MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187113	GCCAT	2	10	1162	1171	20 %	20 %	20 %	40 %	409246394
2	NT_187113	CCAGA	2	10	3949	3958	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NT_187113	CCCGG	2	10	5637	5646	0 %	0 %	40 %	60 %	409246404
4	NT_187113	CTCAG	2	10	6936	6945	20 %	20 %	20 %	40 %	409246406
5	NT_187113	GGAAC	2	10	7601	7610	40 %	0 %	40 %	20 %	409246406
6	NT_187113	TGAGC	2	10	7996	8005	20 %	20 %	40 %	20 %	409246406
7	NT_187113	CTTTT	2	10	8970	8979	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NT_187113	CGCAC	2	10	9952	9961	20 %	0 %	20 %	60 %	409246408
9	NT_187113	CGACC	2	10	11392	11401	20 %	0 %	20 %	60 %	409246412
10	NT_187113	CGCTG	2	10	12224	12233	0 %	20 %	40 %	40 %	409246412
11	NT_187113	TGCAC	2	10	12419	12428	20 %	20 %	20 %	40 %	409246412
12	NT_187113	GCAGC	2	10	12593	12602	20 %	0 %	40 %	40 %	409246412
13	NT_187113	AGGGC	2	10	14029	14038	20 %	0 %	60 %	20 %	409246414
14	NT_187113	TGGCT	2	10	14501	14510	0 %	40 %	40 %	20 %	409246415
15	NT_187113	AAAGC	2	10	15068	15077	60 %	0 %	20 %	20 %	409246415
16	NT_187113	CGAAA	2	10	15592	15601	60 %	0 %	20 %	20 %	409246416
17	NT_187113	CCCCA	2	10	15707	15716	20 %	0 %	0 %	80 %	409246416
18	NT_187113	CCATC	2	10	16286	16295	20 %	20 %	0 %	60 %	409246418
19	NT_187113	ACGGT	2	10	16903	16912	20 %	20 %	40 %	20 %	409246418
20	NT_187113	GCGAT	2	10	17736	17745	20 %	20 %	40 %	20 %	409246420
21	NT_187113	CGCTC	2	10	18117	18126	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NT_187113	CATCG	2	10	18912	18921	20 %	20 %	20 %	40 %	409246421
23	NT_187113	GCTTC	2	10	19043	19052	0 %	40 %	20 %	40 %	409246421
24	NT_187113	GTCGC	2	10	19995	20004	0 %	20 %	40 %	40 %	409246422
25	NT_187113	TAAGC	2	10	20533	20542	40 %	20 %	20 %	20 %	409246422
26	NT_187113	CGCGC	2	10	24831	24840	0 %	0 %	40 %	60 %	409246427
27	NT_187113	GAAGT	2	10	25891	25900	40 %	20 %	40 %	0 %	409246427
28	NT_187113	CCACA	2	10	28099	28108	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
29	NT_187113	TTAAA	2	10	28243	28252	60 %	40 %	0 %	0 %	409246432
30	NT_187113	CCGTT	2	10	33243	33252	0 %	40 %	20 %	40 %	409246434
31	NT_187113	CCGCC	2	10	33552	33561	0 %	0 %	20 %	80 %	409246434
32	NT_187113	AACGG	2	10	34220	34229	40 %	0 %	40 %	20 %	409246434
33	NT_187113	GGTCA	2	10	36945	36954	20 %	20 %	40 %	20 %	409246435
34	NT_187113	ACAAA	2	10	37338	37347	80 %	0 %	0 %	20 %	409246435
35	NT_187113	ACCAG	2	10	37876	37885	40 %	0 %	20 %	40 %	409246435
36	NT_187113	TGGCG	2	10	38741	38750	0 %	20 %	60 %	20 %	409246435
37	NT_187113	CACGC	2	10	39344	39353	20 %	0 %	20 %	60 %	409246435
38	NT_187113	GCGCA	2	10	40583	40592	20 %	0 %	40 %	40 %	409246436
39	NT_187113	GCAGC	2	10	40737	40746	20 %	0 %	40 %	40 %	409246436
40	NT_187113	GAATC	2	10	40793	40802	40 %	20 %	20 %	20 %	409246436
41	NT_187113	AACTG	2	10	41468	41477	40 %	20 %	20 %	20 %	409246436
42	NT_187113	CGGAT	2	10	43678	43687	20 %	20 %	40 %	20 %	409246437
43	NT_187113	GCTGA	2	10	44110	44119	20 %	20 %	40 %	20 %	409246438
44	NT_187113	CTTAC	2	10	44961	44970	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.