MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 309

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187112	ATC	2	6	319	324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246359
2	NT_187112	TGC	2	6	377	382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246359
3	NT_187112	CTG	2	6	400	405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246359
4	NT_187112	TCG	2	6	479	484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246359
5	NT_187112	TTC	2	6	508	513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246359
6	NT_187112	TCA	2	6	596	601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246359
7	NT_187112	ATA	2	6	725	730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246359
8	NT_187112	ACC	2	6	731	736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246359
9	NT_187112	CGT	2	6	783	788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246359
10	NT_187112	CAA	2	6	844	849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246359
11	NT_187112	GAC	2	6	864	869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246359
12	NT_187112	CTT	2	6	897	902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246359
13	NT_187112	CGT	2	6	990	995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246359
14	NT_187112	ACG	2	6	1114	1119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246359
15	NT_187112	CTT	2	6	1491	1496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246359
16	NT_187112	TTC	2	6	1531	1536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246359
17	NT_187112	TCA	2	6	1581	1586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246359
18	NT_187112	CTG	2	6	1591	1596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246359
19	NT_187112	AAT	2	6	1612	1617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246359
20	NT_187112	GCG	2	6	1618	1623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246359
21	NT_187112	CTC	2	6	1639	1644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409246359
22	NT_187112	GCC	3	9	1751	1759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246359
23	NT_187112	TGG	2	6	1787	1792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246359
24	NT_187112	ACG	2	6	1876	1881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246359
25	NT_187112	GTG	2	6	1928	1933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246359
26	NT_187112	CAC	2	6	1953	1958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246359
27	NT_187112	CGC	2	6	2112	2117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246359
28	NT_187112	CCA	2	6	2133	2138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246359
29	NT_187112	CGA	2	6	2165	2170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246359
30	NT_187112	TAA	2	6	2199	2204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246359
31	NT_187112	CAA	2	6	2223	2228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246359
32	NT_187112	GTT	2	6	2269	2274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246359
33	NT_187112	ACG	2	6	2281	2286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246359
34	NT_187112	TCA	2	6	2318	2323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246359
35	NT_187112	CAG	2	6	2494	2499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246359
36	NT_187112	GCC	2	6	2528	2533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246359
37	NT_187112	GAA	2	6	2618	2623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246359
38	NT_187112	CGC	2	6	2634	2639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246359
39	NT_187112	CGG	2	6	2712	2717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246359
40	NT_187112	TAA	2	6	2722	2727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246359
41	NT_187112	GTC	2	6	3035	3040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246360
42	NT_187112	CGA	2	6	3047	3052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246360
43	NT_187112	AGA	2	6	3057	3062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246360
44	NT_187112	GAT	2	6	3283	3288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246360
45	NT_187112	TCC	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409246360
46	NT_187112	GCC	3	9	3365	3373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246360
47	NT_187112	CGC	2	6	3562	3567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246360
48	NT_187112	CGC	2	6	3609	3614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246360
49	NT_187112	CAT	2	6	3743	3748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246361
50	NT_187112	CCA	2	6	3791	3796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246361
51	NT_187112	GCA	2	6	3857	3862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246361
52	NT_187112	ACC	2	6	3945	3950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246361
53	NT_187112	CCG	2	6	4085	4090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246361
54	NT_187112	GAC	2	6	4136	4141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246361
55	NT_187112	TCC	2	6	4161	4166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409246361
56	NT_187112	CCA	2	6	4232	4237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246361
57	NT_187112	CCA	3	9	4265	4273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246361
58	NT_187112	CGT	2	6	4281	4286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246361
59	NT_187112	CGG	2	6	4335	4340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246361
60	NT_187112	ATA	2	6	4341	4346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246361
61	NT_187112	ACC	2	6	4399	4404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246361
62	NT_187112	TTG	2	6	4417	4422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246361
63	NT_187112	TCG	2	6	4492	4497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246361
64	NT_187112	CGC	2	6	4523	4528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246361
65	NT_187112	AAT	2	6	4616	4621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246361
