MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187119	TAAGG	2	10	946	955	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187119	TTTTC	2	10	5216	5225	0 %	80 %	0 %	20 %	409247115
3	NT_187119	TCGCC	2	10	7229	7238	0 %	20 %	20 %	60 %	409247117
4	NT_187119	GCCCA	2	10	8089	8098	20 %	0 %	20 %	60 %	409247119
5	NT_187119	GGCGC	3	15	8298	8312	0 %	0 %	60 %	40 %	409247119
6	NT_187119	TTTTA	2	10	8930	8939	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187119	TTGGC	2	10	9505	9514	0 %	40 %	40 %	20 %	409247120
8	NT_187119	GCGCC	2	10	9705	9714	0 %	0 %	40 %	60 %	409247120
9	NT_187119	GATCA	2	10	10094	10103	40 %	20 %	20 %	20 %	409247120
10	NT_187119	GCTAA	2	10	10214	10223	40 %	20 %	20 %	20 %	409247120
11	NT_187119	TTACG	2	10	11949	11958	20 %	40 %	20 %	20 %	409247122
12	NT_187119	GGATC	2	10	14019	14028	20 %	20 %	40 %	20 %	409247126
13	NT_187119	TCGGC	2	10	16387	16396	0 %	20 %	40 %	40 %	409247130
14	NT_187119	TGACG	2	10	20452	20461	20 %	20 %	40 %	20 %	409247138
15	NT_187119	TTCAG	2	10	20548	20557	20 %	40 %	20 %	20 %	409247138
16	NT_187119	ACGCC	2	10	24463	24472	20 %	0 %	20 %	60 %	409247148
17	NT_187119	GTGCG	2	10	25385	25394	0 %	20 %	60 %	20 %	409247149
18	NT_187119	AAATA	2	10	28144	28153	80 %	20 %	0 %	0 %	409247154
19	NT_187119	TCATC	2	10	28179	28188	20 %	40 %	0 %	40 %	409247154
20	NT_187119	TTCAA	2	10	28760	28769	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.