MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187107	ACGTT	2	10	1116	1125	20 %	40 %	20 %	20 %	409250981
2	NT_187107	CATCG	2	10	2900	2909	20 %	20 %	20 %	40 %	409250983
3	NT_187107	GGATG	2	10	4733	4742	20 %	20 %	60 %	0 %	409250984
4	NT_187107	CCACG	2	10	5419	5428	20 %	0 %	20 %	60 %	409250984
5	NT_187107	GCGTC	2	10	6317	6326	0 %	20 %	40 %	40 %	409250986
6	NT_187107	GGCAG	2	10	7559	7568	20 %	0 %	60 %	20 %	409250988
7	NT_187107	AAGCG	2	10	11059	11068	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NT_187107	CCGAT	2	10	11265	11274	20 %	20 %	20 %	40 %	409250992
9	NT_187107	CAATC	2	10	12593	12602	40 %	20 %	0 %	40 %	409250994
10	NT_187107	CGGGC	2	10	13007	13016	0 %	0 %	60 %	40 %	409250994
11	NT_187107	CCAGT	2	10	13153	13162	20 %	20 %	20 %	40 %	409250994
12	NT_187107	GCGCG	2	10	14595	14604	0 %	0 %	60 %	40 %	409250995
13	NT_187107	GTAAC	2	10	18338	18347	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NT_187107	CGATG	2	10	18652	18661	20 %	20 %	40 %	20 %	409250999
15	NT_187107	CAGAA	2	10	19978	19987	60 %	0 %	20 %	20 %	409251000
16	NT_187107	CAGAC	2	10	21401	21410	40 %	0 %	20 %	40 %	409251001
17	NT_187107	GAATG	2	10	23001	23010	40 %	20 %	40 %	0 %	409251001
18	NT_187107	AAATA	2	10	23288	23297	80 %	20 %	0 %	0 %	409251001
19	NT_187107	CGTAT	2	10	23600	23609	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NT_187107	CATTC	2	10	23984	23993	20 %	40 %	0 %	40 %	409251002
21	NT_187107	ATAAG	2	10	24525	24534	60 %	20 %	20 %	0 %	409251002
22	NT_187107	TGGTG	2	10	24852	24861	0 %	40 %	60 %	0 %	409251002
23	NT_187107	CCACA	2	10	24872	24881	40 %	0 %	0 %	60 %	409251002
24	NT_187107	GCATT	2	10	26041	26050	20 %	40 %	20 %	20 %	409251004
25	NT_187107	TTCTG	2	10	27831	27840	0 %	60 %	20 %	20 %	409251004
26	NT_187107	TCTGG	2	10	28983	28992	0 %	40 %	40 %	20 %	409251005
27	NT_187107	GCCTG	2	10	29459	29468	0 %	20 %	40 %	40 %	409251006
28	NT_187107	ACGTC	2	10	29984	29993	20 %	20 %	20 %	40 %	409251007
29	NT_187107	GTCAG	2	10	30510	30519	20 %	20 %	40 %	20 %	409251008
30	NT_187107	CGAAC	2	10	32085	32094	40 %	0 %	20 %	40 %	409251009
31	NT_187107	TCATA	2	10	32344	32353	40 %	40 %	0 %	20 %	409251009
32	NT_187107	TCAAC	2	10	34495	34504	40 %	20 %	0 %	40 %	409251012
33	NT_187107	TTTTC	2	10	37986	37995	0 %	80 %	0 %	20 %	409251015
34	NT_187107	AGGAT	2	10	38620	38629	40 %	20 %	40 %	0 %	409251015
35	NT_187107	TGCTC	2	10	39612	39621	0 %	40 %	20 %	40 %	409251016
36	NT_187107	TCACC	2	10	39745	39754	20 %	20 %	0 %	60 %	409251016
37	NT_187107	ACGCC	2	10	43510	43519	20 %	0 %	20 %	60 %	409251024
38	NT_187107	GAGCG	2	10	43896	43905	20 %	0 %	60 %	20 %	409251024
39	NT_187107	TTTCG	2	10	45565	45574	0 %	60 %	20 %	20 %	409251030
40	NT_187107	TCTTT	2	10	46073	46082	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NT_187107	TTCCA	2	10	46129	46138	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NT_187107	TTGGT	2	10	46448	46457	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187107	ACGCC	2	10	47292	47301	20 %	0 %	20 %	60 %	409251033
44	NT_187107	CTTCC	2	10	48956	48965	0 %	40 %	0 %	60 %	409251036
45	NT_187107	GATGG	2	10	50854	50863	20 %	20 %	60 %	0 %	409251039

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.