MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187107	AT	3	6	235	240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187107	CG	3	6	786	791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NT_187107	TA	4	8	2052	2059	50 %	50 %	0 %	0 %	409250982
4	NT_187107	CA	3	6	2152	2157	50 %	0 %	0 %	50 %	409250982
5	NT_187107	AG	3	6	2472	2477	50 %	0 %	50 %	0 %	409250983
6	NT_187107	GC	3	6	2758	2763	0 %	0 %	50 %	50 %	409250983
7	NT_187107	CG	3	6	2764	2769	0 %	0 %	50 %	50 %	409250983
8	NT_187107	GA	3	6	3403	3408	50 %	0 %	50 %	0 %	409250983
9	NT_187107	CA	3	6	3624	3629	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NT_187107	CG	3	6	3987	3992	0 %	0 %	50 %	50 %	409250984
11	NT_187107	GC	3	6	4497	4502	0 %	0 %	50 %	50 %	409250984
12	NT_187107	GC	3	6	4596	4601	0 %	0 %	50 %	50 %	409250984
13	NT_187107	CT	3	6	5142	5147	0 %	50 %	0 %	50 %	409250984
14	NT_187107	GC	3	6	5508	5513	0 %	0 %	50 %	50 %	409250984
15	NT_187107	CG	3	6	5779	5784	0 %	0 %	50 %	50 %	409250985
16	NT_187107	GC	3	6	6367	6372	0 %	0 %	50 %	50 %	409250986
17	NT_187107	GC	3	6	6408	6413	0 %	0 %	50 %	50 %	409250986
18	NT_187107	GC	3	6	7588	7593	0 %	0 %	50 %	50 %	409250988
19	NT_187107	CA	3	6	8330	8335	50 %	0 %	0 %	50 %	409250989
20	NT_187107	GC	4	8	8716	8723	0 %	0 %	50 %	50 %	409250989
21	NT_187107	CG	3	6	8916	8921	0 %	0 %	50 %	50 %	409250989
22	NT_187107	GA	3	6	9096	9101	50 %	0 %	50 %	0 %	409250989
23	NT_187107	AT	3	6	9863	9868	50 %	50 %	0 %	0 %	409250990
24	NT_187107	CG	3	6	10070	10075	0 %	0 %	50 %	50 %	409250990
25	NT_187107	GA	3	6	11250	11255	50 %	0 %	50 %	0 %	409250992
26	NT_187107	CG	4	8	11998	12005	0 %	0 %	50 %	50 %	409250994
27	NT_187107	GC	3	6	12032	12037	0 %	0 %	50 %	50 %	409250994
28	NT_187107	GC	3	6	12244	12249	0 %	0 %	50 %	50 %	409250994
29	NT_187107	AT	3	6	12420	12425	50 %	50 %	0 %	0 %	409250994
30	NT_187107	GC	3	6	13068	13073	0 %	0 %	50 %	50 %	409250994
31	NT_187107	GC	4	8	13113	13120	0 %	0 %	50 %	50 %	409250994
32	NT_187107	GC	4	8	13249	13256	0 %	0 %	50 %	50 %	409250994
33	NT_187107	CG	3	6	14039	14044	0 %	0 %	50 %	50 %	409250995
34	NT_187107	CG	3	6	14878	14883	0 %	0 %	50 %	50 %	409250995
35	NT_187107	CG	3	6	15003	15008	0 %	0 %	50 %	50 %	409250995
36	NT_187107	GC	3	6	15085	15090	0 %	0 %	50 %	50 %	409250995
37	NT_187107	AG	3	6	15315	15320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187107	CG	3	6	15846	15851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NT_187107	CG	3	6	16594	16599	0 %	0 %	50 %	50 %	409250997
40	NT_187107	GC	3	6	17611	17616	0 %	0 %	50 %	50 %	409250998
41	NT_187107	AT	3	6	18967	18972	50 %	50 %	0 %	0 %	409250999
42	NT_187107	AT	3	6	20122	20127	50 %	50 %	0 %	0 %	409251000
43	NT_187107	TG	3	6	20945	20950	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187107	AT	3	6	21499	21504	50 %	50 %	0 %	0 %	409251001
