MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187107	ACGA	2	8	1072	1079	50 %	0 %	25 %	25 %	409250981
2	NT_187107	TATG	2	8	1200	1207	25 %	50 %	25 %	0 %	409250981
3	NT_187107	AATA	2	8	2010	2017	75 %	25 %	0 %	0 %	409250982
4	NT_187107	TGCA	2	8	2667	2674	25 %	25 %	25 %	25 %	409250983
5	NT_187107	AGGC	2	8	3075	3082	25 %	0 %	50 %	25 %	409250983
6	NT_187107	CTGC	2	8	3265	3272	0 %	25 %	25 %	50 %	409250983
7	NT_187107	TTCA	2	8	3507	3514	25 %	50 %	0 %	25 %	409250983
8	NT_187107	GACC	2	8	4150	4157	25 %	0 %	25 %	50 %	409250984
9	NT_187107	CGTC	2	8	4315	4322	0 %	25 %	25 %	50 %	409250984
10	NT_187107	GCCC	2	8	4564	4571	0 %	0 %	25 %	75 %	409250984
11	NT_187107	GTCA	2	8	5117	5124	25 %	25 %	25 %	25 %	409250984
12	NT_187107	TTAA	2	8	6031	6038	50 %	50 %	0 %	0 %	409250986
13	NT_187107	AGAT	2	8	6473	6480	50 %	25 %	25 %	0 %	409250986
14	NT_187107	ACCA	2	8	6735	6742	50 %	0 %	0 %	50 %	409250987
15	NT_187107	CATC	2	8	7509	7516	25 %	25 %	0 %	50 %	409250988
16	NT_187107	GGCA	2	8	7907	7914	25 %	0 %	50 %	25 %	409250988
17	NT_187107	AGGT	2	8	8416	8423	25 %	25 %	50 %	0 %	409250989
18	NT_187107	CCAG	2	8	9426	9433	25 %	0 %	25 %	50 %	409250990
19	NT_187107	TTCG	2	8	9604	9611	0 %	50 %	25 %	25 %	409250990
20	NT_187107	CAGC	2	8	9759	9766	25 %	0 %	25 %	50 %	409250990
21	NT_187107	CTCG	2	8	10032	10039	0 %	25 %	25 %	50 %	409250990
22	NT_187107	GCCA	2	8	10594	10601	25 %	0 %	25 %	50 %	409250991
23	NT_187107	CATG	2	8	10821	10828	25 %	25 %	25 %	25 %	409250991
24	NT_187107	TGGC	2	8	10867	10874	0 %	25 %	50 %	25 %	409250991
25	NT_187107	TTGA	2	8	10945	10952	25 %	50 %	25 %	0 %	409250991
26	NT_187107	TGAA	2	8	11674	11681	50 %	25 %	25 %	0 %	409250993
27	NT_187107	TCAG	2	8	12393	12400	25 %	25 %	25 %	25 %	409250994
28	NT_187107	TGAT	2	8	12888	12895	25 %	50 %	25 %	0 %	409250994
29	NT_187107	CCAG	2	8	13266	13273	25 %	0 %	25 %	50 %	409250994
30	NT_187107	AGGC	2	8	13590	13597	25 %	0 %	50 %	25 %	409250994
31	NT_187107	CATG	2	8	14208	14215	25 %	25 %	25 %	25 %	409250995
32	NT_187107	GGCC	2	8	14278	14285	0 %	0 %	50 %	50 %	409250995
33	NT_187107	CTTC	2	8	18587	18594	0 %	50 %	0 %	50 %	409250999
34	NT_187107	CTGG	2	8	19071	19078	0 %	25 %	50 %	25 %	409250999
35	NT_187107	TTCG	2	8	20027	20034	0 %	50 %	25 %	25 %	409251000
36	NT_187107	CGTT	2	8	20469	20476	0 %	50 %	25 %	25 %	409251000
37	NT_187107	GGAA	2	8	20634	20641	50 %	0 %	50 %	0 %	409251000
38	NT_187107	TGGC	2	8	21997	22004	0 %	25 %	50 %	25 %	409251001
39	NT_187107	ATTA	2	8	22100	22107	50 %	50 %	0 %	0 %	409251001
40	NT_187107	ATTC	2	8	22279	22286	25 %	50 %	0 %	25 %	409251001
41	NT_187107	AAAG	2	8	22494	22501	75 %	0 %	25 %	0 %	409251001
42	NT_187107	TTGT	2	8	22770	22777	0 %	75 %	25 %	0 %	409251001
43	NT_187107	ACAG	2	8	23751	23758	50 %	0 %	25 %	25 %	409251002
44	NT_187107	GCCA	2	8	23774	23781	25 %	0 %	25 %	50 %	409251002
45	NT_187107	GCCC	2	8	24264	24271	0 %	0 %	25 %	75 %	409251002
46	NT_187107	AAGA	3	12	24462	24473	75 %	0 %	25 %	0 %	409251002
47	NT_187107	AGAA	2	8	24651	24658	75 %	0 %	25 %	0 %	409251002
48	NT_187107	TAAT	2	8	24844	24851	50 %	50 %	0 %	0 %	409251002
49	NT_187107	CAAT	2	8	24886	24893	50 %	25 %	0 %	25 %	409251002
50	NT_187107	ATTT	2	8	25344	25351	25 %	75 %	0 %	0 %	409251002
51	NT_187107	GTTA	2	8	26120	26127	25 %	50 %	25 %	0 %	409251004
52	NT_187107	CCTG	2	8	26184	26191	0 %	25 %	25 %	50 %	409251004
