MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 4278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187115	GGA	2	6	86	91	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187115	GGA	2	6	224	229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187115	CAC	2	6	382	387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NT_187115	GAA	2	6	408	413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187115	TCG	2	6	427	432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NT_187115	TGA	2	6	564	569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187115	GCC	2	6	577	582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NT_187115	CAA	2	6	598	603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NT_187115	CTG	2	6	701	706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246495
10	NT_187115	CTT	2	6	757	762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246495
11	NT_187115	CGA	2	6	855	860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246495
12	NT_187115	CAT	2	6	930	935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NT_187115	CGC	2	6	1070	1075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NT_187115	GCG	2	6	1086	1091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NT_187115	ATT	2	6	1108	1113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246496
16	NT_187115	ACC	2	6	1178	1183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246496
17	NT_187115	GAC	2	6	1201	1206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246496
18	NT_187115	CTG	2	6	1226	1231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246496
19	NT_187115	CAA	2	6	1315	1320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246496
20	NT_187115	ATC	2	6	1364	1369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246496
21	NT_187115	GCA	2	6	1381	1386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246496
22	NT_187115	CTG	2	6	1496	1501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246496
23	NT_187115	CAG	2	6	1577	1582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246496
24	NT_187115	ACG	2	6	1658	1663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246496
25	NT_187115	ATA	2	6	1692	1697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246496
26	NT_187115	CCG	2	6	1737	1742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246496
27	NT_187115	CGC	2	6	1832	1837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246496
28	NT_187115	ATG	2	6	1848	1853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246496
29	NT_187115	GCG	2	6	1874	1879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246496
30	NT_187115	GCA	2	6	1957	1962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246496
31	NT_187115	CGC	2	6	2021	2026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246496
32	NT_187115	GTC	2	6	2171	2176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246496
33	NT_187115	ATC	2	6	2391	2396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246496
34	NT_187115	TCG	2	6	2475	2480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246496
35	NT_187115	CCG	2	6	2509	2514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246496
36	NT_187115	TTC	2	6	2597	2602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246496
37	NT_187115	CAG	2	6	2606	2611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246496
38	NT_187115	CTT	2	6	2647	2652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246496
39	NT_187115	CTG	2	6	2681	2686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246496
40	NT_187115	AGA	2	6	2746	2751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246496
41	NT_187115	AAT	2	6	2798	2803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246496
42	NT_187115	GCA	2	6	2809	2814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246496
43	NT_187115	GCA	2	6	2839	2844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246496
44	NT_187115	TTA	2	6	2904	2909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246496
45	NT_187115	TCT	2	6	3129	3134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246496
46	NT_187115	GCC	2	6	3152	3157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246496
47	NT_187115	AGA	2	6	3181	3186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246496
48	NT_187115	ATA	2	6	3276	3281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246496
49	NT_187115	CTT	2	6	3301	3306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246496
50	NT_187115	TCG	3	9	3327	3335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246496
51	NT_187115	CGT	2	6	3421	3426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246496
52	NT_187115	GAA	2	6	3467	3472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246496
53	NT_187115	AAT	2	6	3562	3567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246496
54	NT_187115	ACA	2	6	3625	3630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246496
55	NT_187115	CTG	2	6	3660	3665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246496
56	NT_187115	GCC	2	6	3776	3781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NT_187115	TCG	2	6	3875	3880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NT_187115	TCA	2	6	4264	4269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246497
59	NT_187115	GGC	2	6	4554	4559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NT_187115	CCA	2	6	4575	4580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NT_187115	TGA	2	6	4586	4591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187115	TCT	2	6	4759	4764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246498
63	NT_187115	CAC	2	6	4910	4915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246498
64	NT_187115	ACG	2	6	4970	4975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246498
65	NT_187115	CCG	2	6	5016	5021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246498
66	NT_187115	GTG	2	6	5022	5027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246498
67	NT_187115	TGA	2	6	5074	5079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246498
68	NT_187115	TCA	2	6	5137	5142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246498
69	NT_187115	CGC	2	6	5147	5152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246498
70	NT_187115	CGA	2	6	5464	5469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246498
71	NT_187115	ATG	2	6	5571	5576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246498
72	NT_187115	TGC	2	6	5612	5617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246498
73	NT_187115	TCG	2	6	5640	5645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246498
74	NT_187115	ATT	2	6	5652	5657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246498
75	NT_187115	TTG	2	6	5756	5761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246499
76	NT_187115	CGT	2	6	5783	5788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246499
77	NT_187115	CGC	2	6	5815	5820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246499
78	NT_187115	TTC	2	6	5894	5899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246499
79	NT_187115	GCC	2	6	5903	5908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246499
80	NT_187115	TGC	2	6	6012	6017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246499
81	NT_187115	ATC	2	6	6042	6047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246499
82	NT_187115	GCC	2	6	6137	6142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246499
83	NT_187115	CTG	2	6	6154	6159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246499
84	NT_187115	CAG	2	6	6338	6343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NT_187115	GGC	2	6	6506	6511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NT_187115	GTC	2	6	6547	6552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NT_187115	CGG	2	6	6574	6579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NT_187115	AGA	2	6	6630	6635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187115	ATA	3	9	6673	6681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NT_187115	GCA	2	6	6854	6859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246500
91	NT_187115	TGA	2	6	6871	6876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246500
92	NT_187115	TGC	2	6	6889	6894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246500
93	NT_187115	GCG	2	6	6907	6912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246500
94	NT_187115	AGT	2	6	7022	7027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246500
95	NT_187115	ATA	2	6	7294	7299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246500
96	NT_187115	GAT	2	6	7335	7340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246500
