MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 171

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187115	ACCTT	2	10	1305	1314	20 %	40 %	0 %	40 %	409246496
2	NT_187115	CTGCG	2	10	1472	1481	0 %	20 %	40 %	40 %	409246496
3	NT_187115	GCGCG	2	10	2067	2076	0 %	0 %	60 %	40 %	409246496
4	NT_187115	CGGCG	2	10	4889	4898	0 %	0 %	60 %	40 %	409246498
5	NT_187115	CCGGC	2	10	5911	5920	0 %	0 %	40 %	60 %	409246499
6	NT_187115	TTTTG	2	10	6933	6942	0 %	80 %	20 %	0 %	409246500
7	NT_187115	CGCTG	2	10	8827	8836	0 %	20 %	40 %	40 %	409246502
8	NT_187115	GGAAT	2	10	15161	15170	40 %	20 %	40 %	0 %	409246509
9	NT_187115	CTGGT	2	10	15781	15790	0 %	40 %	40 %	20 %	409246509
10	NT_187115	ATGCA	2	10	16086	16095	40 %	20 %	20 %	20 %	409246509
11	NT_187115	GCGCG	2	10	22012	22021	0 %	0 %	60 %	40 %	409246515
12	NT_187115	CAGGC	2	10	24469	24478	20 %	0 %	40 %	40 %	409246518
13	NT_187115	GCCGC	2	10	26513	26522	0 %	0 %	40 %	60 %	409246520
14	NT_187115	GCGCG	2	10	26782	26791	0 %	0 %	60 %	40 %	409246520
15	NT_187115	GCCAA	2	10	26852	26861	40 %	0 %	20 %	40 %	409246520
16	NT_187115	CAAAG	2	10	29160	29169	60 %	0 %	20 %	20 %	409246523
17	NT_187115	TTTTG	2	10	29673	29682	0 %	80 %	20 %	0 %	409246524
18	NT_187115	GTGAA	2	10	30735	30744	40 %	20 %	40 %	0 %	409246525
19	NT_187115	ACCCG	2	10	31501	31510	20 %	0 %	20 %	60 %	409246527
20	NT_187115	GGGCT	2	10	31527	31536	0 %	20 %	60 %	20 %	409246527
21	NT_187115	GCGCG	2	10	32623	32632	0 %	0 %	60 %	40 %	409246528
22	NT_187115	AGCGA	2	10	34597	34606	40 %	0 %	40 %	20 %	409246529
23	NT_187115	GCGCG	2	10	34806	34815	0 %	0 %	60 %	40 %	409246529
24	NT_187115	GGCGC	2	10	35437	35446	0 %	0 %	60 %	40 %	409246529
25	NT_187115	GACGC	2	10	39338	39347	20 %	0 %	40 %	40 %	409246534
26	NT_187115	CTGAT	2	10	45004	45013	20 %	40 %	20 %	20 %	409246542
27	NT_187115	TTAAA	2	10	46080	46089	60 %	40 %	0 %	0 %	409246545
28	NT_187115	GCCTG	2	10	46356	46365	0 %	20 %	40 %	40 %	409246545
29	NT_187115	ACGAT	2	10	47775	47784	40 %	20 %	20 %	20 %	409246546
30	NT_187115	AGCTC	2	10	48179	48188	20 %	20 %	20 %	40 %	409246546
31	NT_187115	AGAAA	2	10	49686	49695	80 %	0 %	20 %	0 %	409246547
32	NT_187115	CAAAA	2	10	50281	50290	80 %	0 %	0 %	20 %	409246547
33	NT_187115	GCTTC	2	10	56024	56033	0 %	40 %	20 %	40 %	409246553
34	NT_187115	ATTCA	2	10	56811	56820	40 %	40 %	0 %	20 %	409246554
35	NT_187115	AATGA	2	10	57385	57394	60 %	20 %	20 %	0 %	409246554
36	NT_187115	ACAAA	2	10	64273	64282	80 %	0 %	0 %	20 %	409246562
37	NT_187115	CTTTT	2	10	66133	66142	0 %	80 %	0 %	20 %	409246564
38	NT_187115	TGTTT	2	10	68688	68697	0 %	80 %	20 %	0 %	409246567
39	NT_187115	ATCAA	2	10	68910	68919	60 %	20 %	0 %	20 %	409246567
40	NT_187115	ATTAA	2	10	70217	70226	60 %	40 %	0 %	0 %	409246568
