MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187107	TTTC	2	8	395	402	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NT_187107	CTTT	2	8	451	458	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NT_187107	CTTT	2	8	492	499	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NT_187107	GGCG	2	8	688	695	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NT_187107	CATA	2	8	710	717	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NT_187107	GGCC	2	8	901	908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NT_187107	ACGA	2	8	1072	1079	50 %	0 %	25 %	25 %	409250981
8	NT_187107	TATG	2	8	1200	1207	25 %	50 %	25 %	0 %	409250981
9	NT_187107	AATA	2	8	2010	2017	75 %	25 %	0 %	0 %	409250982
10	NT_187107	TGAA	2	8	2231	2238	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187107	TGCA	2	8	2667	2674	25 %	25 %	25 %	25 %	409250983
12	NT_187107	AGGC	2	8	3075	3082	25 %	0 %	50 %	25 %	409250983
13	NT_187107	CTGC	2	8	3265	3272	0 %	25 %	25 %	50 %	409250983
14	NT_187107	TTCA	2	8	3507	3514	25 %	50 %	0 %	25 %	409250983
15	NT_187107	GACC	2	8	4150	4157	25 %	0 %	25 %	50 %	409250984
16	NT_187107	CGTC	2	8	4315	4322	0 %	25 %	25 %	50 %	409250984
17	NT_187107	GCCC	2	8	4564	4571	0 %	0 %	25 %	75 %	409250984
18	NT_187107	GTCA	2	8	5117	5124	25 %	25 %	25 %	25 %	409250984
19	NT_187107	GTCA	2	8	5675	5682	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NT_187107	TTAA	2	8	6031	6038	50 %	50 %	0 %	0 %	409250986
21	NT_187107	AGAT	2	8	6473	6480	50 %	25 %	25 %	0 %	409250986
22	NT_187107	ACCA	2	8	6735	6742	50 %	0 %	0 %	50 %	409250987
23	NT_187107	CATC	2	8	7509	7516	25 %	25 %	0 %	50 %	409250988
24	NT_187107	GGCA	2	8	7907	7914	25 %	0 %	50 %	25 %	409250988
25	NT_187107	AGGT	2	8	8416	8423	25 %	25 %	50 %	0 %	409250989
26	NT_187107	CCAG	2	8	9426	9433	25 %	0 %	25 %	50 %	409250990
27	NT_187107	TTCG	2	8	9604	9611	0 %	50 %	25 %	25 %	409250990
28	NT_187107	CAGC	2	8	9759	9766	25 %	0 %	25 %	50 %	409250990
29	NT_187107	CTCG	2	8	10032	10039	0 %	25 %	25 %	50 %	409250990
30	NT_187107	GCCA	2	8	10594	10601	25 %	0 %	25 %	50 %	409250991
31	NT_187107	CATG	2	8	10821	10828	25 %	25 %	25 %	25 %	409250991
32	NT_187107	TGGC	2	8	10867	10874	0 %	25 %	50 %	25 %	409250991
33	NT_187107	TTGA	2	8	10945	10952	25 %	50 %	25 %	0 %	409250991
34	NT_187107	CAGC	2	8	11034	11041	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NT_187107	TGAA	2	8	11674	11681	50 %	25 %	25 %	0 %	409250993
36	NT_187107	TCAG	2	8	12393	12400	25 %	25 %	25 %	25 %	409250994
37	NT_187107	TGAT	2	8	12888	12895	25 %	50 %	25 %	0 %	409250994
38	NT_187107	CCAG	2	8	13266	13273	25 %	0 %	25 %	50 %	409250994
39	NT_187107	AGGC	2	8	13590	13597	25 %	0 %	50 %	25 %	409250994
40	NT_187107	CATG	2	8	14208	14215	25 %	25 %	25 %	25 %	409250995
41	NT_187107	GGCC	2	8	14278	14285	0 %	0 %	50 %	50 %	409250995
