MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187106	CGGTA	2	10	2011	2020	20 %	20 %	40 %	20 %	409250881
2	NT_187106	ATATG	2	10	5471	5480	40 %	40 %	20 %	0 %	409250883
3	NT_187106	CGTCG	2	10	6750	6759	0 %	20 %	40 %	40 %	409250885
4	NT_187106	GCATC	2	10	6795	6804	20 %	20 %	20 %	40 %	409250885
5	NT_187106	CGTGG	2	10	8735	8744	0 %	20 %	60 %	20 %	409250886
6	NT_187106	TGCTC	2	10	9238	9247	0 %	40 %	20 %	40 %	409250886
7	NT_187106	GCACC	2	10	11639	11648	20 %	0 %	20 %	60 %	409250889
8	NT_187106	AATGG	2	10	12453	12462	40 %	20 %	40 %	0 %	409250889
9	NT_187106	AGAGA	2	10	12499	12508	60 %	0 %	40 %	0 %	409250889
10	NT_187106	GCTCA	2	10	12780	12789	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NT_187106	ACAGT	2	10	13434	13443	40 %	20 %	20 %	20 %	409250890
12	NT_187106	TCAGC	2	10	14333	14342	20 %	20 %	20 %	40 %	409250891
13	NT_187106	TATTT	2	10	16353	16362	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187106	TGAAG	2	10	19053	19062	40 %	20 %	40 %	0 %	409250894
15	NT_187106	CCGGA	2	10	19579	19588	20 %	0 %	40 %	40 %	409250895
16	NT_187106	ATACG	2	10	19724	19733	40 %	20 %	20 %	20 %	409250895
17	NT_187106	TTGCG	2	10	20215	20224	0 %	40 %	40 %	20 %	409250895
18	NT_187106	TACAT	2	10	21047	21056	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NT_187106	TGGTG	2	10	21554	21563	0 %	40 %	60 %	0 %	409250896
20	NT_187106	TTTAT	2	10	21775	21784	20 %	80 %	0 %	0 %	409250896
21	NT_187106	GCCGG	2	10	22747	22756	0 %	0 %	60 %	40 %	409250897
22	NT_187106	AAAGC	2	10	25567	25576	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NT_187106	TTAAT	2	10	25625	25634	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187106	CGCAG	2	10	26521	26530	20 %	0 %	40 %	40 %	409250901
25	NT_187106	CCGCG	2	10	26704	26713	0 %	0 %	40 %	60 %	409250901
26	NT_187106	GACAG	2	10	27266	27275	40 %	0 %	40 %	20 %	409250902
27	NT_187106	CGCTG	2	10	29620	29629	0 %	20 %	40 %	40 %	409250903
28	NT_187106	CTGGG	2	10	29742	29751	0 %	20 %	60 %	20 %	409250903
29	NT_187106	ACGCG	2	10	30589	30598	20 %	0 %	40 %	40 %	409250904
30	NT_187106	TTCCC	2	10	32307	32316	0 %	40 %	0 %	60 %	409250905
31	NT_187106	CCGCC	2	10	32640	32649	0 %	0 %	20 %	80 %	409250906
32	NT_187106	AATAC	2	10	33170	33179	60 %	20 %	0 %	20 %	409250908
33	NT_187106	GCAGC	2	10	35926	35935	20 %	0 %	40 %	40 %	409250911
34	NT_187106	TTTGC	2	10	37607	37616	0 %	60 %	20 %	20 %	409250913
35	NT_187106	CCAGA	2	10	38504	38513	40 %	0 %	20 %	40 %	409250913
36	NT_187106	AACGT	2	10	39281	39290	40 %	20 %	20 %	20 %	409250914
37	NT_187106	GCGCC	2	10	40543	40552	0 %	0 %	40 %	60 %	409250915
38	NT_187106	AAACC	2	10	40976	40985	60 %	0 %	0 %	40 %	409250916
39	NT_187106	GCCCG	2	10	41931	41940	0 %	0 %	40 %	60 %	409250917
40	NT_187106	TACAG	2	10	43423	43432	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NT_187106	CATCT	2	10	44008	44017	20 %	40 %	0 %	40 %	409250919