41	NT_187115	GGTTG	2	10	75346	75355	0 %	40 %	60 %	0 %	409246572
42	NT_187115	GAAAA	2	10	78677	78686	80 %	0 %	20 %	0 %	409246576
43	NT_187115	ACGCC	2	10	82534	82543	20 %	0 %	20 %	60 %	409246578
44	NT_187115	TGGGC	2	10	84597	84606	0 %	20 %	60 %	20 %	409246581
45	NT_187115	CGCGC	2	10	84793	84802	0 %	0 %	40 %	60 %	409246581
46	NT_187115	CCTCC	2	10	86786	86795	0 %	20 %	0 %	80 %	409246583
47	NT_187115	TCGCC	2	10	87028	87037	0 %	20 %	20 %	60 %	409246583
48	NT_187115	GGTTT	2	10	87190	87199	0 %	60 %	40 %	0 %	409246583
49	NT_187115	AGCGC	2	10	90589	90598	20 %	0 %	40 %	40 %	409246587
50	NT_187115	GGCGG	2	10	91986	91995	0 %	0 %	80 %	20 %	409246588
51	NT_187115	GCGAC	2	10	92179	92188	20 %	0 %	40 %	40 %	409246588
52	NT_187115	CAACG	2	10	93621	93630	40 %	0 %	20 %	40 %	409246591
53	NT_187115	CGATC	2	10	94134	94143	20 %	20 %	20 %	40 %	409246591
54	NT_187115	CTATC	2	10	94221	94230	20 %	40 %	0 %	40 %	409246591
55	NT_187115	GTGCG	2	10	95680	95689	0 %	20 %	60 %	20 %	409246593
56	NT_187115	TGCTG	2	10	96869	96878	0 %	40 %	40 %	20 %	409246594
57	NT_187115	CCGGC	2	10	98349	98358	0 %	0 %	40 %	60 %	409246596
58	NT_187115	CGAAG	2	10	98825	98834	40 %	0 %	40 %	20 %	409246596
59	NT_187115	CAGCG	2	10	99477	99486	20 %	0 %	40 %	40 %	409246597
60	NT_187115	AGAGA	2	10	103937	103946	60 %	0 %	40 %	0 %	409246603
61	NT_187115	CAGGC	2	10	109551	109560	20 %	0 %	40 %	40 %	409246615
62	NT_187115	ACCGA	2	10	110157	110166	40 %	0 %	20 %	40 %	409246615
63	NT_187115	ATTGA	2	10	111123	111132	40 %	40 %	20 %	0 %	409246617
64	NT_187115	CTGTT	2	10	111935	111944	0 %	60 %	20 %	20 %	409246618
65	NT_187115	GCTTT	2	10	113335	113344	0 %	60 %	20 %	20 %	409246620
66	NT_187115	CTGGT	2	10	114205	114214	0 %	40 %	40 %	20 %	409246620
67	NT_187115	AAAGC	2	10	116144	116153	60 %	0 %	20 %	20 %	409246621
68	NT_187115	CTACG	2	10	116328	116337	20 %	20 %	20 %	40 %	409246621
69	NT_187115	CCAGT	2	10	117275	117284	20 %	20 %	20 %	40 %	409246621
70	NT_187115	AATAA	2	10	117787	117796	80 %	20 %	0 %	0 %	409246621
71	NT_187115	AGCAA	2	10	117849	117858	60 %	0 %	20 %	20 %	409246621
72	NT_187115	TGGCG	2	10	121694	121703	0 %	20 %	60 %	20 %	409246624
73	NT_187115	CTTGT	2	10	122138	122147	0 %	60 %	20 %	20 %	409246625
74	NT_187115	AACGC	2	10	127005	127014	40 %	0 %	20 %	40 %	409246631
75	NT_187115	GAGCA	2	10	127373	127382	40 %	0 %	40 %	20 %	409246632
76	NT_187115	CGCGT	2	10	127976	127985	0 %	20 %	40 %	40 %	409246634
77	NT_187115	GTTCA	2	10	129592	129601	20 %	40 %	20 %	20 %	409246635
78	NT_187115	AGGTA	2	10	131187	131196	40 %	20 %	40 %	0 %	409246636
79	NT_187115	GGCGC	2	10	136466	136475	0 %	0 %	60 %	40 %	409246639
80	NT_187115	ACCGC	2	10	136568	136577	20 %	0 %	20 %	60 %	409246639
81	NT_187115	CAGGC	2	10	138970	138979	20 %	0 %	40 %	40 %	409246643
