MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187109	CGGCG	2	10	4185	4194	0 %	0 %	60 %	40 %	409251070
2	NT_187109	GCGCC	2	10	4792	4801	0 %	0 %	40 %	60 %	409251071
3	NT_187109	TAGCG	2	10	7893	7902	20 %	20 %	40 %	20 %	409251074
4	NT_187109	CAGTA	2	10	9219	9228	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NT_187109	GCCAG	2	10	12669	12678	20 %	0 %	40 %	40 %	409251076
6	NT_187109	CATGC	2	10	13035	13044	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NT_187109	CATGC	2	10	13153	13162	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NT_187109	CTGCC	2	10	14191	14200	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NT_187109	CACCG	2	10	14766	14775	20 %	0 %	20 %	60 %	409251079
10	NT_187109	CACCG	2	10	14904	14913	20 %	0 %	20 %	60 %	409251079
11	NT_187109	TGCGC	2	10	16352	16361	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NT_187109	ACACC	2	10	16637	16646	40 %	0 %	0 %	60 %	409251080
13	NT_187109	CAATA	2	10	19787	19796	60 %	20 %	0 %	20 %	409251084
14	NT_187109	GTTCA	2	10	21601	21610	20 %	40 %	20 %	20 %	409251086
15	NT_187109	GGCGC	2	10	22853	22862	0 %	0 %	60 %	40 %	409251087
16	NT_187109	GCCGC	2	10	22903	22912	0 %	0 %	40 %	60 %	409251087
17	NT_187109	TCACG	2	10	23438	23447	20 %	20 %	20 %	40 %	409251089
18	NT_187109	CAAGC	2	10	24048	24057	40 %	0 %	20 %	40 %	409251089
19	NT_187109	GCGCG	2	10	24231	24240	0 %	0 %	60 %	40 %	409251089
20	NT_187109	GGCCG	2	10	25490	25499	0 %	0 %	60 %	40 %	409251090
21	NT_187109	TCACC	2	10	28409	28418	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
22	NT_187109	CTGAC	2	10	29511	29520	20 %	20 %	20 %	40 %	409251094
23	NT_187109	ATGAT	2	10	30429	30438	40 %	40 %	20 %	0 %	409251094
24	NT_187109	AGCAG	2	10	30673	30682	40 %	0 %	40 %	20 %	409251094
25	NT_187109	CGCTG	2	10	33343	33352	0 %	20 %	40 %	40 %	409251098
26	NT_187109	CCTCG	2	10	35646	35655	0 %	20 %	20 %	60 %	409251101
27	NT_187109	AAGCG	2	10	36128	36137	40 %	0 %	40 %	20 %	409251102
28	NT_187109	GTCGC	2	10	36946	36955	0 %	20 %	40 %	40 %	409251103
29	NT_187109	GCGCT	2	10	41091	41100	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NT_187109	AAGCG	2	10	42131	42140	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NT_187109	CAGAA	2	10	43174	43183	60 %	0 %	20 %	20 %	409251110
32	NT_187109	TACCG	2	10	43483	43492	20 %	20 %	20 %	40 %	409251111
33	NT_187109	TGAAA	2	10	43772	43781	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187109	CGATA	2	10	43823	43832	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NT_187109	GCACC	2	10	45172	45181	20 %	0 %	20 %	60 %	409251113
36	NT_187109	ACAGT	2	10	46074	46083	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NT_187109	ACGCG	2	10	46598	46607	20 %	0 %	40 %	40 %	409251115
38	NT_187109	CCTGG	2	10	46661	46670	0 %	20 %	40 %	40 %	409251115
39	NT_187109	CTTCA	2	10	46735	46744	20 %	40 %	0 %	40 %	409251115
40	NT_187109	CTTTA	2	10	46812	46821	20 %	60 %	0 %	20 %	409251115
41	NT_187109	AGCTA	2	10	47290	47299	40 %	20 %	20 %	20 %	409251115
42	NT_187109	TGCGC	2	10	48992	49001	0 %	20 %	40 %	40 %	409251117
43	NT_187109	CGGCG	2	10	50649	50658	0 %	0 %	60 %	40 %	409251119
44	NT_187109	CGGCG	2	10	50688	50697	0 %	0 %	60 %	40 %	409251119