45	NT_187107	TA	3	6	21822	21827	50 %	50 %	0 %	0 %	409251001
46	NT_187107	TA	3	6	23066	23071	50 %	50 %	0 %	0 %	409251001
47	NT_187107	TA	3	6	23869	23874	50 %	50 %	0 %	0 %	409251002
48	NT_187107	TA	3	6	24104	24109	50 %	50 %	0 %	0 %	409251002
49	NT_187107	AT	3	6	24495	24500	50 %	50 %	0 %	0 %	409251002
50	NT_187107	TA	3	6	24722	24727	50 %	50 %	0 %	0 %	409251002
51	NT_187107	TA	3	6	25544	25549	50 %	50 %	0 %	0 %	409251002
52	NT_187107	GC	3	6	26367	26372	0 %	0 %	50 %	50 %	409251004
53	NT_187107	TG	3	6	27104	27109	0 %	50 %	50 %	0 %	409251004
54	NT_187107	GA	3	6	27160	27165	50 %	0 %	50 %	0 %	409251004
55	NT_187107	TA	3	6	28197	28202	50 %	50 %	0 %	0 %	409251005
56	NT_187107	AT	3	6	30124	30129	50 %	50 %	0 %	0 %	409251007
57	NT_187107	CA	3	6	31526	31531	50 %	0 %	0 %	50 %	409251009
58	NT_187107	TG	3	6	32106	32111	0 %	50 %	50 %	0 %	409251009
59	NT_187107	CT	3	6	33131	33136	0 %	50 %	0 %	50 %	409251011
60	NT_187107	TA	3	6	33495	33500	50 %	50 %	0 %	0 %	409251011
61	NT_187107	CT	4	8	35764	35771	0 %	50 %	0 %	50 %	409251014
62	NT_187107	CT	3	6	35948	35953	0 %	50 %	0 %	50 %	409251014
63	NT_187107	GC	3	6	36624	36629	0 %	0 %	50 %	50 %	409251014
64	NT_187107	CA	3	6	38405	38410	50 %	0 %	0 %	50 %	409251015
65	NT_187107	CT	4	8	38605	38612	0 %	50 %	0 %	50 %	409251015
66	NT_187107	GT	3	6	39352	39357	0 %	50 %	50 %	0 %	409251015
67	NT_187107	AG	3	6	40285	40290	50 %	0 %	50 %	0 %	409251017
68	NT_187107	TC	3	6	40982	40987	0 %	50 %	0 %	50 %	409251020
69	NT_187107	GA	3	6	41728	41733	50 %	0 %	50 %	0 %	409251021
70	NT_187107	AG	3	6	42045	42050	50 %	0 %	50 %	0 %	409251021
71	NT_187107	TC	3	6	42475	42480	0 %	50 %	0 %	50 %	409251022
72	NT_187107	TC	3	6	43644	43649	0 %	50 %	0 %	50 %	409251024
73	NT_187107	TC	3	6	44137	44142	0 %	50 %	0 %	50 %	409251025
74	NT_187107	GT	4	8	44386	44393	0 %	50 %	50 %	0 %	409251027
75	NT_187107	CA	3	6	44637	44642	50 %	0 %	0 %	50 %	409251028
76	NT_187107	CG	3	6	45631	45636	0 %	0 %	50 %	50 %	409251030
77	NT_187107	AC	4	8	46316	46323	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NT_187107	AC	3	6	46755	46760	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NT_187107	CA	3	6	48094	48099	50 %	0 %	0 %	50 %	409251035
80	NT_187107	CT	3	6	48212	48217	0 %	50 %	0 %	50 %	409251035
81	NT_187107	AC	3	6	48257	48262	50 %	0 %	0 %	50 %	409251035
82	NT_187107	CA	3	6	49599	49604	50 %	0 %	0 %	50 %	409251036
83	NT_187107	TG	3	6	50618	50623	0 %	50 %	50 %	0 %	409251039
84	NT_187107	CA	4	8	50909	50916	50 %	0 %	0 %	50 %	409251039
85	NT_187107	AT	3	6	51198	51203	50 %	50 %	0 %	0 %	409251039
86	NT_187107	GA	3	6	52475	52480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187107	AG	3	6	52533	52538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.