MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187108	CCTG	2	8	33	40	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NT_187108	AACG	2	8	84	91	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NT_187108	GATG	2	8	168	175	25 %	25 %	50 %	0 %	409251044
4	NT_187108	AAAT	2	8	610	617	75 %	25 %	0 %	0 %	409251045
5	NT_187108	AGCA	2	8	622	629	50 %	0 %	25 %	25 %	409251045
6	NT_187108	AATA	2	8	910	917	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187108	ATCA	2	8	1600	1607	50 %	25 %	0 %	25 %	409251048
8	NT_187108	GATT	2	8	1609	1616	25 %	50 %	25 %	0 %	409251048
9	NT_187108	CTCC	2	8	1826	1833	0 %	25 %	0 %	75 %	409251048
10	NT_187108	ACCA	2	8	1889	1896	50 %	0 %	0 %	50 %	409251048
11	NT_187108	TATG	2	8	3180	3187	25 %	50 %	25 %	0 %	409251051
12	NT_187108	AGAA	2	8	3329	3336	75 %	0 %	25 %	0 %	409251051
13	NT_187108	CATC	2	8	3359	3366	25 %	25 %	0 %	50 %	409251051
14	NT_187108	TGAA	2	8	3594	3601	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187108	ATTT	2	8	3773	3780	25 %	75 %	0 %	0 %	409251052
16	NT_187108	GGCT	2	8	4212	4219	0 %	25 %	50 %	25 %	409251052
17	NT_187108	TCTT	2	8	5408	5415	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NT_187108	CAGC	2	8	5785	5792	25 %	0 %	25 %	50 %	409251055
19	NT_187108	TTGC	2	8	6213	6220	0 %	50 %	25 %	25 %	409251056
20	NT_187108	CCGC	2	8	6324	6331	0 %	0 %	25 %	75 %	409251056
21	NT_187108	ATTC	2	8	6951	6958	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NT_187108	ACTA	2	8	7101	7108	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NT_187108	TCCA	2	8	7164	7171	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NT_187108	CATT	2	8	7482	7489	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NT_187108	CGCC	2	8	8158	8165	0 %	0 %	25 %	75 %	409251057
26	NT_187108	AACC	2	8	8187	8194	50 %	0 %	0 %	50 %	409251057
27	NT_187108	CCAG	2	8	8261	8268	25 %	0 %	25 %	50 %	409251057
28	NT_187108	AATA	2	8	8528	8535	75 %	25 %	0 %	0 %	409251057
29	NT_187108	GCAG	2	8	9211	9218	25 %	0 %	50 %	25 %	409251059
30	NT_187108	GACC	2	8	9740	9747	25 %	0 %	25 %	50 %	409251059
31	NT_187108	CACG	2	8	10021	10028	25 %	0 %	25 %	50 %	409251059
32	NT_187108	GCCT	2	8	10034	10041	0 %	25 %	25 %	50 %	409251059
33	NT_187108	GCCA	2	8	10301	10308	25 %	0 %	25 %	50 %	409251060
34	NT_187108	TAAA	2	8	10703	10710	75 %	25 %	0 %	0 %	409251060
35	NT_187108	CTGC	2	8	10866	10873	0 %	25 %	25 %	50 %	409251060
36	NT_187108	TTGA	2	8	11127	11134	25 %	50 %	25 %	0 %	409251060
37	NT_187108	CTGA	2	8	11799	11806	25 %	25 %	25 %	25 %	409251060
38	NT_187108	CGTA	2	8	11841	11848	25 %	25 %	25 %	25 %	409251060
39	NT_187108	GCCA	2	8	12219	12226	25 %	0 %	25 %	50 %	409251061
40	NT_187108	AGCG	2	8	12944	12951	25 %	0 %	50 %	25 %	409251061
41	NT_187108	CTGG	2	8	13031	13038	0 %	25 %	50 %	25 %	409251061
42	NT_187108	AGCC	2	8	14011	14018	25 %	0 %	25 %	50 %	409251063
43	NT_187108	CTAT	2	8	14583	14590	25 %	50 %	0 %	25 %	409251063
44	NT_187108	TTCC	2	8	14661	14668	0 %	50 %	0 %	50 %	409251063
45	NT_187108	GGCT	2	8	14681	14688	0 %	25 %	50 %	25 %	409251063
46	NT_187108	TGTC	2	8	14752	14759	0 %	50 %	25 %	25 %	409251063
47	NT_187108	CTAT	2	8	15178	15185	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NT_187108	GAGT	2	8	15239	15246	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187108	TAAA	2	8	15483	15490	75 %	25 %	0 %	0 %	409251064
50	NT_187108	GCCT	2	8	15891	15898	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NT_187108	AAGT	2	8	16018	16025	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187108	AAAT	2	8	17542	17549	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.