MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187114	TGAC	2	8	668	675	25 %	25 %	25 %	25 %	409246442
2	NT_187114	CCGA	2	8	1471	1478	25 %	0 %	25 %	50 %	409246442
3	NT_187114	CCAT	2	8	2088	2095	25 %	25 %	0 %	50 %	409246443
4	NT_187114	TCGC	2	8	3320	3327	0 %	25 %	25 %	50 %	409246443
5	NT_187114	GCCT	2	8	4040	4047	0 %	25 %	25 %	50 %	409246443
6	NT_187114	CTCA	2	8	4559	4566	25 %	25 %	0 %	50 %	409246443
7	NT_187114	AAAG	2	8	5279	5286	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187114	GCCC	2	8	5375	5382	0 %	0 %	25 %	75 %	409246444
9	NT_187114	CTCG	2	8	5478	5485	0 %	25 %	25 %	50 %	409246444
10	NT_187114	CGTA	2	8	6429	6436	25 %	25 %	25 %	25 %	409246444
11	NT_187114	ATCG	2	8	7046	7053	25 %	25 %	25 %	25 %	409246445
12	NT_187114	GCCC	2	8	7649	7656	0 %	0 %	25 %	75 %	409246446
13	NT_187114	TTGC	2	8	7855	7862	0 %	50 %	25 %	25 %	409246446
14	NT_187114	ATTT	2	8	8538	8545	25 %	75 %	0 %	0 %	409246446
15	NT_187114	AGGA	2	8	8616	8623	50 %	0 %	50 %	0 %	409246446
16	NT_187114	TCAT	2	8	8789	8796	25 %	50 %	0 %	25 %	409246446
17	NT_187114	CCCG	2	8	8904	8911	0 %	0 %	25 %	75 %	409246446
18	NT_187114	TGGT	2	8	9239	9246	0 %	50 %	50 %	0 %	409246446
19	NT_187114	ATTA	2	8	10074	10081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187114	CAGA	2	8	10309	10316	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NT_187114	GGCG	2	8	10504	10511	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NT_187114	CCAG	2	8	11860	11867	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NT_187114	AAAT	2	8	12036	12043	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187114	ACTT	2	8	12109	12116	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NT_187114	TCGC	2	8	12135	12142	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NT_187114	TCAT	2	8	12609	12616	25 %	50 %	0 %	25 %	409246448
27	NT_187114	GTTC	2	8	12709	12716	0 %	50 %	25 %	25 %	409246448
28	NT_187114	GGAA	2	8	12784	12791	50 %	0 %	50 %	0 %	409246448
29	NT_187114	AGAA	2	8	13999	14006	75 %	0 %	25 %	0 %	409246450
30	NT_187114	AAAG	2	8	14527	14534	75 %	0 %	25 %	0 %	409246450
31	NT_187114	ATCA	2	8	15243	15250	50 %	25 %	0 %	25 %	409246452
32	NT_187114	AAGA	2	8	16214	16221	75 %	0 %	25 %	0 %	409246452
33	NT_187114	TTAA	2	8	16283	16290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187114	GCTG	2	8	16981	16988	0 %	25 %	50 %	25 %	409246453
35	NT_187114	GCGG	2	8	17481	17488	0 %	0 %	75 %	25 %	409246453
36	NT_187114	TCAT	2	8	17559	17566	25 %	50 %	0 %	25 %	409246453
37	NT_187114	TCCA	2	8	18294	18301	25 %	25 %	0 %	50 %	409246454
38	NT_187114	CCAG	2	8	18422	18429	25 %	0 %	25 %	50 %	409246454
39	NT_187114	GCCA	2	8	18723	18730	25 %	0 %	25 %	50 %	409246455
40	NT_187114	GCTG	2	8	18968	18975	0 %	25 %	50 %	25 %	409246455
41	NT_187114	CGTG	2	8	19008	19015	0 %	25 %	50 %	25 %	409246455
42	NT_187114	CTGC	2	8	20227	20234	0 %	25 %	25 %	50 %	409246457
43	NT_187114	CTGC	2	8	20993	21000	0 %	25 %	25 %	50 %	409246457
