MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 3857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187115	CTG	2	6	701	706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246495
2	NT_187115	CTT	2	6	757	762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246495
3	NT_187115	CGA	2	6	855	860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246495
4	NT_187115	ATT	2	6	1108	1113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246496
5	NT_187115	ACC	2	6	1178	1183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246496
6	NT_187115	GAC	2	6	1201	1206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246496
7	NT_187115	CTG	2	6	1226	1231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246496
8	NT_187115	CAA	2	6	1315	1320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246496
9	NT_187115	ATC	2	6	1364	1369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246496
10	NT_187115	GCA	2	6	1381	1386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246496
11	NT_187115	CTG	2	6	1496	1501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246496
12	NT_187115	CAG	2	6	1577	1582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246496
13	NT_187115	ACG	2	6	1658	1663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246496
14	NT_187115	ATA	2	6	1692	1697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246496
15	NT_187115	CCG	2	6	1737	1742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246496
16	NT_187115	CGC	2	6	1832	1837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246496
17	NT_187115	ATG	2	6	1848	1853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246496
18	NT_187115	GCG	2	6	1874	1879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246496
19	NT_187115	GCA	2	6	1957	1962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246496
20	NT_187115	CGC	2	6	2021	2026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246496
21	NT_187115	GTC	2	6	2171	2176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246496
22	NT_187115	ATC	2	6	2391	2396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246496
23	NT_187115	TCG	2	6	2475	2480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246496
24	NT_187115	CCG	2	6	2509	2514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246496
25	NT_187115	TTC	2	6	2597	2602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246496
26	NT_187115	CAG	2	6	2606	2611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246496
27	NT_187115	CTT	2	6	2647	2652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246496
28	NT_187115	CTG	2	6	2681	2686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246496
29	NT_187115	AGA	2	6	2746	2751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246496
30	NT_187115	AAT	2	6	2798	2803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246496
31	NT_187115	GCA	2	6	2809	2814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246496
32	NT_187115	GCA	2	6	2839	2844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246496
33	NT_187115	TTA	2	6	2904	2909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246496
34	NT_187115	TCT	2	6	3129	3134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246496
35	NT_187115	GCC	2	6	3152	3157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246496
36	NT_187115	AGA	2	6	3181	3186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246496
37	NT_187115	ATA	2	6	3276	3281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246496
38	NT_187115	CTT	2	6	3301	3306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246496
39	NT_187115	TCG	3	9	3327	3335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246496
40	NT_187115	CGT	2	6	3421	3426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246496
41	NT_187115	GAA	2	6	3467	3472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246496
42	NT_187115	AAT	2	6	3562	3567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246496
43	NT_187115	ACA	2	6	3625	3630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246496
44	NT_187115	CTG	2	6	3660	3665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246496
45	NT_187115	TCA	2	6	4264	4269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246497
46	NT_187115	TCT	2	6	4759	4764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246498
47	NT_187115	CAC	2	6	4910	4915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246498
48	NT_187115	ACG	2	6	4970	4975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246498
49	NT_187115	CCG	2	6	5016	5021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246498
50	NT_187115	GTG	2	6	5022	5027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246498
51	NT_187115	TGA	2	6	5074	5079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246498
52	NT_187115	TCA	2	6	5137	5142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246498
53	NT_187115	CGC	2	6	5147	5152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246498
54	NT_187115	CGA	2	6	5464	5469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246498
55	NT_187115	ATG	2	6	5571	5576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246498
56	NT_187115	TGC	2	6	5612	5617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246498
57	NT_187115	TCG	2	6	5640	5645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246498
58	NT_187115	ATT	2	6	5652	5657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246498
59	NT_187115	TTG	2	6	5756	5761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246499
60	NT_187115	CGT	2	6	5783	5788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246499
61	NT_187115	CGC	2	6	5815	5820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246499
62	NT_187115	TTC	2	6	5894	5899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246499
63	NT_187115	GCC	2	6	5903	5908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246499
64	NT_187115	TGC	2	6	6012	6017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246499
65	NT_187115	ATC	2	6	6042	6047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246499
66	NT_187115	GCC	2	6	6137	6142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246499
67	NT_187115	CTG	2	6	6154	6159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246499
68	NT_187115	GCA	2	6	6854	6859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246500
69	NT_187115	TGA	2	6	6871	6876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246500
70	NT_187115	TGC	2	6	6889	6894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246500
71	NT_187115	GCG	2	6	6907	6912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246500
72	NT_187115	AGT	2	6	7022	7027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246500
73	NT_187115	ATA	2	6	7294	7299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246500
74	NT_187115	GAT	2	6	7335	7340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246500
75	NT_187115	CGG	2	6	7344	7349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246500
76	NT_187115	TAA	2	6	7433	7438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246500
77	NT_187115	CGG	2	6	7475	7480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246500
78	NT_187115	GCT	2	6	7562	7567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246500
79	NT_187115	CTG	2	6	7608	7613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246500
80	NT_187115	GTT	2	6	7623	7628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246500
81	NT_187115	CGC	2	6	7637	7642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246500
82	NT_187115	TGC	2	6	7660	7665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246500
83	NT_187115	GCC	2	6	7680	7685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246500
84	NT_187115	CGT	2	6	7698	7703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246500
85	NT_187115	TGC	2	6	7730	7735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246500
86	NT_187115	GCA	2	6	7741	7746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246500
87	NT_187115	ACG	2	6	7779	7784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246500
88	NT_187115	TTC	2	6	8135	8140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246501
