MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 172

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187108	TGA	3	9	674	682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251045
2	NT_187108	TAA	2	6	1277	1282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251047
3	NT_187108	CAA	2	6	1573	1578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251048
4	NT_187108	TGC	2	6	1639	1644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251048
5	NT_187108	GGT	2	6	1673	1678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251048
6	NT_187108	TGC	2	6	1699	1704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251048
7	NT_187108	GCA	2	6	1949	1954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251048
8	NT_187108	ATT	2	6	2005	2010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409251048
9	NT_187108	GAT	2	6	2021	2026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251048
10	NT_187108	GGC	2	6	2080	2085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251048
11	NT_187108	TAG	2	6	2095	2100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251049
12	NT_187108	ATC	2	6	2117	2122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251049
13	NT_187108	ACA	2	6	2449	2454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251049
14	NT_187108	AGC	2	6	2455	2460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251049
15	NT_187108	CAG	2	6	2483	2488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251049
16	NT_187108	TGA	3	9	2530	2538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251049
17	NT_187108	GAA	2	6	2698	2703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251050
18	NT_187108	TCA	2	6	2740	2745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251050
19	NT_187108	TGG	2	6	2785	2790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251050
20	NT_187108	CAT	2	6	2924	2929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251050
21	NT_187108	GTG	2	6	2988	2993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251050
22	NT_187108	TCG	2	6	3017	3022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251050
23	NT_187108	TGA	2	6	3093	3098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251050
24	NT_187108	AAT	2	6	3149	3154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251050
25	NT_187108	CGC	2	6	3202	3207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251051
26	NT_187108	AAG	2	6	3644	3649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251052
27	NT_187108	CAC	2	6	3683	3688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251052
28	NT_187108	GGA	2	6	3747	3752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409251052
29	NT_187108	GCG	2	6	3760	3765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251052
30	NT_187108	TGA	2	6	4002	4007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251052
31	NT_187108	CAA	2	6	4032	4037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251052
32	NT_187108	ATG	2	6	4046	4051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251052
33	NT_187108	GGA	2	6	4117	4122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409251052
34	NT_187108	ATT	2	6	4266	4271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409251052
35	NT_187108	ACG	2	6	4351	4356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251053
36	NT_187108	CGA	2	6	4363	4368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251053
37	NT_187108	GCG	2	6	4384	4389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251053
38	NT_187108	GAT	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251053
39	NT_187108	ACA	2	6	4454	4459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251053
40	NT_187108	GCT	2	6	4463	4468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251053
41	NT_187108	TGA	2	6	4604	4609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251053
42	NT_187108	CGC	2	6	4619	4624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251053
43	NT_187108	GCT	2	6	4640	4645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251053
44	NT_187108	GAT	2	6	4719	4724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251053
45	NT_187108	AAG	2	6	4731	4736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251053
46	NT_187108	CGC	2	6	4892	4897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251053
47	NT_187108	GGC	2	6	4967	4972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251054
48	NT_187108	TGC	2	6	5037	5042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251054
49	NT_187108	GCT	2	6	5066	5071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251054
50	NT_187108	CAT	2	6	5337	5342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251054
51	NT_187108	ATT	2	6	5592	5597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409251055
52	NT_187108	AGC	2	6	5729	5734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251055
53	NT_187108	GAT	2	6	5749	5754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251055
54	NT_187108	TGA	2	6	5823	5828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251055
55	NT_187108	CTC	2	6	6097	6102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409251056
56	NT_187108	GGT	2	6	6125	6130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251056
57	NT_187108	GTG	2	6	6318	6323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251056
58	NT_187108	TGC	2	6	6396	6401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251056
59	NT_187108	TGC	2	6	6404	6409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251056
60	NT_187108	GAT	2	6	6522	6527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251056
61	NT_187108	GCA	3	9	6630	6638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251056
62	NT_187108	CAG	2	6	6642	6647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251056
63	NT_187108	ATG	2	6	6656	6661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251056
64	NT_187108	TTA	3	9	7704	7712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409251057
65	NT_187108	CCA	2	6	7731	7736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251057
66	NT_187108	CTT	2	6	7789	7794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251057
