Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1
Total Repeats: 73
S.No. | Genome ID | Motif | Iterations | Length | Start | End | A% | T% | G% | C% | Protein ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NT_187111 | ACGCC | 2 | 10 | 6272 | 6281 | 20 % | 0 % | 20 % | 60 % | 409251180 |
2 | NT_187111 | GTTCG | 2 | 10 | 8433 | 8442 | 0 % | 40 % | 40 % | 20 % | 409251180 |
3 | NT_187111 | GCGGT | 2 | 10 | 9499 | 9508 | 0 % | 20 % | 60 % | 20 % | 409251180 |
4 | NT_187111 | GACCA | 2 | 10 | 10132 | 10141 | 40 % | 0 % | 20 % | 40 % | 409251180 |
5 | NT_187111 | TCGTT | 2 | 10 | 10835 | 10844 | 0 % | 60 % | 20 % | 20 % | 409251182 |
6 | NT_187111 | CACCG | 2 | 10 | 11472 | 11481 | 20 % | 0 % | 20 % | 60 % | 409251182 |
7 | NT_187111 | AGCCG | 2 | 10 | 12621 | 12630 | 20 % | 0 % | 40 % | 40 % | 409251182 |
8 | NT_187111 | GCCCG | 2 | 10 | 12768 | 12777 | 0 % | 0 % | 40 % | 60 % | 409251182 |
9 | NT_187111 | CAGGT | 2 | 10 | 14200 | 14209 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 409251182 |
10 | NT_187111 | GGGCT | 2 | 10 | 14967 | 14976 | 0 % | 20 % | 60 % | 20 % | 409251182 |
11 | NT_187111 | GTGCT | 2 | 10 | 15136 | 15145 | 0 % | 40 % | 40 % | 20 % | 409251182 |
12 | NT_187111 | CAAAG | 2 | 10 | 16502 | 16511 | 60 % | 0 % | 20 % | 20 % | 409251183 |
13 | NT_187111 | GGCGC | 2 | 10 | 17370 | 17379 | 0 % | 0 % | 60 % | 40 % | 409251183 |
14 | NT_187111 | AATAA | 2 | 10 | 19298 | 19307 | 80 % | 20 % | 0 % | 0 % | 409251184 |
15 | NT_187111 | ACCGT | 2 | 10 | 21957 | 21966 | 20 % | 20 % | 20 % | 40 % | 409251187 |
16 | NT_187111 | TCGGT | 2 | 10 | 22003 | 22012 | 0 % | 40 % | 40 % | 20 % | 409251187 |
17 | NT_187111 | TGCGC | 2 | 10 | 23208 | 23217 | 0 % | 20 % | 40 % | 40 % | 409251188 |
18 | NT_187111 | AACAA | 2 | 10 | 24092 | 24101 | 80 % | 0 % | 0 % | 20 % | 409251189 |
19 | NT_187111 | GCCCG | 2 | 10 | 25332 | 25341 | 0 % | 0 % | 40 % | 60 % | 409251190 |
20 | NT_187111 | GTTCA | 2 | 10 | 26843 | 26852 | 20 % | 40 % | 20 % | 20 % | 409251191 |
21 | NT_187111 | TCATC | 2 | 10 | 28573 | 28582 | 20 % | 40 % | 0 % | 40 % | 409251192 |
22 | NT_187111 | TCGTT | 2 | 10 | 28705 | 28714 | 0 % | 60 % | 20 % | 20 % | 409251192 |
23 | NT_187111 | CAGCG | 2 | 10 | 30674 | 30683 | 20 % | 0 % | 40 % | 40 % | 409251196 |
24 | NT_187111 | TAGCG | 2 | 10 | 33272 | 33281 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 409251198 |
25 | NT_187111 | CCTGG | 2 | 10 | 34537 | 34546 | 0 % | 20 % | 40 % | 40 % | 409251199 |
26 | NT_187111 | CGGCG | 2 | 10 | 34592 | 34601 | 0 % | 0 % | 60 % | 40 % | 409251199 |
27 | NT_187111 | GCGCC | 2 | 10 | 35371 | 35380 | 0 % | 0 % | 40 % | 60 % | 409251199 |
28 | NT_187111 | GATCG | 2 | 10 | 35649 | 35658 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 409251199 |
29 | NT_187111 | ACCAG | 2 | 10 | 37027 | 37036 | 40 % | 0 % | 20 % | 40 % | 409251200 |
30 | NT_187111 | CAGGC | 2 | 10 | 38239 | 38248 | 20 % | 0 % | 40 % | 40 % | 409251200 |
31 | NT_187111 | CGGCG | 2 | 10 | 39284 | 39293 | 0 % | 0 % | 60 % | 40 % | 409251200 |
32 | NT_187111 | CGCGC | 2 | 10 | 39363 | 39372 | 0 % | 0 % | 40 % | 60 % | 409251200 |
33 | NT_187111 | GCGCC | 2 | 10 | 40678 | 40687 | 0 % | 0 % | 40 % | 60 % | 409251200 |
34 | NT_187111 | GCTGG | 2 | 10 | 41123 | 41132 | 0 % | 20 % | 60 % | 20 % | 409251200 |
35 | NT_187111 | TCCGC | 2 | 10 | 42105 | 42114 | 0 % | 20 % | 20 % | 60 % | 409251201 |
36 | NT_187111 | TAATT | 2 | 10 | 42914 | 42923 | 40 % | 60 % | 0 % | 0 % | 409251204 |