66	NT_187112	TGG	2	6	4860	4865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246362
67	NT_187112	CAG	2	6	4866	4871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246362
68	NT_187112	CCG	2	6	4931	4936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246362
69	NT_187112	CAG	2	6	5045	5050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246362
70	NT_187112	GCC	2	6	5108	5113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246362
71	NT_187112	GAT	2	6	5198	5203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246362
72	NT_187112	ACC	2	6	5318	5323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246362
73	NT_187112	ATT	2	6	5549	5554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246362
74	NT_187112	CAA	2	6	5587	5592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246363
75	NT_187112	CCA	2	6	6004	6009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246364
76	NT_187112	CAA	2	6	6083	6088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246364
77	NT_187112	GCA	2	6	6113	6118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246364
78	NT_187112	CGT	2	6	6132	6137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246364
79	NT_187112	TCG	2	6	6166	6171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246364
80	NT_187112	AGA	3	9	6176	6184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246364
81	NT_187112	ACG	2	6	6519	6524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246365
82	NT_187112	ACT	2	6	6555	6560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246365
83	NT_187112	CTG	2	6	6601	6606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246365
84	NT_187112	CCA	2	6	6633	6638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246365
85	NT_187112	CAG	2	6	6700	6705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246365
86	NT_187112	GCT	2	6	6708	6713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246365
87	NT_187112	CAA	2	6	6715	6720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246365
88	NT_187112	AAT	2	6	6727	6732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246365
89	NT_187112	TCA	2	6	6867	6872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246365
90	NT_187112	CAG	2	6	7078	7083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246365
91	NT_187112	CGC	2	6	7245	7250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246365
92	NT_187112	GCA	2	6	7353	7358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246365
93	NT_187112	GCT	2	6	7380	7385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246365
94	NT_187112	TGC	2	6	7388	7393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246365
95	NT_187112	TCA	2	6	7406	7411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246365
96	NT_187112	GCT	2	6	7556	7561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246365
97	NT_187112	CGT	2	6	7575	7580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246365
98	NT_187112	TTC	2	6	7618	7623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246366
99	NT_187112	TAA	2	6	7715	7720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246366
100	NT_187112	GCC	2	6	7740	7745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246366
101	NT_187112	TCG	2	6	7757	7762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246366
102	NT_187112	GCT	2	6	7793	7798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246366
103	NT_187112	CGC	2	6	7872	7877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246366
104	NT_187112	GCC	2	6	8157	8162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246366
105	NT_187112	AAT	2	6	8218	8223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246366
106	NT_187112	GCG	2	6	8456	8461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246366
107	NT_187112	TAA	2	6	8696	8701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246367
108	NT_187112	CGA	2	6	8718	8723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246367
109	NT_187112	ATA	2	6	8725	8730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246367
110	NT_187112	GAT	2	6	8803	8808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246367
111	NT_187112	GCT	2	6	8819	8824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246367
112	NT_187112	ACC	3	9	9010	9018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246367
113	NT_187112	CAT	2	6	9077	9082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246367
114	NT_187112	GCC	2	6	9085	9090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246367
115	NT_187112	GGC	2	6	9157	9162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246367
116	NT_187112	TGT	2	6	9256	9261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246367
117	NT_187112	CCG	3	9	9325	9333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246367
118	NT_187112	GAC	2	6	9342	9347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246367
119	NT_187112	CGT	2	6	9475	9480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246367
120	NT_187112	CAA	2	6	9588	9593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246367
121	NT_187112	CAT	2	6	9605	9610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246367
122	NT_187112	GCT	2	6	9782	9787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246368
123	NT_187112	GGC	2	6	9893	9898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246368
124	NT_187112	GCC	2	6	10017	10022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246368
125	NT_187112	CAA	2	6	10094	10099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246368
126	NT_187112	GCG	2	6	10117	10122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246368
127	NT_187112	CCA	2	6	10331	10336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246368
128	NT_187112	TAC	2	6	10554	10559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246368
129	NT_187112	AAT	2	6	10584	10589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246368
130	NT_187112	GCT	2	6	10661	10666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246368
