MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187112	CGGA	2	8	619	626	25 %	0 %	50 %	25 %	409246359
2	NT_187112	GTCA	2	8	769	776	25 %	25 %	25 %	25 %	409246359
3	NT_187112	AGGA	2	8	1067	1074	50 %	0 %	50 %	0 %	409246359
4	NT_187112	AACA	2	8	2536	2543	75 %	0 %	0 %	25 %	409246359
5	NT_187112	GCGA	2	8	2810	2817	25 %	0 %	50 %	25 %	409246359
6	NT_187112	CAGG	2	8	3405	3412	25 %	0 %	50 %	25 %	409246360
7	NT_187112	TTCA	2	8	4149	4156	25 %	50 %	0 %	25 %	409246361
8	NT_187112	ATCG	2	8	5114	5121	25 %	25 %	25 %	25 %	409246362
9	NT_187112	GCGG	2	8	5260	5267	0 %	0 %	75 %	25 %	409246362
10	NT_187112	ATCG	2	8	6583	6590	25 %	25 %	25 %	25 %	409246365
11	NT_187112	CATC	2	8	6615	6622	25 %	25 %	0 %	50 %	409246365
12	NT_187112	AGGC	2	8	7202	7209	25 %	0 %	50 %	25 %	409246365
13	NT_187112	CCTG	2	8	7591	7598	0 %	25 %	25 %	50 %	409246365
14	NT_187112	GATC	2	8	8075	8082	25 %	25 %	25 %	25 %	409246366
15	NT_187112	GCCA	2	8	8236	8243	25 %	0 %	25 %	50 %	409246366
16	NT_187112	AGGC	2	8	9519	9526	25 %	0 %	50 %	25 %	409246367
17	NT_187112	GGCT	2	8	9885	9892	0 %	25 %	50 %	25 %	409246368
18	NT_187112	CCAT	2	8	10381	10388	25 %	25 %	0 %	50 %	409246368
19	NT_187112	TACG	2	8	10697	10704	25 %	25 %	25 %	25 %	409246368
20	NT_187112	TACA	2	8	13930	13937	50 %	25 %	0 %	25 %	409246371
21	NT_187112	TGCT	2	8	14184	14191	0 %	50 %	25 %	25 %	409246371
22	NT_187112	GAAA	2	8	15222	15229	75 %	0 %	25 %	0 %	409246372
23	NT_187112	AATC	2	8	15754	15761	50 %	25 %	0 %	25 %	409246373
24	NT_187112	AGCG	2	8	15924	15931	25 %	0 %	50 %	25 %	409246373
25	NT_187112	GATT	2	8	16070	16077	25 %	50 %	25 %	0 %	409246373
26	NT_187112	TGCC	2	8	16376	16383	0 %	25 %	25 %	50 %	409246374
27	NT_187112	CTGG	2	8	16791	16798	0 %	25 %	50 %	25 %	409246375
28	NT_187112	GAAT	2	8	17435	17442	50 %	25 %	25 %	0 %	409246377
29	NT_187112	ATCA	2	8	17933	17940	50 %	25 %	0 %	25 %	409246379
30	NT_187112	GAAA	2	8	18059	18066	75 %	0 %	25 %	0 %	409246379
31	NT_187112	TGAA	2	8	18450	18457	50 %	25 %	25 %	0 %	409246380
32	NT_187112	AGCC	2	8	18716	18723	25 %	0 %	25 %	50 %	409246381
33	NT_187112	GTGC	2	8	18812	18819	0 %	25 %	50 %	25 %	409246381
34	NT_187112	TCGC	2	8	19288	19295	0 %	25 %	25 %	50 %	409246381
35	NT_187112	TGAC	2	8	19420	19427	25 %	25 %	25 %	25 %	409246381
36	NT_187112	GCTG	2	8	21412	21419	0 %	25 %	50 %	25 %	409246382
37	NT_187112	TGCA	2	8	22113	22120	25 %	25 %	25 %	25 %	409246385
38	NT_187112	CATC	2	8	22627	22634	25 %	25 %	0 %	50 %	409246387
39	NT_187112	GTCG	2	8	22805	22812	0 %	25 %	50 %	25 %	409246387
40	NT_187112	GTCA	2	8	22826	22833	25 %	25 %	25 %	25 %	409246387
41	NT_187112	TGCG	2	8	22850	22857	0 %	25 %	50 %	25 %	409246387
42	NT_187112	ATTC	2	8	22897	22904	25 %	50 %	0 %	25 %	409246387
43	NT_187112	CAGG	2	8	22936	22943	25 %	0 %	50 %	25 %	409246387
44	NT_187112	TGGC	2	8	23576	23583	0 %	25 %	50 %	25 %	409246388
45	NT_187112	CTGC	2	8	23880	23887	0 %	25 %	25 %	50 %	409246388
46	NT_187112	ATGG	2	8	24033	24040	25 %	25 %	50 %	0 %	409246388
47	NT_187112	AAGT	2	8	24404	24411	50 %	25 %	25 %	0 %	409246388
48	NT_187112	CCGA	2	8	25681	25688	25 %	0 %	25 %	50 %	409246389
49	NT_187112	CCAG	2	8	26153	26160	25 %	0 %	25 %	50 %	409246389
50	NT_187112	CAGC	2	8	26205	26212	25 %	0 %	25 %	50 %	409246389
51	NT_187112	CCGT	2	8	26447	26454	0 %	25 %	25 %	50 %	409246390
52	NT_187112	AGTA	2	8	26639	26646	50 %	25 %	25 %	0 %	409246390
53	NT_187112	GGCT	2	8	26852	26859	0 %	25 %	50 %	25 %	409246390
54	NT_187112	GTCG	2	8	26945	26952	0 %	25 %	50 %	25 %	409246390
55	NT_187112	GATG	2	8	26986	26993	25 %	25 %	50 %	0 %	409246390
56	NT_187112	CCTG	2	8	27160	27167	0 %	25 %	25 %	50 %	409246390
57	NT_187112	TCTA	2	8	27227	27234	25 %	50 %	0 %	25 %	409246390

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.