42	NT_187106	TGCGC	2	10	44592	44601	0 %	20 %	40 %	40 %	409250919
43	NT_187106	CATTA	2	10	44890	44899	40 %	40 %	0 %	20 %	409250919
44	NT_187106	GCGTC	2	10	46391	46400	0 %	20 %	40 %	40 %	409250922
45	NT_187106	CAGTT	2	10	49958	49967	20 %	40 %	20 %	20 %	409250924
46	NT_187106	GCGCC	2	10	50257	50266	0 %	0 %	40 %	60 %	409250924
47	NT_187106	TGTTC	2	10	50329	50338	0 %	60 %	20 %	20 %	409250924
48	NT_187106	GGCTT	2	10	52301	52310	0 %	40 %	40 %	20 %	409250927
49	NT_187106	CCTGC	2	10	53887	53896	0 %	20 %	20 %	60 %	409250929
50	NT_187106	CGGCG	2	10	54458	54467	0 %	0 %	60 %	40 %	409250929
51	NT_187106	AGTCC	2	10	54530	54539	20 %	20 %	20 %	40 %	409250929
52	NT_187106	TTTTG	2	10	55084	55093	0 %	80 %	20 %	0 %	409250929
53	NT_187106	CCCGC	2	10	57012	57021	0 %	0 %	20 %	80 %	409250930
54	NT_187106	GAAGT	2	10	60256	60265	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187106	GTCCA	2	10	61032	61041	20 %	20 %	20 %	40 %	409250934
56	NT_187106	ACCAG	2	10	61065	61074	40 %	0 %	20 %	40 %	409250934
57	NT_187106	GCGTT	2	10	62562	62571	0 %	40 %	40 %	20 %	409250936
58	NT_187106	GGCCA	2	10	68020	68029	20 %	0 %	40 %	40 %	409250941
59	NT_187106	TGATT	2	10	68503	68512	20 %	60 %	20 %	0 %	409250941
60	NT_187106	GATCA	2	10	70653	70662	40 %	20 %	20 %	20 %	409250944
61	NT_187106	GACCA	2	10	71293	71302	40 %	0 %	20 %	40 %	409250945
62	NT_187106	CCTGA	2	10	72988	72997	20 %	20 %	20 %	40 %	409250945
63	NT_187106	CTTTG	2	10	73477	73486	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NT_187106	CTCAA	2	10	81987	81996	40 %	20 %	0 %	40 %	409250955
65	NT_187106	AACGC	2	10	82745	82754	40 %	0 %	20 %	40 %	409250956
66	NT_187106	CCTGT	2	10	86238	86247	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NT_187106	GCGAC	2	10	86808	86817	20 %	0 %	40 %	40 %	409250961
68	NT_187106	CCCGT	2	10	87566	87575	0 %	20 %	20 %	60 %	409250962
69	NT_187106	ATTTT	2	10	91675	91684	20 %	80 %	0 %	0 %	409250965
70	NT_187106	TGTAG	2	10	92545	92554	20 %	40 %	40 %	0 %	409250966
71	NT_187106	TCCAT	2	10	92664	92673	20 %	40 %	0 %	40 %	409250966
72	NT_187106	ATCAA	2	10	93827	93836	60 %	20 %	0 %	20 %	409250967
73	NT_187106	AGGCC	2	10	95076	95085	20 %	0 %	40 %	40 %	409250968
74	NT_187106	CGGCG	2	10	96585	96594	0 %	0 %	60 %	40 %	409250969
75	NT_187106	GGTAG	2	10	97548	97557	20 %	20 %	60 %	0 %	409250969
76	NT_187106	ATCTT	2	10	98688	98697	20 %	60 %	0 %	20 %	409250971
77	NT_187106	CGCGC	2	10	99459	99468	0 %	0 %	40 %	60 %	409250972
78	NT_187106	GCCCT	2	10	100596	100605	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
79	NT_187106	TATCA	2	10	100750	100759	40 %	40 %	0 %	20 %	409250973
80	NT_187106	CTTGC	2	10	101477	101486	0 %	40 %	20 %	40 %	409250973
81	NT_187106	GCGCC	2	10	106766	106775	0 %	0 %	40 %	60 %	409250979

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.