82	NT_187115	TACCC	2	10	139516	139525	20 %	20 %	0 %	60 %	409246644
83	NT_187115	CAATC	2	10	139539	139548	40 %	20 %	0 %	40 %	409246644
84	NT_187115	TCACT	2	10	141078	141087	20 %	40 %	0 %	40 %	409246646
85	NT_187115	CCACG	2	10	143381	143390	20 %	0 %	20 %	60 %	409246647
86	NT_187115	GCCGC	2	10	148160	148169	0 %	0 %	40 %	60 %	409246650
87	NT_187115	CTTCG	2	10	149894	149903	0 %	40 %	20 %	40 %	409246651
88	NT_187115	AGCGA	2	10	149923	149932	40 %	0 %	40 %	20 %	409246651
89	NT_187115	GCCCA	2	10	151931	151940	20 %	0 %	20 %	60 %	409246653
90	NT_187115	TTTGC	2	10	153145	153154	0 %	60 %	20 %	20 %	409246654
91	NT_187115	GAAAT	2	10	153293	153302	60 %	20 %	20 %	0 %	409246654
92	NT_187115	AAAGT	2	10	153528	153537	60 %	20 %	20 %	0 %	409246655
93	NT_187115	TTAAT	2	10	156581	156590	40 %	60 %	0 %	0 %	409246659
94	NT_187115	CGTCG	2	10	157791	157800	0 %	20 %	40 %	40 %	409246660
95	NT_187115	ACGGC	2	10	159307	159316	20 %	0 %	40 %	40 %	409246661
96	NT_187115	CGGCG	2	10	159782	159791	0 %	0 %	60 %	40 %	409246661
97	NT_187115	CGTAC	2	10	161064	161073	20 %	20 %	20 %	40 %	409246662
98	NT_187115	AGCAA	2	10	165369	165378	60 %	0 %	20 %	20 %	409246666
99	NT_187115	GGACA	2	10	166448	166457	40 %	0 %	40 %	20 %	409246666
100	NT_187115	GCGCC	2	10	168180	168189	0 %	0 %	40 %	60 %	409246667
101	NT_187115	CTGGT	2	10	168961	168970	0 %	40 %	40 %	20 %	409246668
102	NT_187115	CGCGC	2	10	169642	169651	0 %	0 %	40 %	60 %	409246668
103	NT_187115	TCCAT	2	10	170644	170653	20 %	40 %	0 %	40 %	409246670
104	NT_187115	GCCCA	2	10	172361	172370	20 %	0 %	20 %	60 %	409246672
105	NT_187115	GCGCT	2	10	175251	175260	0 %	20 %	40 %	40 %	409246675
106	NT_187115	CCGGG	2	10	175459	175468	0 %	0 %	60 %	40 %	409246675
107	NT_187115	AGCGA	2	10	176017	176026	40 %	0 %	40 %	20 %	409246676
108	NT_187115	CTGCT	2	10	177117	177126	0 %	40 %	20 %	40 %	409246678
109	NT_187115	ACGCA	2	10	177864	177873	40 %	0 %	20 %	40 %	409246679
110	NT_187115	CCAGG	2	10	178798	178807	20 %	0 %	40 %	40 %	409246680
111	NT_187115	GTTTT	2	10	180698	180707	0 %	80 %	20 %	0 %	409246681
112	NT_187115	GTTCT	2	10	181910	181919	0 %	60 %	20 %	20 %	409246682
113	NT_187115	GCGCG	2	10	182042	182051	0 %	0 %	60 %	40 %	409246682
114	NT_187115	GGCTG	2	10	182984	182993	0 %	20 %	60 %	20 %	409246683
115	NT_187115	ACCAG	2	10	185842	185851	40 %	0 %	20 %	40 %	409246684
116	NT_187115	GCTGA	2	10	189231	189240	20 %	20 %	40 %	20 %	409246685
117	NT_187115	ACGTA	2	10	189843	189852	40 %	20 %	20 %	20 %	409246685
118	NT_187115	ATCGG	2	10	189955	189964	20 %	20 %	40 %	20 %	409246685
119	NT_187115	CGGAT	2	10	190801	190810	20 %	20 %	40 %	20 %	409246686
120	NT_187115	GGTAT	2	10	195516	195525	20 %	40 %	40 %	0 %	409246690