67	NT_187108	ATA	2	6	7871	7876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251057
68	NT_187108	GCT	2	6	8269	8274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251057
69	NT_187108	ATC	2	6	8574	8579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251057
70	NT_187108	TGA	2	6	8643	8648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251058
71	NT_187108	TCG	2	6	8667	8672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251058
72	NT_187108	TTA	2	6	8686	8691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409251058
73	NT_187108	TGA	2	6	8976	8981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251059
74	NT_187108	TAA	2	6	8998	9003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251059
75	NT_187108	GAA	2	6	9052	9057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251059
76	NT_187108	GCA	2	6	9088	9093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251059
77	NT_187108	ATT	2	6	9159	9164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409251059
78	NT_187108	GAT	2	6	9199	9204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251059
79	NT_187108	ATC	2	6	9254	9259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251059
80	NT_187108	AGT	2	6	9307	9312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251059
81	NT_187108	GCC	2	6	9339	9344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251059
82	NT_187108	CCA	2	6	9349	9354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251059
83	NT_187108	CCA	2	6	9373	9378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251059
84	NT_187108	TGC	2	6	9423	9428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251059
85	NT_187108	CCT	2	6	9471	9476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409251059
86	NT_187108	GTT	2	6	9646	9651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251059
87	NT_187108	CTG	2	6	9713	9718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251059
88	NT_187108	GCC	2	6	9727	9732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251059
89	NT_187108	TGA	2	6	9903	9908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251059
90	NT_187108	TCA	3	9	10080	10088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251059
91	NT_187108	TCA	2	6	10107	10112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251059
92	NT_187108	CAT	2	6	10118	10123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251059
93	NT_187108	GCA	2	6	10145	10150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251060
94	NT_187108	TGG	2	6	10259	10264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251060
95	NT_187108	CGC	2	6	10371	10376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251060
96	NT_187108	CTG	2	6	10425	10430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251060
97	NT_187108	CGC	2	6	10445	10450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251060
98	NT_187108	TGG	2	6	10498	10503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251060
99	NT_187108	TAA	2	6	10512	10517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251060
100	NT_187108	GCC	2	6	10525	10530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251060
101	NT_187108	CGG	2	6	10582	10587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251060
102	NT_187108	CAG	2	6	11058	11063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251060
103	NT_187108	CGC	2	6	11096	11101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251060
104	NT_187108	ACT	2	6	11154	11159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251060
105	NT_187108	AGC	2	6	11176	11181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251060
106	NT_187108	CCG	2	6	11369	11374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251060
107	NT_187108	ATT	2	6	11427	11432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409251060
108	NT_187108	GTC	2	6	11466	11471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251060
109	NT_187108	CTG	3	9	11508	11516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251060
110	NT_187108	CTG	2	6	11598	11603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251060
111	NT_187108	GTG	2	6	11638	11643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251060
112	NT_187108	ATC	2	6	11646	11651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251060
113	NT_187108	TGT	2	6	11708	11713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251060
114	NT_187108	AAT	2	6	11832	11837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251060
115	NT_187108	CGT	2	6	11862	11867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251060
116	NT_187108	TCA	2	6	11959	11964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251060
117	NT_187108	AAT	2	6	12100	12105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251060
118	NT_187108	CAT	2	6	12179	12184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251061
119	NT_187108	TAT	2	6	12205	12210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409251061
120	NT_187108	GCT	2	6	12239	12244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251061
121	NT_187108	CGG	2	6	12428	12433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251061
122	NT_187108	TGT	2	6	12450	12455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251061
123	NT_187108	TAA	2	6	12545	12550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251061
124	NT_187108	CAG	2	6	12782	12787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251061
125	NT_187108	TGC	2	6	12816	12821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251061
126	NT_187108	CCA	2	6	12832	12837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251061
127	NT_187108	GGC	2	6	12924	12929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251061
128	NT_187108	CGC	2	6	13307	13312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251061
129	NT_187108	AAC	2	6	13455	13460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251062
130	NT_187108	AAT	2	6	13469	13474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251062
131	NT_187108	GCA	2	6	13522	13527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251062
132	NT_187108	AAT	2	6	13572	13577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251062
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.