45	NT_187109	CGAAC	2	10	52946	52955	40 %	0 %	20 %	40 %	409251121
46	NT_187109	CGCCA	2	10	53623	53632	20 %	0 %	20 %	60 %	409251122
47	NT_187109	ATCGC	2	10	55087	55096	20 %	20 %	20 %	40 %	409251123
48	NT_187109	TGGCC	2	10	55199	55208	0 %	20 %	40 %	40 %	409251123
49	NT_187109	GGCGT	2	10	55411	55420	0 %	20 %	60 %	20 %	409251123
50	NT_187109	TGCGC	2	10	58843	58852	0 %	20 %	40 %	40 %	409251127
51	NT_187109	CATCG	2	10	58973	58982	20 %	20 %	20 %	40 %	409251127
52	NT_187109	GCGCG	2	10	60550	60559	0 %	0 %	60 %	40 %	409251129
53	NT_187109	CAGGC	2	10	60912	60921	20 %	0 %	40 %	40 %	409251130
54	NT_187109	ACATC	2	10	60984	60993	40 %	20 %	0 %	40 %	409251130
55	NT_187109	GGACC	2	10	62913	62922	20 %	0 %	40 %	40 %	409251134
56	NT_187109	CGGAT	2	10	63568	63577	20 %	20 %	40 %	20 %	409251134
57	NT_187109	ACTTT	2	10	65328	65337	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NT_187109	CGGCG	2	10	67103	67112	0 %	0 %	60 %	40 %	409251136
59	NT_187109	AGTTG	2	10	70322	70331	20 %	40 %	40 %	0 %	409251140
60	NT_187109	GGTCA	2	10	70406	70415	20 %	20 %	40 %	20 %	409251140
61	NT_187109	CCCAT	2	10	70952	70961	20 %	20 %	0 %	60 %	409251141
62	NT_187109	ATAAA	2	10	71114	71123	80 %	20 %	0 %	0 %	409251141
63	NT_187109	TAAAA	2	10	71984	71993	80 %	20 %	0 %	0 %	409251141
64	NT_187109	GCGCG	2	10	73747	73756	0 %	0 %	60 %	40 %	409251142
65	NT_187109	TGTGT	2	10	73873	73882	0 %	60 %	40 %	0 %	409251142
66	NT_187109	CGCTG	2	10	74245	74254	0 %	20 %	40 %	40 %	409251142
67	NT_187109	CGCGG	2	10	80801	80810	0 %	0 %	60 %	40 %	409251147
68	NT_187109	CGCGC	2	10	81134	81143	0 %	0 %	40 %	60 %	409251147
69	NT_187109	GATGA	2	10	81308	81317	40 %	20 %	40 %	0 %	409251147
70	NT_187109	TCGCC	2	10	82233	82242	0 %	20 %	20 %	60 %	409251149
71	NT_187109	AGCAA	2	10	84169	84178	60 %	0 %	20 %	20 %	409251150
72	NT_187109	TAGCG	2	10	86534	86543	20 %	20 %	40 %	20 %	409251152
73	NT_187109	ATGAA	2	10	88247	88256	60 %	20 %	20 %	0 %	409251154
74	NT_187109	GGGCA	2	10	90639	90648	20 %	0 %	60 %	20 %	409251157
75	NT_187109	TTCGA	2	10	91471	91480	20 %	40 %	20 %	20 %	409251158
76	NT_187109	AATGG	2	10	92992	93001	40 %	20 %	40 %	0 %	409251159
77	NT_187109	AGCGC	2	10	94660	94669	20 %	0 %	40 %	40 %	409251160
78	NT_187109	ACATC	2	10	97817	97826	40 %	20 %	0 %	40 %	409251163
79	NT_187109	CGGCG	2	10	98400	98409	0 %	0 %	60 %	40 %	409251164
80	NT_187109	CTTTT	2	10	99135	99144	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NT_187109	GTACC	2	10	100183	100192	20 %	20 %	20 %	40 %	409251165
82	NT_187109	CTCCG	2	10	100225	100234	0 %	20 %	20 %	60 %	409251165
83	NT_187109	GCGAA	2	10	100400	100409	40 %	0 %	40 %	20 %	409251166
84	NT_187109	CTGAA	2	10	101329	101338	40 %	20 %	20 %	20 %	409251167
85	NT_187109	TCTCA	2	10	102482	102491	20 %	40 %	0 %	40 %	409251167
86	NT_187109	TACGT	2	10	103506	103515	20 %	40 %	20 %	20 %	409251168
87	NT_187109	GCCGC	3	15	104793	104807	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
88	NT_187109	CAAAC	2	10	105374	105383	60 %	0 %	0 %	40 %	409251169
89	NT_187109	GCGCC	2	10	105585	105594	0 %	0 %	40 %	60 %	409251169

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.