121	NT_187115	TGCCC	2	10	195911	195920	0 %	20 %	20 %	60 %	409246691
122	NT_187115	TGTAC	2	10	197365	197374	20 %	40 %	20 %	20 %	409246694
123	NT_187115	CTGAA	2	10	199663	199672	40 %	20 %	20 %	20 %	409246695
124	NT_187115	GGCGT	2	10	205565	205574	0 %	20 %	60 %	20 %	409246702
125	NT_187115	CCGCC	2	10	213350	213359	0 %	0 %	20 %	80 %	409246707
126	NT_187115	CGGCG	2	10	214894	214903	0 %	0 %	60 %	40 %	409246709
127	NT_187115	CGAGC	2	10	215360	215369	20 %	0 %	40 %	40 %	409246709
128	NT_187115	ATGGC	2	10	217089	217098	20 %	20 %	40 %	20 %	409246712
129	NT_187115	GGCCG	2	10	219632	219641	0 %	0 %	60 %	40 %	409246715
130	NT_187115	CCGCG	2	10	222359	222368	0 %	0 %	40 %	60 %	409246718
131	NT_187115	GGCGA	2	10	222953	222962	20 %	0 %	60 %	20 %	409246719
132	NT_187115	TGGTC	2	10	223449	223458	0 %	40 %	40 %	20 %	409246719
133	NT_187115	AACAG	2	10	224334	224343	60 %	0 %	20 %	20 %	409246720
134	NT_187115	GCCGG	2	10	224446	224455	0 %	0 %	60 %	40 %	409246720
135	NT_187115	AAAGA	2	10	226087	226096	80 %	0 %	20 %	0 %	409246722
136	NT_187115	GCCAC	2	10	226352	226361	20 %	0 %	20 %	60 %	409246723
137	NT_187115	CTGCA	2	10	226988	226997	20 %	20 %	20 %	40 %	409246724
138	NT_187115	CATGC	2	10	227964	227973	20 %	20 %	20 %	40 %	409246724
139	NT_187115	GTACC	2	10	229040	229049	20 %	20 %	20 %	40 %	409246725
140	NT_187115	CGCGT	2	10	229178	229187	0 %	20 %	40 %	40 %	409246725
141	NT_187115	CATGG	2	10	229415	229424	20 %	20 %	40 %	20 %	409246725
142	NT_187115	AACGG	2	10	229940	229949	40 %	0 %	40 %	20 %	409246726
143	NT_187115	GTAAT	2	10	234496	234505	40 %	40 %	20 %	0 %	409246733
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146	NT_187115	ACGCC	2	10	239831	239840	20 %	0 %	20 %	60 %	409246737
147	NT_187115	CCAAT	2	10	245326	245335	40 %	20 %	0 %	40 %	409246745
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153	NT_187115	TACCG	2	10	260508	260517	20 %	20 %	20 %	40 %	409246760
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159	NT_187115	GCTCA	2	10	266671	266680	20 %	20 %	20 %	40 %	409246766
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163	NT_187115	AAAAC	2	10	276465	276474	80 %	0 %	0 %	20 %	409246777
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165	NT_187115	AAAAT	2	10	278658	278667	80 %	20 %	0 %	0 %	409246780
166	NT_187115	CAACC	2	10	286648	286657	40 %	0 %	0 %	60 %	409246788
167	NT_187115	CAGGC	2	10	295134	295143	20 %	0 %	40 %	40 %	409246797
168	NT_187115	CCGCC	2	10	296628	296637	0 %	0 %	20 %	80 %	409246800
169	NT_187115	CTGGC	2	10	297227	297236	0 %	20 %	40 %	40 %	409246801
170	NT_187115	GTTCG	2	10	298005	298014	0 %	40 %	40 %	20 %	409246802
171	NT_187115	CGTGA	2	10	298294	298303	20 %	20 %	40 %	20 %	409246802

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.