53	NT_187107	CATC	2	8	26668	26675	25 %	25 %	0 %	50 %	409251004
54	NT_187107	ATTC	2	8	26731	26738	25 %	50 %	0 %	25 %	409251004
55	NT_187107	ACTG	2	8	26986	26993	25 %	25 %	25 %	25 %	409251004
56	NT_187107	TTGC	2	8	27542	27549	0 %	50 %	25 %	25 %	409251004
57	NT_187107	GCCT	2	8	27779	27786	0 %	25 %	25 %	50 %	409251004
58	NT_187107	TCTT	2	8	28331	28338	0 %	75 %	0 %	25 %	409251005
59	NT_187107	CAGG	2	8	30173	30180	25 %	0 %	50 %	25 %	409251007
60	NT_187107	AATC	2	8	30388	30395	50 %	25 %	0 %	25 %	409251008
61	NT_187107	TCCA	2	8	30559	30566	25 %	25 %	0 %	50 %	409251008
62	NT_187107	CTGG	2	8	31547	31554	0 %	25 %	50 %	25 %	409251009
63	NT_187107	CTGT	2	8	32118	32125	0 %	50 %	25 %	25 %	409251009
64	NT_187107	TTCC	2	8	32634	32641	0 %	50 %	0 %	50 %	409251010
65	NT_187107	CATC	2	8	33188	33195	25 %	25 %	0 %	50 %	409251011
66	NT_187107	CATT	2	8	33249	33256	25 %	50 %	0 %	25 %	409251011
67	NT_187107	TCTT	2	8	33332	33339	0 %	75 %	0 %	25 %	409251011
68	NT_187107	GTTA	2	8	33549	33556	25 %	50 %	25 %	0 %	409251012
69	NT_187107	CAGG	2	8	33568	33575	25 %	0 %	50 %	25 %	409251012
70	NT_187107	CAGC	2	8	33841	33848	25 %	0 %	25 %	50 %	409251012
71	NT_187107	GAGT	2	8	35040	35047	25 %	25 %	50 %	0 %	409251013
72	NT_187107	CATC	2	8	35067	35074	25 %	25 %	0 %	50 %	409251013
73	NT_187107	CATA	2	8	36859	36866	50 %	25 %	0 %	25 %	409251014
74	NT_187107	TCTT	2	8	37260	37267	0 %	75 %	0 %	25 %	409251014
75	NT_187107	GCTG	2	8	37883	37890	0 %	25 %	50 %	25 %	409251014
76	NT_187107	CTTC	2	8	38165	38172	0 %	50 %	0 %	50 %	409251015
77	NT_187107	GTTT	2	8	39100	39107	0 %	75 %	25 %	0 %	409251015
78	NT_187107	TGCT	2	8	41034	41041	0 %	50 %	25 %	25 %	409251020
79	NT_187107	TCAG	2	8	41056	41063	25 %	25 %	25 %	25 %	409251020
80	NT_187107	CTTG	2	8	41190	41197	0 %	50 %	25 %	25 %	409251020
81	NT_187107	TGGT	2	8	42438	42445	0 %	50 %	50 %	0 %	409251022
82	NT_187107	ACCG	2	8	42730	42737	25 %	0 %	25 %	50 %	409251023
83	NT_187107	TAAT	2	8	43322	43329	50 %	50 %	0 %	0 %	409251024
84	NT_187107	TCTG	2	8	44335	44342	0 %	50 %	25 %	25 %	409251026
85	NT_187107	CTTC	2	8	44739	44746	0 %	50 %	0 %	50 %	409251028
86	NT_187107	CTTT	2	8	45354	45361	0 %	75 %	0 %	25 %	409251029
87	NT_187107	AATA	2	8	45674	45681	75 %	25 %	0 %	0 %	409251030
88	NT_187107	TACA	2	8	46931	46938	50 %	25 %	0 %	25 %	409251032
89	NT_187107	AGAC	2	8	47176	47183	50 %	0 %	25 %	25 %	409251033
90	NT_187107	TTTC	2	8	47254	47261	0 %	75 %	0 %	25 %	409251033
91	NT_187107	ATCC	2	8	47437	47444	25 %	25 %	0 %	50 %	409251034
92	NT_187107	TCTG	2	8	47624	47631	0 %	50 %	25 %	25 %	409251035
93	NT_187107	GACA	2	8	48066	48073	50 %	0 %	25 %	25 %	409251035
94	NT_187107	ATCA	2	8	48765	48772	50 %	25 %	0 %	25 %	409251035
95	NT_187107	CGCT	2	8	48911	48918	0 %	25 %	25 %	50 %	409251035
96	NT_187107	AGGA	2	8	49206	49213	50 %	0 %	50 %	0 %	409251036
97	NT_187107	TGAG	2	8	49467	49474	25 %	25 %	50 %	0 %	409251036
98	NT_187107	TTGG	2	8	49515	49522	0 %	50 %	50 %	0 %	409251036
99	NT_187107	CTTT	2	8	49998	50005	0 %	75 %	0 %	25 %	409251037
100	NT_187107	GGAA	2	8	51099	51106	50 %	0 %	50 %	0 %	409251039
101	NT_187107	TATT	2	8	51398	51405	25 %	75 %	0 %	0 %	409251040
102	NT_187107	TTGC	2	8	51881	51888	0 %	50 %	25 %	25 %	409251041
103	NT_187107	GAAG	2	8	51901	51908	50 %	0 %	50 %	0 %	409251041

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.