MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187112	ACTGC	2	10	300	309	20 %	20 %	20 %	40 %	409246359
2	NT_187112	TCGGA	2	10	1089	1098	20 %	20 %	40 %	20 %	409246359
3	NT_187112	ACGCG	2	10	1397	1406	20 %	0 %	40 %	40 %	409246359
4	NT_187112	TGCGC	2	10	2205	2214	0 %	20 %	40 %	40 %	409246359
5	NT_187112	GTACC	2	10	4364	4373	20 %	20 %	20 %	40 %	409246361
6	NT_187112	GTACT	2	10	6260	6269	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NT_187112	ATCGC	2	10	8665	8674	20 %	20 %	20 %	40 %	409246367
8	NT_187112	TGCGT	2	10	11783	11792	0 %	40 %	40 %	20 %	409246370
9	NT_187112	GCCTT	2	10	14874	14883	0 %	40 %	20 %	40 %	409246372
10	NT_187112	CTTTC	2	10	15373	15382	0 %	60 %	0 %	40 %	409246372
11	NT_187112	TCTGG	2	10	15932	15941	0 %	40 %	40 %	20 %	409246373
12	NT_187112	CTGAC	2	10	16323	16332	20 %	20 %	20 %	40 %	409246374
13	NT_187112	GCGGT	2	10	16467	16476	0 %	20 %	60 %	20 %	409246374
14	NT_187112	AAAGC	2	10	16700	16709	60 %	0 %	20 %	20 %	409246375
15	NT_187112	TCAAA	2	10	17652	17661	60 %	20 %	0 %	20 %	409246378
16	NT_187112	ACGGA	2	10	20638	20647	40 %	0 %	40 %	20 %	409246381
17	NT_187112	GATTA	2	10	21183	21192	40 %	40 %	20 %	0 %	409246382
18	NT_187112	CCAGA	2	10	24356	24365	40 %	0 %	20 %	40 %	409246388
19	NT_187112	CAGAA	2	10	26276	26285	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NT_187112	GCTGA	2	10	26393	26402	20 %	20 %	40 %	20 %	409246390

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.