	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	409247244
37	NT_187120	ATCACC	2	12	100702	100713	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	409247245
38	NT_187120	CAATAC	2	12	103523	103534	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	409247249
39	NT_187120	GCCGCT	2	12	104907	104918	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409247252
40	NT_187120	GCCGAC	2	12	105576	105587	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409247253
41	NT_187120	ATCAGA	2	12	108245	108256	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	409247254
42	NT_187120	GGCGAT	2	12	115653	115664	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409247263
43	NT_187120	CTGGCG	2	12	117968	117979	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409247264
44	NT_187120	TATCGC	2	12	124945	124956	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409247271
45	NT_187120	GCAAAG	2	12	125485	125496	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	409247271
46	NT_187120	CTGATA	2	12	129109	129120	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	409247275
47	NT_187120	CTGGAA	2	12	131960	131971	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409247280
48	NT_187120	GTCGCC	2	12	132167	132178	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409247280
49	NT_187120	ATTTTC	2	12	133347	133358	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	409247282
50	NT_187120	AACGAT	2	12	134013	134024	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	409247283
51	NT_187120	ACCAAA	2	12	134804	134815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247284
52	NT_187120	CGGAGC	2	12	138002	138013	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409247288
53	NT_187120	TGGCGC	2	12	145753	145764	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409247294
54	NT_187120	GCCTGA	2	12	146434	146445	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409247294
55	NT_187120	CCCCAG	2	12	158510	158521	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	409247303
56	NT_187120	GGCGCG	2	12	158720	158731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247303
57	NT_187120	CAGCAC	2	12	165038	165049	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	409247306
58	NT_187120	TTTTCC	2	12	165372	165383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247306
59	NT_187120	GCGGGC	2	12	165556	165567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247306
60	NT_187120	TCTCGT	2	12	172051	172062	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	409247315
61	NT_187120	GCGATA	2	12	173144	173155	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409247316
62	NT_187120	CAAAGG	2	12	176505	176516	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	409247319
63	NT_187120	GTGCTG	2	12	182295	182306	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	409247325
64	NT_187120	TGGCGC	2	12	190469	190480	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409247332
65	NT_187120	TAAAAA	2	12	193671	193682	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	409247337
66	NT_187120	CGGCAG	2	12	195986	195997	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409247339
67	NT_187120	CTGAAC	2	12	204810	204821	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409247347
68	NT_187120	CAGCCG	2	12	206349	206360	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409247347
69	NT_187120	GGCGCT	2	12	207994	208005	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409247350
70	NT_187120	CCGTGG	2	12	208279	208290	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409247350
71	NT_187120	ATGTCG	2	12	210110	210121	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409247352
72	NT_187120	GAAGAG	2	12	211158	211169	50 %	0 %	50 %	0 %	409247354
73	NT_187120	CCTGTT	2	12	215169	215180	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	409247358
74	NT_187120	CGAGTA	2	12	218336	218347	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409247361
75	NT_187120	CGATAT	2	12	222542	222553	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	409247364
76	NT_187120	GGCGCT	2	12	224351	224362	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409247365
77	NT_187120	CGCAGG	2	12	234177	234188	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409247372
78	NT_187120	GAAAAA	2	12	235518	235529	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	409247375
79	NT_187120	GTTCCT	2	12	236954	236965	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	409247376
80	NT_187120	ATCGCC	2	12	237549	237560	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409247376
81	NT_187120	CCGTCT	2	12	238784	238795	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	409247378
82	NT_187120	CGCGCC	2	12	244452	244463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247384
83	NT_187120	GATAGC	2	12	244881	244892	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409247384
84	NT_187120	GGCTAC	2	12	247735	247746	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409247389
85	NT_187120	TTCCGG	2	12	253771	253782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247393
86	NT_187120	ATAGCG	2	12	254584	254595	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409247394
87	NT_187120	ATTTTT	2	12	269249	269260	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	409247408
88	NT_187120	GGTCAC	2	12	270594	270605	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409247410
89	NT_187120	CTTTAA	2	12	271050	271061	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	409247410
90	NT_187120	TGGCGC	2	12	271435	271446	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409247411
91	NT_187120	GAAGGC	2	12	276380	276391	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	409247418
92	NT_187120	ACCGCC	2	12	281307	281318	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	409247424
93	NT_187120	CCAGCG	2	12	287325	287336	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409247430
94	NT_187120	TGCCAC	2	12	289854	289865	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409247432
95	NT_187120	GCTGAT	2	12	292976	292987	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409247435
96	NT_187120	TTCGAT	2	12	299707	299718	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	409247440
97	NT_187120	GTGTTC	2	12	302640	302651	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	409247442
98	NT_187120	CGATGA	2	12	306394	306405	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409247449
99	NT_187120	ATGCCG	2	12	311904	311915	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409247454
100	NT_187120	CCGTTA	2	12	313039	313050	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409247455
101	NT_187120	CAGCGG	2	12	313598	313609	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409247456
102	NT_187120	GGCAAT	2	12	321354	321365	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409247461
103	NT_187120	GCGGCT	2	12	323375	323386	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409247464
104	NT_187120	CCGCGC	2	12	333344	333355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247475
105	NT_187120	TGGCAT	2	12	335559	335570	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409247477
106	NT_187120	CCGTAA	2	12	338446	338457	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409247479
107	NT_187120	ATATGC	2	12	350406	350417	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	409247491
108	NT_187120	CGGCAA	2	12	356464	356475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247501
109	NT_187120	CTTTGG	2	12	356538	356549	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	409247501

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.