MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187111	GCGTT	2	10	568	577	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NT_187111	CGTCC	2	10	1052	1061	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NT_187111	TTGAT	2	10	2674	2683	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187111	ACGCC	2	10	6272	6281	20 %	0 %	20 %	60 %	409251180
5	NT_187111	GTTCG	2	10	8433	8442	0 %	40 %	40 %	20 %	409251180
6	NT_187111	GCGGT	2	10	9499	9508	0 %	20 %	60 %	20 %	409251180
7	NT_187111	GACCA	2	10	10132	10141	40 %	0 %	20 %	40 %	409251180
8	NT_187111	TCGTT	2	10	10835	10844	0 %	60 %	20 %	20 %	409251182
9	NT_187111	CACCG	2	10	11472	11481	20 %	0 %	20 %	60 %	409251182
10	NT_187111	AGCCG	2	10	12621	12630	20 %	0 %	40 %	40 %	409251182
11	NT_187111	GCCCG	2	10	12768	12777	0 %	0 %	40 %	60 %	409251182
12	NT_187111	CAGGT	2	10	14200	14209	20 %	20 %	40 %	20 %	409251182
13	NT_187111	GGGCT	2	10	14967	14976	0 %	20 %	60 %	20 %	409251182
14	NT_187111	GTGCT	2	10	15136	15145	0 %	40 %	40 %	20 %	409251182
15	NT_187111	CAAAG	2	10	16502	16511	60 %	0 %	20 %	20 %	409251183
16	NT_187111	GGCGC	2	10	17370	17379	0 %	0 %	60 %	40 %	409251183
17	NT_187111	AATAA	2	10	19298	19307	80 %	20 %	0 %	0 %	409251184
18	NT_187111	AAAAG	2	10	19791	19800	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187111	TCTGC	2	10	20008	20017	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NT_187111	ACCGT	2	10	21957	21966	20 %	20 %	20 %	40 %	409251187
21	NT_187111	TCGGT	2	10	22003	22012	0 %	40 %	40 %	20 %	409251187
22	NT_187111	TGCGC	2	10	23208	23217	0 %	20 %	40 %	40 %	409251188
23	NT_187111	AACAA	2	10	24092	24101	80 %	0 %	0 %	20 %	409251189
24	NT_187111	GCCCG	2	10	25332	25341	0 %	0 %	40 %	60 %	409251190
25	NT_187111	GTTCA	2	10	26843	26852	20 %	40 %	20 %	20 %	409251191
26	NT_187111	TCATC	2	10	28573	28582	20 %	40 %	0 %	40 %	409251192
27	NT_187111	TCGTT	2	10	28705	28714	0 %	60 %	20 %	20 %	409251192
28	NT_187111	AAAAT	2	10	29496	29505	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187111	CAGCG	2	10	30674	30683	20 %	0 %	40 %	40 %	409251196
30	NT_187111	TAGCG	2	10	33272	33281	20 %	20 %	40 %	20 %	409251198
31	NT_187111	TAAAT	2	10	34311	34320	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187111	CCTGG	2	10	34537	34546	0 %	20 %	40 %	40 %	409251199
33	NT_187111	CGGCG	2	10	34592	34601	0 %	0 %	60 %	40 %	409251199
34	NT_187111	GCGCC	2	10	35371	35380	0 %	0 %	40 %	60 %	409251199
35	NT_187111	GATCG	2	10	35649	35658	20 %	20 %	40 %	20 %	409251199
36	NT_187111	ACCAG	2	10	37027	37036	40 %	0 %	20 %	40 %	409251200
37	NT_187111	CAGGC	2	10	38239	38248	20 %	0 %	40 %	40 %	409251200
38	NT_187111	CGGCG	2	10	39284	39293	0 %	0 %	60 %	40 %	409251200
39	NT_187111	CGCGC	2	10	39363	39372	0 %	0 %	40 %	60 %	409251200
40	NT_187111	GCGCC	2	10	40678	40687	0 %	0 %	40 %	60 %	409251200
41	NT_187111	GCTGG	2	10	41123	41132	0 %	20 %	60 %	20 %	409251200
42	NT_187111	TCCGC	2	10	42105	42114	0 %	20 %	20 %	60 %	409251201
43	NT_187111	TAATT	2	10	42914	42923	40 %	60 %	0 %	0 %	409251204
