MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187109	TTTCGG	2	12	785	796	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	409251068
2	NT_187109	GCATCG	2	12	3335	3346	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409251070
3	NT_187109	TCGCCG	2	12	5736	5747	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409251071
4	NT_187109	TCCCGA	2	12	6696	6707	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409251072
5	NT_187109	CCAGCG	2	12	7928	7939	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409251074
6	NT_187109	CGGGCG	2	12	10630	10641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251076
7	NT_187109	TTTCGC	2	12	10738	10749	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	409251076
8	NT_187109	CGGTGC	2	12	12324	12335	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409251076
9	NT_187109	CAGGAA	2	12	14083	14094	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	409251078
10	NT_187109	CTGGAA	2	12	20253	20264	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409251085
11	NT_187109	ATGAGT	2	12	20650	20661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251085
12	NT_187109	TGCGGC	2	12	25884	25895	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409251090
13	NT_187109	CGGCTA	2	12	33551	33562	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409251098
14	NT_187109	GCCTGC	2	12	39904	39915	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409251106
15	NT_187109	TACGCT	2	12	40144	40155	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409251107
16	NT_187109	TAATAT	2	12	40584	40595	50 %	50 %	0 %	0 %	409251107
17	NT_187109	GAGGAA	2	12	47310	47321	50 %	0 %	50 %	0 %	409251115
18	NT_187109	CCCGCG	2	12	47910	47921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251116
19	NT_187109	ACGTGG	2	12	50496	50507	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409251119
20	NT_187109	GTCGGC	2	12	51033	51044	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409251120
21	NT_187109	TCACCG	2	12	52183	52194	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409251121
22	NT_187109	ACCGGC	2	12	57623	57634	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409251125
23	NT_187109	GCGATA	2	12	59545	59556	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409251128
24	NT_187109	CGGCTG	2	12	60701	60712	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409251129
25	NT_187109	TTCCGG	2	12	64207	64218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251134
26	NT_187109	TGACCG	2	12	66485	66496	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409251136
27	NT_187109	GGAAAT	2	12	67998	68009	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	409251137
28	NT_187109	TGCCGG	2	12	69247	69258	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409251139
29	NT_187109	GAACCA	2	12	70300	70311	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	409251140
30	NT_187109	CCGCTG	2	12	75175	75186	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409251143
31	NT_187109	CGCTGG	2	12	75962	75973	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409251143
32	NT_187109	GGCGTG	2	12	80679	80690	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	409251147
33	NT_187109	GCCCCT	2	12	84051	84062	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	409251150
34	NT_187109	CTAACG	2	12	86578	86589	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409251152
35	NT_187109	CCGCGC	2	12	89373	89384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251156
36	NT_187109	TATCGC	2	12	89868	89879	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409251156
37	NT_187109	GCACCA	2	12	93485	93496	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	409251159
38	NT_187109	CGCGTT	2	12	94514	94525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251160
39	NT_187109	TGGCCA	2	12	94708	94719	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409251160
40	NT_187109	AGCGCC	2	12	95553	95564	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409251160
41	NT_187109	TCAGGC	2	12	96962	96973	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409251163
42	NT_187109	ACCAGC	2	12	98410	98421	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	409251164

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.