44	NT_187114	ACTG	2	8	21884	21891	25 %	25 %	25 %	25 %	409246458
45	NT_187114	TCTT	2	8	22056	22063	0 %	75 %	0 %	25 %	409246458
46	NT_187114	TGAT	2	8	23945	23952	25 %	50 %	25 %	0 %	409246459
47	NT_187114	TGCG	2	8	24098	24105	0 %	25 %	50 %	25 %	409246459
48	NT_187114	GCCA	2	8	24712	24719	25 %	0 %	25 %	50 %	409246460
49	NT_187114	CGGT	2	8	25118	25125	0 %	25 %	50 %	25 %	409246460
50	NT_187114	TGAT	2	8	25160	25167	25 %	50 %	25 %	0 %	409246460
51	NT_187114	GCGG	2	8	25715	25722	0 %	0 %	75 %	25 %	409246461
52	NT_187114	ATCG	2	8	26435	26442	25 %	25 %	25 %	25 %	409246461
53	NT_187114	CCGG	2	8	26470	26477	0 %	0 %	50 %	50 %	409246461
54	NT_187114	CGGG	2	8	26503	26510	0 %	0 %	75 %	25 %	409246461
55	NT_187114	CACT	2	8	26836	26843	25 %	25 %	0 %	50 %	409246461
56	NT_187114	GGGC	2	8	27077	27084	0 %	0 %	75 %	25 %	409246462
57	NT_187114	ATCG	2	8	27110	27117	25 %	25 %	25 %	25 %	409246462
58	NT_187114	GGCC	2	8	27170	27177	0 %	0 %	50 %	50 %	409246462
59	NT_187114	GCTG	2	8	27236	27243	0 %	25 %	50 %	25 %	409246462
60	NT_187114	CTGG	2	8	27503	27510	0 %	25 %	50 %	25 %	409246462
61	NT_187114	CGCA	2	8	27892	27899	25 %	0 %	25 %	50 %	409246462
62	NT_187114	CTGG	2	8	28265	28272	0 %	25 %	50 %	25 %	409246462
63	NT_187114	GTTA	2	8	28441	28448	25 %	50 %	25 %	0 %	409246462
64	NT_187114	CCGC	2	8	28596	28603	0 %	0 %	25 %	75 %	409246463
65	NT_187114	TTTA	2	8	29525	29532	25 %	75 %	0 %	0 %	409246464
66	NT_187114	TAAT	2	8	29732	29739	50 %	50 %	0 %	0 %	409246465
67	NT_187114	TATG	2	8	30164	30171	25 %	50 %	25 %	0 %	409246466
68	NT_187114	TGAT	2	8	30275	30282	25 %	50 %	25 %	0 %	409246466
69	NT_187114	TGAT	2	8	30446	30453	25 %	50 %	25 %	0 %	409246467
70	NT_187114	GTCA	2	8	30575	30582	25 %	25 %	25 %	25 %	409246467
71	NT_187114	GGCA	2	8	30840	30847	25 %	0 %	50 %	25 %	409246467
72	NT_187114	TCTT	2	8	31542	31549	0 %	75 %	0 %	25 %	409246469
73	NT_187114	ATTA	2	8	31777	31784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NT_187114	CCAT	2	8	31932	31939	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NT_187114	TAAT	2	8	32351	32358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187114	CAAA	2	8	32396	32403	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NT_187114	TAAA	2	8	32433	32440	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187114	ACCA	2	8	32515	32522	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NT_187114	TGAT	2	8	32534	32541	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187114	CAGC	2	8	34298	34305	25 %	0 %	25 %	50 %	409246474
81	NT_187114	GGGC	2	8	34613	34620	0 %	0 %	75 %	25 %	409246474
82	NT_187114	CCAC	2	8	34760	34767	25 %	0 %	0 %	75 %	409246474
83	NT_187114	TGCG	2	8	34951	34958	0 %	25 %	50 %	25 %	409246474
84	NT_187114	TGCC	2	8	35114	35121	0 %	25 %	25 %	50 %	409246474
85	NT_187114	CCAG	2	8	35135	35142	25 %	0 %	25 %	50 %	409246474
86	NT_187114	AAAT	2	8	35525	35532	75 %	25 %	0 %	0 %	409246475
