MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187115	ACTT	2	8	160	167	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NT_187115	GCGA	2	8	638	645	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NT_187115	AACG	2	8	1094	1101	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NT_187115	TTAT	2	8	6345	6352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187115	AAAC	2	8	6470	6477	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NT_187115	GCAG	2	8	6646	6653	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NT_187115	TGAA	2	8	14792	14799	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187115	AGCC	2	8	20580	20587	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NT_187115	TATT	2	8	35955	35962	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187115	GGCA	2	8	39619	39626	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NT_187115	ATGT	2	8	41704	41711	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187115	AAAG	2	8	49014	49021	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187115	GTTA	2	8	49359	49366	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187115	TTAA	2	8	68129	68136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187115	AATT	2	8	73995	74002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187115	GAAT	2	8	74971	74978	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187115	GAAA	2	8	75524	75531	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187115	ATTT	2	8	75553	75560	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187115	GAAC	2	8	75711	75718	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NT_187115	TTTC	2	8	76230	76237	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NT_187115	ATCA	2	8	76839	76846	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NT_187115	TTAA	2	8	78362	78369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187115	CCCT	2	8	79195	79202	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NT_187115	AATA	2	8	79229	79236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187115	CGGA	2	8	85269	85276	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NT_187115	AAAG	2	8	91546	91553	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187115	ACGA	2	8	92898	92905	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NT_187115	TGAA	2	8	105109	105116	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187115	AATA	2	8	107291	107298	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187115	ATTA	2	8	114950	114957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187115	TGTT	2	8	115124	115131	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187115	ACCA	2	8	118228	118235	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NT_187115	CTGC	2	8	119356	119363	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NT_187115	ATTG	2	8	124016	124023	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187115	AATT	2	8	124053	124060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187115	CGGT	2	8	127144	127151	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NT_187115	ATGG	2	8	127848	127855	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187115	GGGA	2	8	131852	131859	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187115	CCCA	2	8	133022	133029	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NT_187115	ACAT	2	8	133141	133148	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NT_187115	AAAT	2	8	133150	133157	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187115	TTAA	2	8	133342	133349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187115	TAGG	2	8	133987	133994	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187115	ACTA	2	8	139163	139170	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NT_187115	GGCA	2	8	140312	140319	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NT_187115	AATA	2	8	140515	140522	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187115	AATG	2	8	140530	140537	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187115	GCAA	2	8	153477	153484	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NT_187115	AATT	2	8	164916	164923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187115	GAAA	2	8	165236	165243	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187115	ACCG	2	8	165280	165287	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NT_187115	GAAT	2	8	173657	173664	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187115	CTGT	2	8	173918	173925	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NT_187115	TAAA	2	8	176242	176249	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187115	GACG	2	8	179612	179619	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NT_187115	CAAC	2	8	179689	179696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NT_187115	CAAT	2	8	208641	208648	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NT_187115	AGAA	2	8	212449	212456	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187115	ATCG	2	8	217695	217702	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NT_187115	ATTT	2	8	217732	217739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187115	TGGT	2	8	217803	217810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187115	TGGC	2	8	218092	218099	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NT_187115	GATG	2	8	220288	220295	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187115	CATC	2	8	220882	220889	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NT_187115	ACAG	2	8	229449	229456	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NT_187115	CGAT	2	8	230340	230347	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NT_187115	ACAG	2	8	230421	230428	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NT_187115	ATGT	2	8	230473	230480	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187115	TAAA	2	8	232128	232135	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187115	ATGG	2	8	232432	232439	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187115	TATT	2	8	232684	232691	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187115	GTAT	2	8	233017	233024	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187115	CTTT	2	8	235247	235254	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NT_187115	GTTC	2	8	238430	238437	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NT_187115	AAAT	2	8	245491	245498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187115	GAAT	2	8	245990	245997	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187115	TAAA	2	8	246008	246015	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187115	TTAT	2	8	248457	248464	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187115	GAGG	2	8	259680	259687	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187115	CCTC	2	8	259692	259699	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
81	NT_187115	CTAA	2	8	266147	266154	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NT_187115	TTAA	2	8	269751	269758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187115	AATA	2	8	278808	278815	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187115	AAAT	2	8	278868	278875	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NT_187115	TGCC	2	8	281106	281113	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NT_187115	ATCA	2	8	282010	282017	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NT_187115	ATCC	2	8	285845	285852	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NT_187115	CTAA	2	8	285943	285950	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NT_187115	TCAG	2	8	287152	287159	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NT_187115	CATT	2	8	287352	287359	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NT_187115	GCCA	2	8	294188	294195	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.