MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187120	AGGCA	2	10	12546	12555	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NT_187120	GCGCT	2	10	23880	23889	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NT_187120	GCGCT	2	10	41235	41244	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NT_187120	AGTGA	2	10	46359	46368	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187120	CGCTT	2	10	49094	49103	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NT_187120	CGCGC	2	10	52337	52346	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NT_187120	CCATG	2	10	53936	53945	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NT_187120	AGCGC	2	10	89190	89199	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NT_187120	ACATG	2	10	90596	90605	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NT_187120	GAAAA	2	10	90689	90698	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187120	TGTTT	2	10	96389	96398	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187120	AAGCG	2	10	98668	98677	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NT_187120	ACTTA	2	10	103145	103154	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NT_187120	TTAAT	2	10	142625	142634	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187120	CTCAT	2	10	145136	145145	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NT_187120	GCGCT	2	10	150851	150860	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NT_187120	GCGCT	2	10	156157	156166	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NT_187120	GCGCT	2	10	176690	176699	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NT_187120	GGTCA	2	10	178427	178436	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NT_187120	TCGCT	2	10	182613	182622	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NT_187120	TAAAA	2	10	192538	192547	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187120	TAGCG	2	10	203318	203327	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NT_187120	AAGCG	2	10	221896	221905	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NT_187120	AGCGC	2	10	221953	221962	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NT_187120	AAGCG	2	10	222008	222017	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NT_187120	AGCGC	2	10	222065	222074	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NT_187120	ATTTA	2	10	224916	224925	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187120	CTACA	2	10	230919	230928	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NT_187120	TCTTT	2	10	235241	235250	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NT_187120	ATTAA	2	10	235871	235880	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187120	TTAAA	2	10	261666	261675	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187120	GAAAG	2	10	299416	299425	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187120	TGAAA	2	10	305825	305834	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187120	TTTTA	2	10	316364	316373	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187120	AGGTG	2	10	334000	334009	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187120	GCAAG	2	10	355658	355667	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NT_187120	GCGCC	2	10	358591	358600	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.