44	NT_187111	TTGGG	2	10	44357	44366	0 %	40 %	60 %	0 %	409251205
45	NT_187111	TCGCC	2	10	44775	44784	0 %	20 %	20 %	60 %	409251205
46	NT_187111	TACGG	2	10	46043	46052	20 %	20 %	40 %	20 %	409251206
47	NT_187111	GCGCA	2	10	46806	46815	20 %	0 %	40 %	40 %	409251208
48	NT_187111	TATTT	2	10	49828	49837	20 %	80 %	0 %	0 %	409251212
49	NT_187111	GTAAT	2	10	53191	53200	40 %	40 %	20 %	0 %	409251216
50	NT_187111	AGTTT	2	10	55178	55187	20 %	60 %	20 %	0 %	409251218
51	NT_187111	TTCGT	2	10	55535	55544	0 %	60 %	20 %	20 %	409251218
52	NT_187111	CTGGC	2	10	57701	57710	0 %	20 %	40 %	40 %	409251220
53	NT_187111	CAGCA	2	10	58530	58539	40 %	0 %	20 %	40 %	409251221
54	NT_187111	CCCGA	2	10	60444	60453	20 %	0 %	20 %	60 %	409251223
55	NT_187111	ACGCC	2	10	60961	60970	20 %	0 %	20 %	60 %	409251223
56	NT_187111	AATGC	2	10	62183	62192	40 %	20 %	20 %	20 %	409251224
57	NT_187111	ACACA	2	10	62376	62385	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NT_187111	ATCAG	2	10	65393	65402	40 %	20 %	20 %	20 %	409251227
59	NT_187111	TCTGC	2	10	67824	67833	0 %	40 %	20 %	40 %	409251228
60	NT_187111	GGCTG	2	10	68047	68056	0 %	20 %	60 %	20 %	409251228
61	NT_187111	TAGCG	2	10	68620	68629	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NT_187111	GCATG	2	10	70073	70082	20 %	20 %	40 %	20 %	409251229
63	NT_187111	CCGCG	2	10	72560	72569	0 %	0 %	40 %	60 %	409251231
64	NT_187111	AGTTC	2	10	72915	72924	20 %	40 %	20 %	20 %	409251232
65	NT_187111	GCGCA	2	10	74316	74325	20 %	0 %	40 %	40 %	409251233
66	NT_187111	CTGCG	2	10	74730	74739	0 %	20 %	40 %	40 %	409251233
67	NT_187111	GCCAG	2	10	76221	76230	20 %	0 %	40 %	40 %	409251234
68	NT_187111	TTGTA	2	10	77709	77718	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187111	CGGCG	2	10	79071	79080	0 %	0 %	60 %	40 %	409251238
70	NT_187111	GCCAG	2	10	79520	79529	20 %	0 %	40 %	40 %	409251238
71	NT_187111	ACGGT	2	10	80188	80197	20 %	20 %	40 %	20 %	409251238
72	NT_187111	GCCGC	2	10	80809	80818	0 %	0 %	40 %	60 %	409251238
73	NT_187111	TACGC	2	10	81832	81841	20 %	20 %	20 %	40 %	409251238
74	NT_187111	GGCTG	2	10	82739	82748	0 %	20 %	60 %	20 %	409251240
75	NT_187111	ACGCA	2	10	86255	86264	40 %	0 %	20 %	40 %	409251243
76	NT_187111	CGCAT	2	10	86358	86367	20 %	20 %	20 %	40 %	409251243
77	NT_187111	GAATA	2	10	87543	87552	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187111	CACGC	2	10	87943	87952	20 %	0 %	20 %	60 %	409251245
79	NT_187111	AAATA	2	10	89725	89734	80 %	20 %	0 %	0 %	409251247
80	NT_187111	AATTA	2	10	90912	90921	60 %	40 %	0 %	0 %	409251248
81	NT_187111	TTTCA	2	10	92494	92503	20 %	60 %	0 %	20 %	409251251
82	NT_187111	GTAGC	2	10	93759	93768	20 %	20 %	40 %	20 %	409251252
83	NT_187111	AGCGT	2	10	96629	96638	20 %	20 %	40 %	20 %	409251255
84	NT_187111	GAATT	2	10	99241	99250	40 %	40 %	20 %	0 %	409251257
85	NT_187111	TTAAT	2	10	100645	100654	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NT_187111	TGCCG	2	10	102459	102468	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.