97	NT_187115	CGG	2	6	7344	7349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246500
98	NT_187115	TAA	2	6	7433	7438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246500
99	NT_187115	CGG	2	6	7475	7480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246500
100	NT_187115	GCT	2	6	7562	7567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246500
101	NT_187115	CTG	2	6	7608	7613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246500
102	NT_187115	GTT	2	6	7623	7628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246500
103	NT_187115	CGC	2	6	7637	7642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246500
104	NT_187115	TGC	2	6	7660	7665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246500
105	NT_187115	GCC	2	6	7680	7685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246500
106	NT_187115	CGT	2	6	7698	7703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246500
107	NT_187115	TGC	2	6	7730	7735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246500
108	NT_187115	GCA	2	6	7741	7746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246500
109	NT_187115	ACG	2	6	7779	7784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246500
110	NT_187115	CGC	2	6	7846	7851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NT_187115	TTC	2	6	8135	8140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246501
112	NT_187115	CTG	2	6	8155	8160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246501
113	NT_187115	TCA	2	6	8177	8182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246501
114	NT_187115	CAG	2	6	8194	8199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246501
115	NT_187115	CGG	2	6	8348	8353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246501
116	NT_187115	CCT	2	6	8354	8359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409246501
117	NT_187115	CAC	2	6	8442	8447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246501
118	NT_187115	CTG	2	6	8485	8490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246501
119	NT_187115	CTT	2	6	8508	8513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246501
120	NT_187115	CAC	2	6	8535	8540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246501
121	NT_187115	CGG	2	6	8636	8641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246502
122	NT_187115	GGC	2	6	8646	8651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246502
123	NT_187115	TCG	2	6	8719	8724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246502
124	NT_187115	AAG	2	6	8770	8775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246502
125	NT_187115	CCG	2	6	8781	8786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246502
126	NT_187115	GCG	2	6	8818	8823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246502
127	NT_187115	TTG	2	6	8914	8919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246502
128	NT_187115	AGA	2	6	8945	8950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246502
129	NT_187115	GCT	2	6	9056	9061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246502
130	NT_187115	CCG	2	6	9088	9093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246502
131	NT_187115	CAT	2	6	9185	9190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246502
132	NT_187115	GCT	2	6	9290	9295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246502
133	NT_187115	GGC	2	6	9422	9427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246502
134	NT_187115	ACC	2	6	9608	9613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246503
135	NT_187115	AGG	2	6	9639	9644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409246503
136	NT_187115	CGG	2	6	9687	9692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246503
137	NT_187115	GAA	2	6	9698	9703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246503
138	NT_187115	CGG	2	6	9792	9797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246503
139	NT_187115	AGA	2	6	10032	10037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246504
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142	NT_187115	GCG	2	6	10243	10248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246504
143	NT_187115	TGG	2	6	10301	10306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246504
144	NT_187115	TGA	2	6	10340	10345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246504
145	NT_187115	ATT	2	6	10369	10374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246504
146	NT_187115	GCG	2	6	10429	10434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246504
147	NT_187115	CGG	2	6	10440	10445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246504
148	NT_187115	CTG	2	6	10549	10554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246504
149	NT_187115	CGA	2	6	10587	10592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246504
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151	NT_187115	CGG	2	6	10722	10727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246504
152	NT_187115	CGC	2	6	10787	10792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
153	NT_187115	GGC	2	6	10877	10882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246505
154	NT_187115	CGG	2	6	10954	10959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246505
155	NT_187115	GTG	2	6	10976	10981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246505
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157	NT_187115	TGA	2	6	11028	11033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246505
158	NT_187115	AAT	2	6	11235	11240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NT_187115	GGC	2	6	11255	11260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
160	NT_187115	GAA	2	6	11443	11448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246506
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163	NT_187115	GTG	2	6	11542	11547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246506
164	NT_187115	AGA	2	6	11556	11561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246506
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219	NT_187115	ATA	2	6	14830	14835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246509
220	NT_187115	GCA	2	6	14905	14910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246509
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234	NT_187115	ATG	2	6	15609	15614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246509
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239	NT_187115	GAA	2	6	16044	16049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246509
240	NT_187115	GCC	2	6	16062	16067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246509
241	NT_187115	ACG	2	6	16168	16173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246509
242	NT_187115	ATC	2	6	16259	16264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246510
243	NT_187115	ATT	2	6	16265	16270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246510
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248	NT_187115	GCC	2	6	16585	16590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246510
249	NT_187115	CAG	2	6	16628	16633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246510
250	NT_187115	CGG	3	9	16687	16695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246510
251	NT_187115	CGC	2	6	16762	16767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246510
252	NT_187115	CTG	3	9	16844	16852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246510
253	NT_187115	GTA	2	6	16917	16922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246510
254	NT_187115	GCC	2	6	16943	16948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246510
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256	NT_187115	CGG	2	6	17146	17151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246510
257	NT_187115	CGC	2	6	17157	17162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246510
258	NT_187115	CTG	2	6	17357	17362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246510
259	NT_187115	GCC	2	6	17461	17466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
260	NT_187115	CCG	2	6	17532	17537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246511
261	NT_187115	CGC	2	6	17629	17634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246511
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498	NT_187115	GCG	2	6	32918	32923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246528
499	NT_187115	GCG	2	6	32982	32987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246528
500	NT_187115	GGC	2	6	33079	33084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246528

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