87	NT_187114	AATC	2	8	35962	35969	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NT_187114	GGCG	2	8	36259	36266	0 %	0 %	75 %	25 %	409246477
89	NT_187114	CTGC	2	8	36403	36410	0 %	25 %	25 %	50 %	409246478
90	NT_187114	CCGC	2	8	36866	36873	0 %	0 %	25 %	75 %	409246479
91	NT_187114	GCCA	2	8	36888	36895	25 %	0 %	25 %	50 %	409246479
92	NT_187114	CGGG	2	8	37289	37296	0 %	0 %	75 %	25 %	409246479
93	NT_187114	GGCG	2	8	37367	37374	0 %	0 %	75 %	25 %	409246479
94	NT_187114	GAAA	2	8	37619	37626	75 %	0 %	25 %	0 %	409246479
95	NT_187114	AATT	2	8	37717	37724	50 %	50 %	0 %	0 %	409246479
96	NT_187114	ACCC	2	8	40425	40432	25 %	0 %	0 %	75 %	409246481
97	NT_187114	ACGG	2	8	41477	41484	25 %	0 %	50 %	25 %	409246482
98	NT_187114	GCCC	2	8	41695	41702	0 %	0 %	25 %	75 %	409246482
99	NT_187114	CTGG	2	8	41887	41894	0 %	25 %	50 %	25 %	409246482
100	NT_187114	TGCC	2	8	42081	42088	0 %	25 %	25 %	50 %	409246482
101	NT_187114	CCTG	2	8	42586	42593	0 %	25 %	25 %	50 %	409246483
102	NT_187114	ATCA	2	8	43016	43023	50 %	25 %	0 %	25 %	409246483
103	NT_187114	CGCC	2	8	44060	44067	0 %	0 %	25 %	75 %	409246484
104	NT_187114	CTGG	2	8	44547	44554	0 %	25 %	50 %	25 %	409246484
105	NT_187114	CTTA	2	8	44805	44812	25 %	50 %	0 %	25 %	409246484
106	NT_187114	AGCA	2	8	46379	46386	50 %	0 %	25 %	25 %	409246486
107	NT_187114	CTGG	2	8	46642	46649	0 %	25 %	50 %	25 %	409246486
108	NT_187114	CGCC	2	8	46993	47000	0 %	0 %	25 %	75 %	409246486
109	NT_187114	GCCA	2	8	47081	47088	25 %	0 %	25 %	50 %	409246486
110	NT_187114	ACGA	2	8	47092	47099	50 %	0 %	25 %	25 %	409246486
111	NT_187114	ACGC	2	8	47118	47125	25 %	0 %	25 %	50 %	409246486
112	NT_187114	GGCT	2	8	47412	47419	0 %	25 %	50 %	25 %	409246487
113	NT_187114	GGAT	2	8	47706	47713	25 %	25 %	50 %	0 %	409246487
114	NT_187114	ACTA	2	8	48739	48746	50 %	25 %	0 %	25 %	409246487
115	NT_187114	CGCC	2	8	48817	48824	0 %	0 %	25 %	75 %	409246488
116	NT_187114	AATA	2	8	48931	48938	75 %	25 %	0 %	0 %	409246488
117	NT_187114	CTGA	2	8	49217	49224	25 %	25 %	25 %	25 %	409246488
118	NT_187114	CGGA	2	8	49326	49333	25 %	0 %	50 %	25 %	409246488
119	NT_187114	AGCA	2	8	50123	50130	50 %	0 %	25 %	25 %	409246488
120	NT_187114	ATTA	2	8	50280	50287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NT_187114	TTTC	2	8	50531	50538	0 %	75 %	0 %	25 %	409246490
122	NT_187114	CCAG	2	8	52693	52700	25 %	0 %	25 %	50 %	409246491
123	NT_187114	CATC	2	8	52908	52915	25 %	25 %	0 %	50 %	409246492
124	NT_187114	AGCC	2	8	52990	52997	25 %	0 %	25 %	50 %	409246492
125	NT_187114	GAAA	2	8	53036	53043	75 %	0 %	25 %	0 %	409246492
126	NT_187114	GTTA	2	8	53058	53065	25 %	50 %	25 %	0 %	409246492
127	NT_187114	TCAC	2	8	53224	53231	25 %	25 %	0 %	50 %	409246492
128	NT_187114	ACCG	2	8	53471	53478	25 %	0 %	25 %	50 %	409246493
129	NT_187114	ACTT	2	8	54129	54136	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NT_187114	TCCT	2	8	54247	54254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.