42	NT_187107	AAAG	2	8	15322	15329	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187107	GCCA	2	8	15881	15888	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NT_187107	TTTA	2	8	17423	17430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187107	CCAT	2	8	18230	18237	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NT_187107	CTTC	2	8	18587	18594	0 %	50 %	0 %	50 %	409250999
47	NT_187107	CTGG	2	8	19071	19078	0 %	25 %	50 %	25 %	409250999
48	NT_187107	TCGT	2	8	19589	19596	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NT_187107	TTCG	2	8	20027	20034	0 %	50 %	25 %	25 %	409251000
50	NT_187107	CGTT	2	8	20469	20476	0 %	50 %	25 %	25 %	409251000
51	NT_187107	GGAA	2	8	20634	20641	50 %	0 %	50 %	0 %	409251000
52	NT_187107	TATT	2	8	21053	21060	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187107	GATT	2	8	21125	21132	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187107	CTGG	2	8	21232	21239	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NT_187107	TGGC	2	8	21997	22004	0 %	25 %	50 %	25 %	409251001
56	NT_187107	ATTA	2	8	22100	22107	50 %	50 %	0 %	0 %	409251001
57	NT_187107	ATTC	2	8	22279	22286	25 %	50 %	0 %	25 %	409251001
58	NT_187107	AAAG	2	8	22494	22501	75 %	0 %	25 %	0 %	409251001
59	NT_187107	TTGT	2	8	22770	22777	0 %	75 %	25 %	0 %	409251001
60	NT_187107	ACAG	2	8	23751	23758	50 %	0 %	25 %	25 %	409251002
61	NT_187107	GCCA	2	8	23774	23781	25 %	0 %	25 %	50 %	409251002
62	NT_187107	GCCC	2	8	24264	24271	0 %	0 %	25 %	75 %	409251002
63	NT_187107	AAGA	3	12	24462	24473	75 %	0 %	25 %	0 %	409251002
64	NT_187107	AGAA	2	8	24651	24658	75 %	0 %	25 %	0 %	409251002
65	NT_187107	TAAT	2	8	24844	24851	50 %	50 %	0 %	0 %	409251002
66	NT_187107	CAAT	2	8	24886	24893	50 %	25 %	0 %	25 %	409251002
67	NT_187107	ATTT	2	8	25344	25351	25 %	75 %	0 %	0 %	409251002
68	NT_187107	GTTA	2	8	26120	26127	25 %	50 %	25 %	0 %	409251004
69	NT_187107	CCTG	2	8	26184	26191	0 %	25 %	25 %	50 %	409251004
70	NT_187107	CATC	2	8	26668	26675	25 %	25 %	0 %	50 %	409251004
71	NT_187107	ATTC	2	8	26731	26738	25 %	50 %	0 %	25 %	409251004
72	NT_187107	ACTG	2	8	26986	26993	25 %	25 %	25 %	25 %	409251004
73	NT_187107	TTGC	2	8	27542	27549	0 %	50 %	25 %	25 %	409251004
74	NT_187107	GCCT	2	8	27779	27786	0 %	25 %	25 %	50 %	409251004
75	NT_187107	TCTT	2	8	28331	28338	0 %	75 %	0 %	25 %	409251005
76	NT_187107	CAGG	2	8	30173	30180	25 %	0 %	50 %	25 %	409251007
77	NT_187107	AATC	2	8	30388	30395	50 %	25 %	0 %	25 %	409251008
78	NT_187107	TCCA	2	8	30559	30566	25 %	25 %	0 %	50 %	409251008
79	NT_187107	CTGG	2	8	31547	31554	0 %	25 %	50 %	25 %	409251009
80	NT_187107	CTGT	2	8	32118	32125	0 %	50 %	25 %	25 %	409251009
81	NT_187107	TTCC	2	8	32634	32641	0 %	50 %	0 %	50 %	409251010
82	NT_187107	CATC	2	8	33188	33195	25 %	25 %	0 %	50 %	409251011
83	NT_187107	CATT	2	8	33249	33256	25 %	50 %	0 %	25 %	409251011
