MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187118	TGTTC	2	10	308	317	0 %	60 %	20 %	20 %	409247065
2	NT_187118	TAAGG	2	10	3031	3040	40 %	20 %	40 %	0 %	409247067
3	NT_187118	ATCGG	2	10	6962	6971	20 %	20 %	40 %	20 %	409247073
4	NT_187118	CTGGC	2	10	12830	12839	0 %	20 %	40 %	40 %	409247081
5	NT_187118	GACCG	2	10	13988	13997	20 %	0 %	40 %	40 %	409247082
6	NT_187118	CTTTG	2	10	16307	16316	0 %	60 %	20 %	20 %	409247082
7	NT_187118	AGGTC	2	10	17404	17413	20 %	20 %	40 %	20 %	409247082
8	NT_187118	ACTAC	2	10	19973	19982	40 %	20 %	0 %	40 %	409247085
9	NT_187118	CAGTA	2	10	20255	20264	40 %	20 %	20 %	20 %	409247085
10	NT_187118	TCGCA	2	10	20915	20924	20 %	20 %	20 %	40 %	409247086
11	NT_187118	AAATA	2	10	21290	21299	80 %	20 %	0 %	0 %	409247086
12	NT_187118	CCGCG	2	10	23687	23696	0 %	0 %	40 %	60 %	409247088
13	NT_187118	AACCG	2	10	26416	26425	40 %	0 %	20 %	40 %	409247090
14	NT_187118	TCGCT	2	10	27054	27063	0 %	40 %	20 %	40 %	409247090
15	NT_187118	GCGTT	2	10	27659	27668	0 %	40 %	40 %	20 %	409247091
16	NT_187118	TGCTG	2	10	30204	30213	0 %	40 %	40 %	20 %	409247095
17	NT_187118	CTGGG	2	10	30480	30489	0 %	20 %	60 %	20 %	409247096
18	NT_187118	ATTAC	2	10	31377	31386	40 %	40 %	0 %	20 %	409247096
19	NT_187118	TGCCA	2	10	31720	31729	20 %	20 %	20 %	40 %	409247097
20	NT_187118	CTGGC	2	10	34821	34830	0 %	20 %	40 %	40 %	409247100
21	NT_187118	CGCAC	2	10	36643	36652	20 %	0 %	20 %	60 %	409247102
22	NT_187118	CTATT	2	10	39022	39031	20 %	60 %	0 %	20 %	409247104
23	NT_187118	TCACC	2	10	39621	39630	20 %	20 %	0 %	60 %	409247105
24	NT_187118	AAATA	2	10	44174	44183	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.