131	NT_187112	ATG	2	6	10726	10731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246368
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223	NT_187112	TCA	2	6	19873	19878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246381
224	NT_187112	ACC	2	6	19903	19908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246381
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239	NT_187112	ATA	2	6	21616	21621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246383
240	NT_187112	GCA	2	6	21647	21652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246383
241	NT_187112	CAG	2	6	21727	21732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246383
242	NT_187112	ATA	2	6	21781	21786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246383
243	NT_187112	CAG	2	6	21788	21793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246383
244	NT_187112	CCA	2	6	21813	21818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246383
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246	NT_187112	TTG	2	6	21977	21982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246384
247	NT_187112	TGT	2	6	21988	21993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246384
248	NT_187112	TAT	2	6	22002	22007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246384
249	NT_187112	TAA	2	6	22033	22038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246384
250	NT_187112	GCC	2	6	22169	22174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246386
251	NT_187112	GGT	2	6	22267	22272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246386
252	NT_187112	ATT	2	6	22432	22437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246387
253	NT_187112	TGA	2	6	22468	22473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246387
254	NT_187112	GCC	2	6	22595	22600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246387
255	NT_187112	CGG	2	6	22639	22644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246387
256	NT_187112	CCG	2	6	22725	22730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246387
257	NT_187112	ATG	2	6	22839	22844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246387
258	NT_187112	GCG	2	6	22877	22882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246387
259	NT_187112	CAG	2	6	22973	22978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246387
260	NT_187112	CAG	2	6	23084	23089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246387
261	NT_187112	GCT	2	6	23119	23124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246387
262	NT_187112	CAG	2	6	23186	23191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246387
263	NT_187112	GCG	2	6	23448	23453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246387
264	NT_187112	TGG	2	6	23553	23558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246388
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266	NT_187112	CGT	2	6	23682	23687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246388
267	NT_187112	GCC	2	6	23771	23776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246388
268	NT_187112	ACC	2	6	23948	23953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246388
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270	NT_187112	TCC	2	6	24059	24064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409246388
271	NT_187112	CTC	2	6	24100	24105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409246388
272	NT_187112	TCG	2	6	24128	24133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246388
273	NT_187112	TCA	2	6	24167	24172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246388
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275	NT_187112	AAG	2	6	24271	24276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246388
276	NT_187112	TTG	2	6	24341	24346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246388
277	NT_187112	GTT	2	6	24562	24567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246388
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279	NT_187112	GAA	2	6	24823	24828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246388
280	NT_187112	TTC	2	6	24832	24837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246388
281	NT_187112	GCC	2	6	24981	24986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246388
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283	NT_187112	GCT	2	6	25063	25068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246388
284	NT_187112	GCA	2	6	25146	25151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246388
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287	NT_187112	GAC	2	6	25630	25635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246389
288	NT_187112	TGA	2	6	25797	25802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246389
289	NT_187112	CGA	2	6	26001	26006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246389
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292	NT_187112	GAA	2	6	26146	26151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246389
293	NT_187112	ACC	2	6	26179	26184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246389
294	NT_187112	GCG	3	9	26231	26239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246389
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299	NT_187112	GAT	2	6	26597	26602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246390
300	NT_187112	TCA	2	6	26769	26774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246390
301	NT_187112	ACC	2	6	26792	26797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246390
302	NT_187112	CGC	2	6	26800	26805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246390
303	NT_187112	TGC	2	6	26832	26837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246390
304	NT_187112	TGA	2	6	26892	26897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246390
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309	NT_187112	TGA	2	6	27265	27270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246390

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.