84	NT_187107	TCTT	2	8	33332	33339	0 %	75 %	0 %	25 %	409251011
85	NT_187107	GTTA	2	8	33549	33556	25 %	50 %	25 %	0 %	409251012
86	NT_187107	CAGG	2	8	33568	33575	25 %	0 %	50 %	25 %	409251012
87	NT_187107	CAGC	2	8	33841	33848	25 %	0 %	25 %	50 %	409251012
88	NT_187107	GAGT	2	8	35040	35047	25 %	25 %	50 %	0 %	409251013
89	NT_187107	CATC	2	8	35067	35074	25 %	25 %	0 %	50 %	409251013
90	NT_187107	CATA	2	8	36859	36866	50 %	25 %	0 %	25 %	409251014
91	NT_187107	TCTT	2	8	37260	37267	0 %	75 %	0 %	25 %	409251014
92	NT_187107	GCTG	2	8	37883	37890	0 %	25 %	50 %	25 %	409251014
93	NT_187107	CTTC	2	8	38165	38172	0 %	50 %	0 %	50 %	409251015
94	NT_187107	GTTT	2	8	39100	39107	0 %	75 %	25 %	0 %	409251015
95	NT_187107	TGCT	2	8	41034	41041	0 %	50 %	25 %	25 %	409251020
96	NT_187107	TCAG	2	8	41056	41063	25 %	25 %	25 %	25 %	409251020
97	NT_187107	CTTG	2	8	41190	41197	0 %	50 %	25 %	25 %	409251020
98	NT_187107	TGGT	2	8	42438	42445	0 %	50 %	50 %	0 %	409251022
99	NT_187107	ACCG	2	8	42730	42737	25 %	0 %	25 %	50 %	409251023
100	NT_187107	CAGG	2	8	42960	42967	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NT_187107	TAAT	2	8	43322	43329	50 %	50 %	0 %	0 %	409251024
102	NT_187107	TCTG	2	8	44335	44342	0 %	50 %	25 %	25 %	409251026
103	NT_187107	CTTC	2	8	44739	44746	0 %	50 %	0 %	50 %	409251028
104	NT_187107	CTTT	2	8	45354	45361	0 %	75 %	0 %	25 %	409251029
105	NT_187107	AATA	2	8	45674	45681	75 %	25 %	0 %	0 %	409251030
106	NT_187107	TACA	2	8	46931	46938	50 %	25 %	0 %	25 %	409251032
107	NT_187107	AGAC	2	8	47176	47183	50 %	0 %	25 %	25 %	409251033
108	NT_187107	TTTC	2	8	47254	47261	0 %	75 %	0 %	25 %	409251033
109	NT_187107	ATCC	2	8	47437	47444	25 %	25 %	0 %	50 %	409251034
110	NT_187107	TCTG	2	8	47624	47631	0 %	50 %	25 %	25 %	409251035
111	NT_187107	GACA	2	8	48066	48073	50 %	0 %	25 %	25 %	409251035
112	NT_187107	ATCA	2	8	48765	48772	50 %	25 %	0 %	25 %	409251035
113	NT_187107	CGCT	2	8	48911	48918	0 %	25 %	25 %	50 %	409251035
114	NT_187107	AGGA	2	8	49206	49213	50 %	0 %	50 %	0 %	409251036
115	NT_187107	TGAG	2	8	49467	49474	25 %	25 %	50 %	0 %	409251036
116	NT_187107	TTGG	2	8	49515	49522	0 %	50 %	50 %	0 %	409251036
117	NT_187107	CTTT	2	8	49998	50005	0 %	75 %	0 %	25 %	409251037
118	NT_187107	TAGT	2	8	50240	50247	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NT_187107	TAAA	2	8	50589	50596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NT_187107	TAAT	2	8	50604	50611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NT_187107	GGAA	2	8	51099	51106	50 %	0 %	50 %	0 %	409251039
122	NT_187107	TCCC	2	8	51326	51333	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
123	NT_187107	TATT	2	8	51398	51405	25 %	75 %	0 %	0 %	409251040
124	NT_187107	TTGC	2	8	51881	51888	0 %	50 %	25 %	25 %	409251041
125	NT_187107	GAAG	2	8	51901	51908	50 %	0 %	50 %	0 %	409251041

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.