37 | NT_187111 | TTGGG | 2 | 10 | 44357 | 44366 | 0 % | 40 % | 60 % | 0 % | 409251205 |
38 | NT_187111 | TCGCC | 2 | 10 | 44775 | 44784 | 0 % | 20 % | 20 % | 60 % | 409251205 |
39 | NT_187111 | TACGG | 2 | 10 | 46043 | 46052 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 409251206 |
40 | NT_187111 | GCGCA | 2 | 10 | 46806 | 46815 | 20 % | 0 % | 40 % | 40 % | 409251208 |
41 | NT_187111 | TATTT | 2 | 10 | 49828 | 49837 | 20 % | 80 % | 0 % | 0 % | 409251212 |
42 | NT_187111 | GTAAT | 2 | 10 | 53191 | 53200 | 40 % | 40 % | 20 % | 0 % | 409251216 |
43 | NT_187111 | AGTTT | 2 | 10 | 55178 | 55187 | 20 % | 60 % | 20 % | 0 % | 409251218 |
44 | NT_187111 | TTCGT | 2 | 10 | 55535 | 55544 | 0 % | 60 % | 20 % | 20 % | 409251218 |
45 | NT_187111 | CTGGC | 2 | 10 | 57701 | 57710 | 0 % | 20 % | 40 % | 40 % | 409251220 |
46 | NT_187111 | CAGCA | 2 | 10 | 58530 | 58539 | 40 % | 0 % | 20 % | 40 % | 409251221 |
47 | NT_187111 | CCCGA | 2 | 10 | 60444 | 60453 | 20 % | 0 % | 20 % | 60 % | 409251223 |
48 | NT_187111 | ACGCC | 2 | 10 | 60961 | 60970 | 20 % | 0 % | 20 % | 60 % | 409251223 |
49 | NT_187111 | AATGC | 2 | 10 | 62183 | 62192 | 40 % | 20 % | 20 % | 20 % | 409251224 |
50 | NT_187111 | ATCAG | 2 | 10 | 65393 | 65402 | 40 % | 20 % | 20 % | 20 % | 409251227 |
51 | NT_187111 | TCTGC | 2 | 10 | 67824 | 67833 | 0 % | 40 % | 20 % | 40 % | 409251228 |
52 | NT_187111 | GGCTG | 2 | 10 | 68047 | 68056 | 0 % | 20 % | 60 % | 20 % | 409251228 |
53 | NT_187111 | GCATG | 2 | 10 | 70073 | 70082 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 409251229 |
54 | NT_187111 | CCGCG | 2 | 10 | 72560 | 72569 | 0 % | 0 % | 40 % | 60 % | 409251231 |
55 | NT_187111 | AGTTC | 2 | 10 | 72915 | 72924 | 20 % | 40 % | 20 % | 20 % | 409251232 |
56 | NT_187111 | GCGCA | 2 | 10 | 74316 | 74325 | 20 % | 0 % | 40 % | 40 % | 409251233 |
57 | NT_187111 | CTGCG | 2 | 10 | 74730 | 74739 | 0 % | 20 % | 40 % | 40 % | 409251233 |
58 | NT_187111 | GCCAG | 2 | 10 | 76221 | 76230 | 20 % | 0 % | 40 % | 40 % | 409251234 |
59 | NT_187111 | CGGCG | 2 | 10 | 79071 | 79080 | 0 % | 0 % | 60 % | 40 % | 409251238 |
60 | NT_187111 | GCCAG | 2 | 10 | 79520 | 79529 | 20 % | 0 % | 40 % | 40 % | 409251238 |
61 | NT_187111 | ACGGT | 2 | 10 | 80188 | 80197 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 409251238 |
62 | NT_187111 | GCCGC | 2 | 10 | 80809 | 80818 | 0 % | 0 % | 40 % | 60 % | 409251238 |
63 | NT_187111 | TACGC | 2 | 10 | 81832 | 81841 | 20 % | 20 % | 20 % | 40 % | 409251238 |
64 | NT_187111 | GGCTG | 2 | 10 | 82739 | 82748 | 0 % | 20 % | 60 % | 20 % | 409251240 |
65 | NT_187111 | ACGCA | 2 | 10 | 86255 | 86264 | 40 % | 0 % | 20 % | 40 % | 409251243 |
66 | NT_187111 | CGCAT | 2 | 10 | 86358 | 86367 | 20 % | 20 % | 20 % | 40 % | 409251243 |
67 | NT_187111 | CACGC | 2 | 10 | 87943 | 87952 | 20 % | 0 % | 20 % | 60 % | 409251245 |
68 | NT_187111 | AAATA | 2 | 10 | 89725 | 89734 | 80 % | 20 % | 0 % | 0 % | 409251247 |
69 | NT_187111 | AATTA | 2 | 10 | 90912 | 90921 | 60 % | 40 % | 0 % | 0 % | 409251248 |
70 | NT_187111 | TTTCA | 2 | 10 | 92494 | 92503 | 20 % | 60 % | 0 % | 20 % | 409251251 |
71 | NT_187111 | GTAGC | 2 | 10 | 93759 | 93768 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 409251252 |
72 | NT_187111 | AGCGT | 2 | 10 | 96629 | 96638 | 20 % | 20 % | 40 % | 20 % | 409251255 |
73 | NT_187111 | GAATT | 2 | 10 | 99241 | 99250 | 40 % | 40 % | 20 % | 0 % | 409251257 |