MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187112	CGGA	2	8	619	626	25 %	0 %	50 %	25 %	409246359
2	NT_187112	GTCA	2	8	769	776	25 %	25 %	25 %	25 %	409246359
3	NT_187112	AGGA	2	8	1067	1074	50 %	0 %	50 %	0 %	409246359
4	NT_187112	AACA	2	8	2536	2543	75 %	0 %	0 %	25 %	409246359
5	NT_187112	GCGA	2	8	2810	2817	25 %	0 %	50 %	25 %	409246359
6	NT_187112	AAAG	2	8	2961	2968	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187112	CAGG	2	8	3405	3412	25 %	0 %	50 %	25 %	409246360
8	NT_187112	TTCA	2	8	4149	4156	25 %	50 %	0 %	25 %	409246361
9	NT_187112	ATCG	2	8	5114	5121	25 %	25 %	25 %	25 %	409246362
10	NT_187112	GCGG	2	8	5260	5267	0 %	0 %	75 %	25 %	409246362
11	NT_187112	ATCG	2	8	6583	6590	25 %	25 %	25 %	25 %	409246365
12	NT_187112	CATC	2	8	6615	6622	25 %	25 %	0 %	50 %	409246365
13	NT_187112	AGGC	2	8	7202	7209	25 %	0 %	50 %	25 %	409246365
14	NT_187112	CCTG	2	8	7591	7598	0 %	25 %	25 %	50 %	409246365
15	NT_187112	GATC	2	8	8075	8082	25 %	25 %	25 %	25 %	409246366
16	NT_187112	GCCA	2	8	8236	8243	25 %	0 %	25 %	50 %	409246366
17	NT_187112	AGGC	2	8	9519	9526	25 %	0 %	50 %	25 %	409246367
18	NT_187112	GGCT	2	8	9885	9892	0 %	25 %	50 %	25 %	409246368
19	NT_187112	CCAT	2	8	10381	10388	25 %	25 %	0 %	50 %	409246368
20	NT_187112	TACG	2	8	10697	10704	25 %	25 %	25 %	25 %	409246368
21	NT_187112	ACAA	2	8	11109	11116	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NT_187112	AACA	2	8	13085	13092	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NT_187112	TACA	2	8	13930	13937	50 %	25 %	0 %	25 %	409246371
24	NT_187112	TGCT	2	8	14184	14191	0 %	50 %	25 %	25 %	409246371
25	NT_187112	GAAA	2	8	15222	15229	75 %	0 %	25 %	0 %	409246372
26	NT_187112	AATC	2	8	15754	15761	50 %	25 %	0 %	25 %	409246373
27	NT_187112	AGCG	2	8	15924	15931	25 %	0 %	50 %	25 %	409246373
28	NT_187112	GATT	2	8	16070	16077	25 %	50 %	25 %	0 %	409246373
29	NT_187112	TGCC	2	8	16376	16383	0 %	25 %	25 %	50 %	409246374
30	NT_187112	CTGG	2	8	16791	16798	0 %	25 %	50 %	25 %	409246375
31	NT_187112	GAAT	2	8	17435	17442	50 %	25 %	25 %	0 %	409246377
32	NT_187112	ATCA	2	8	17933	17940	50 %	25 %	0 %	25 %	409246379
33	NT_187112	GAAA	2	8	18059	18066	75 %	0 %	25 %	0 %	409246379
34	NT_187112	TGAA	2	8	18450	18457	50 %	25 %	25 %	0 %	409246380
35	NT_187112	AGCC	2	8	18716	18723	25 %	0 %	25 %	50 %	409246381
36	NT_187112	GTGC	2	8	18812	18819	0 %	25 %	50 %	25 %	409246381
37	NT_187112	TCGC	2	8	19288	19295	0 %	25 %	25 %	50 %	409246381
38	NT_187112	TGAC	2	8	19420	19427	25 %	25 %	25 %	25 %	409246381
39	NT_187112	GGGA	2	8	20994	21001	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187112	GCTG	2	8	21412	21419	0 %	25 %	50 %	25 %	409246382
41	NT_187112	TAAA	2	8	21594	21601	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187112	TGCA	2	8	22113	22120	25 %	25 %	25 %	25 %	409246385
43	NT_187112	CATC	2	8	22627	22634	25 %	25 %	0 %	50 %	409246387
44	NT_187112	GTCG	2	8	22805	22812	0 %	25 %	50 %	25 %	409246387
45	NT_187112	GTCA	2	8	22826	22833	25 %	25 %	25 %	25 %	409246387
46	NT_187112	TGCG	2	8	22850	22857	0 %	25 %	50 %	25 %	409246387
47	NT_187112	ATTC	2	8	22897	22904	25 %	50 %	0 %	25 %	409246387
48	NT_187112	CAGG	2	8	22936	22943	25 %	0 %	50 %	25 %	409246387
49	NT_187112	TGGC	2	8	23576	23583	0 %	25 %	50 %	25 %	409246388
50	NT_187112	CTGC	2	8	23880	23887	0 %	25 %	25 %	50 %	409246388
51	NT_187112	ATGG	2	8	24033	24040	25 %	25 %	50 %	0 %	409246388
52	NT_187112	AAGT	2	8	24404	24411	50 %	25 %	25 %	0 %	409246388
53	NT_187112	CCGA	2	8	25681	25688	25 %	0 %	25 %	50 %	409246389
54	NT_187112	CCAG	2	8	26153	26160	25 %	0 %	25 %	50 %	409246389
55	NT_187112	CAGC	2	8	26205	26212	25 %	0 %	25 %	50 %	409246389
56	NT_187112	CCCG	2	8	26299	26306	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NT_187112	CCGT	2	8	26447	26454	0 %	25 %	25 %	50 %	409246390
58	NT_187112	AGTA	2	8	26639	26646	50 %	25 %	25 %	0 %	409246390
59	NT_187112	GGCT	2	8	26852	26859	0 %	25 %	50 %	25 %	409246390
60	NT_187112	GTCG	2	8	26945	26952	0 %	25 %	50 %	25 %	409246390
61	NT_187112	GATG	2	8	26986	26993	25 %	25 %	50 %	0 %	409246390
62	NT_187112	CCTG	2	8	27160	27167	0 %	25 %	25 %	50 %	409246390
63	NT_187112	TCTA	2	8	27227	27234	25 %	50 %	0 %	25 %	409246390

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.