89	NT_187115	CTG	2	6	8155	8160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246501
90	NT_187115	TCA	2	6	8177	8182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246501
91	NT_187115	CAG	2	6	8194	8199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246501
92	NT_187115	CGG	2	6	8348	8353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246501
93	NT_187115	CCT	2	6	8354	8359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409246501
94	NT_187115	CAC	2	6	8442	8447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246501
95	NT_187115	CTG	2	6	8485	8490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246501
96	NT_187115	CTT	2	6	8508	8513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246501
97	NT_187115	CAC	2	6	8535	8540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246501
98	NT_187115	CGG	2	6	8636	8641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246502
99	NT_187115	GGC	2	6	8646	8651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246502
100	NT_187115	TCG	2	6	8719	8724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246502
101	NT_187115	AAG	2	6	8770	8775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246502
102	NT_187115	CCG	2	6	8781	8786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246502
103	NT_187115	GCG	2	6	8818	8823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246502
104	NT_187115	TTG	2	6	8914	8919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246502
105	NT_187115	AGA	2	6	8945	8950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246502
106	NT_187115	GCT	2	6	9056	9061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246502
107	NT_187115	CCG	2	6	9088	9093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246502
108	NT_187115	CAT	2	6	9185	9190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246502
109	NT_187115	GCT	2	6	9290	9295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246502
110	NT_187115	GGC	2	6	9422	9427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246502
111	NT_187115	ACC	2	6	9608	9613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246503
112	NT_187115	AGG	2	6	9639	9644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409246503
113	NT_187115	CGG	2	6	9687	9692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246503
114	NT_187115	GAA	2	6	9698	9703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246503
115	NT_187115	CGG	2	6	9792	9797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246503
116	NT_187115	AGA	2	6	10032	10037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246504
117	NT_187115	CCA	2	6	10148	10153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246504
118	NT_187115	CTG	2	6	10213	10218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246504
119	NT_187115	GCG	2	6	10243	10248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246504
120	NT_187115	TGG	2	6	10301	10306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246504
121	NT_187115	TGA	2	6	10340	10345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246504
122	NT_187115	ATT	2	6	10369	10374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246504
123	NT_187115	GCG	2	6	10429	10434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246504
124	NT_187115	CGG	2	6	10440	10445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246504
125	NT_187115	CTG	2	6	10549	10554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246504
126	NT_187115	CGA	2	6	10587	10592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246504
127	NT_187115	TGC	2	6	10661	10666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246504
128	NT_187115	CGG	2	6	10722	10727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246504
129	NT_187115	GGC	2	6	10877	10882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246505
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253	NT_187115	ACC	2	6	19049	19054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246511
254	NT_187115	AAT	2	6	19070	19075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246511
255	NT_187115	CCG	2	6	19099	19104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246511
256	NT_187115	GCC	2	6	19113	19118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246511
257	NT_187115	CGC	2	6	19253	19258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246511
258	NT_187115	AAT	2	6	19295	19300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246511
259	NT_187115	TGA	2	6	19330	19335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246511
260	NT_187115	CGC	2	6	19397	19402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246511
261	NT_187115	ACG	2	6	19483	19488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246511
262	NT_187115	GCG	2	6	19516	19521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246511
263	NT_187115	CAG	2	6	19565	19570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246511
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265	NT_187115	CTG	2	6	19622	19627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246511
266	NT_187115	AGC	2	6	19870	19875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246512
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268	NT_187115	GGT	2	6	20000	20005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246512
269	NT_187115	TTG	2	6	20020	20025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246512
270	NT_187115	CGC	2	6	20060	20065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246512
271	NT_187115	ACC	2	6	20074	20079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246512
272	NT_187115	ACC	2	6	20086	20091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246512
273	NT_187115	TGA	2	6	20267	20272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246512
274	NT_187115	ACG	2	6	20338	20343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246512
275	NT_187115	ATG	2	6	20392	20397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246512
276	NT_187115	TCA	2	6	20405	20410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246512
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278	NT_187115	GGC	2	6	20950	20955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246513
279	NT_187115	ATG	2	6	20976	20981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246513
280	NT_187115	CTT	2	6	21392	21397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246513
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282	NT_187115	ATA	2	6	21550	21555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246514
283	NT_187115	CGA	2	6	21561	21566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246514
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285	NT_187115	TCA	2	6	21654	21659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246514
286	NT_187115	CGA	2	6	21669	21674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246514
287	NT_187115	ATC	2	6	21676	21681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246514
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289	NT_187115	CGT	2	6	21867	21872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246514
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291	NT_187115	CCT	2	6	21920	21925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409246515
292	NT_187115	TGA	2	6	21951	21956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246515
293	NT_187115	GCA	2	6	21964	21969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246515
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295	NT_187115	TCA	2	6	22026	22031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246515
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299	NT_187115	TCA	2	6	22269	22274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246515
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327	NT_187115	ATC	2	6	23901	23906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246518
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500	NT_187115	CTG	2	6	35473	35478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246529

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