MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187119	GGA	2	6	175	180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187119	CTC	2	6	330	335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NT_187119	TCA	2	6	623	628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NT_187119	AAC	2	6	658	663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NT_187119	GTT	2	6	668	673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187119	CCG	2	6	821	826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NT_187119	TCA	2	6	905	910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NT_187119	ACG	2	6	1195	1200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NT_187119	ATG	2	6	1288	1293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187119	TCC	2	6	1314	1319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NT_187119	CAA	2	6	1366	1371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NT_187119	GAC	2	6	1427	1432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NT_187119	GCA	2	6	1439	1444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NT_187119	TTC	2	6	1515	1520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NT_187119	GCC	2	6	1758	1763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NT_187119	TCC	2	6	1778	1783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NT_187119	GCT	2	6	1968	1973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NT_187119	CTT	2	6	1993	1998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NT_187119	TTA	2	6	2024	2029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187119	TCC	2	6	2042	2047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NT_187119	CTT	2	6	2077	2082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NT_187119	CTG	2	6	2136	2141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NT_187119	TCG	2	6	2211	2216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NT_187119	CAA	2	6	2239	2244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NT_187119	AGT	2	6	2336	2341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187119	AGC	2	6	2402	2407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NT_187119	GCT	2	6	2410	2415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NT_187119	GCC	2	6	2450	2455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NT_187119	CCG	2	6	2765	2770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NT_187119	ATG	2	6	2953	2958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187119	GCA	2	6	5704	5709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NT_187119	TAA	2	6	7381	7386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187119	CCG	2	6	12434	12439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NT_187119	ATT	2	6	13288	13293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187119	AGG	2	6	13311	13316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187119	CCG	2	6	13329	13334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NT_187119	TAC	2	6	13353	13358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NT_187119	CTA	2	6	16227	16232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NT_187119	TAC	2	6	21187	21192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NT_187119	ACT	3	9	21917	21925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NT_187119	TCC	2	6	23983	23988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NT_187119	CTC	2	6	25117	25122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NT_187119	ATT	2	6	27031	27036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187119	CTC	2	6	27056	27061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NT_187119	CAA	2	6	28733	28738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.