MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 259

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187106	TGGG	2	8	16	23	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187106	ACGG	2	8	581	588	25 %	0 %	50 %	25 %	409250881
3	NT_187106	CGTT	2	8	828	835	0 %	50 %	25 %	25 %	409250881
4	NT_187106	TCAG	2	8	1362	1369	25 %	25 %	25 %	25 %	409250881
5	NT_187106	CACG	2	8	1384	1391	25 %	0 %	25 %	50 %	409250881
6	NT_187106	ACGA	2	8	2444	2451	50 %	0 %	25 %	25 %	409250881
7	NT_187106	TTTC	2	8	3402	3409	0 %	75 %	0 %	25 %	409250882
8	NT_187106	AAAG	2	8	3590	3597	75 %	0 %	25 %	0 %	409250882
9	NT_187106	CGAT	2	8	3802	3809	25 %	25 %	25 %	25 %	409250882
10	NT_187106	CAAT	2	8	4136	4143	50 %	25 %	0 %	25 %	409250882
11	NT_187106	TTTG	2	8	4362	4369	0 %	75 %	25 %	0 %	409250883
12	NT_187106	AATA	2	8	4448	4455	75 %	25 %	0 %	0 %	409250883
13	NT_187106	GAAA	2	8	4910	4917	75 %	0 %	25 %	0 %	409250883
14	NT_187106	GAAA	2	8	4947	4954	75 %	0 %	25 %	0 %	409250883
15	NT_187106	TTTA	2	8	4970	4977	25 %	75 %	0 %	0 %	409250883
16	NT_187106	TAAA	2	8	5075	5082	75 %	25 %	0 %	0 %	409250883
17	NT_187106	TTCA	2	8	5531	5538	25 %	50 %	0 %	25 %	409250883
18	NT_187106	AGCA	2	8	5773	5780	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NT_187106	ATTA	2	8	5864	5871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187106	GTAA	2	8	6066	6073	50 %	25 %	25 %	0 %	409250884
21	NT_187106	GCAC	2	8	7235	7242	25 %	0 %	25 %	50 %	409250885
22	NT_187106	TTTC	2	8	7733	7740	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NT_187106	GCCT	2	8	8300	8307	0 %	25 %	25 %	50 %	409250886
24	NT_187106	GTCC	2	8	8838	8845	0 %	25 %	25 %	50 %	409250886
25	NT_187106	CTGG	2	8	9334	9341	0 %	25 %	50 %	25 %	409250886
26	NT_187106	TCAC	2	8	10520	10527	25 %	25 %	0 %	50 %	409250887
27	NT_187106	TGGT	2	8	11181	11188	0 %	50 %	50 %	0 %	409250887
28	NT_187106	CATC	2	8	11723	11730	25 %	25 %	0 %	50 %	409250889
29	NT_187106	CCCA	2	8	12538	12545	25 %	0 %	0 %	75 %	409250889
30	NT_187106	ACTA	2	8	12693	12700	50 %	25 %	0 %	25 %	409250889
31	NT_187106	TTTC	2	8	12734	12741	0 %	75 %	0 %	25 %	409250889
32	NT_187106	ATTA	2	8	12887	12894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187106	GTAT	2	8	13362	13369	25 %	50 %	25 %	0 %	409250890
34	NT_187106	GAAG	2	8	13718	13725	50 %	0 %	50 %	0 %	409250890
35	NT_187106	CGCC	2	8	13961	13968	0 %	0 %	25 %	75 %	409250891
36	NT_187106	GCAC	2	8	14029	14036	25 %	0 %	25 %	50 %	409250891
37	NT_187106	CAGT	2	8	14087	14094	25 %	25 %	25 %	25 %	409250891
38	NT_187106	ATCC	2	8	14292	14299	25 %	25 %	0 %	50 %	409250891
39	NT_187106	GTCA	2	8	14718	14725	25 %	25 %	25 %	25 %	409250891
40	NT_187106	AGGT	2	8	15494	15501	25 %	25 %	50 %	0 %	409250892
41	NT_187106	AAAC	2	8	15537	15544	75 %	0 %	0 %	25 %	409250892
42	NT_187106	GTTT	2	8	15573	15580	0 %	75 %	25 %	0 %	409250892
43	NT_187106	GTAC	2	8	15585	15592	25 %	25 %	25 %	25 %	409250892
44	NT_187106	TTCT	2	8	15874	15881	0 %	75 %	0 %	25 %	409250892
45	NT_187106	GCAA	2	8	16622	16629	50 %	0 %	25 %	25 %	409250893
46	NT_187106	CGCC	2	8	16847	16854	0 %	0 %	25 %	75 %	409250893
47	NT_187106	GGCA	2	8	16943	16950	25 %	0 %	50 %	25 %	409250893
48	NT_187106	CCGC	2	8	17546	17553	0 %	0 %	25 %	75 %	409250893
49	NT_187106	AACG	2	8	18928	18935	50 %	0 %	25 %	25 %	409250894
50	NT_187106	CCCT	2	8	19324	19331	0 %	25 %	0 %	75 %	409250894
51	NT_187106	CAAG	2	8	20617	20624	50 %	0 %	25 %	25 %	409250895
52	NT_187106	CAGA	2	8	21518	21525	50 %	0 %	25 %	25 %	409250896
53	NT_187106	ACGC	2	8	22371	22378	25 %	0 %	25 %	50 %	409250897
54	NT_187106	GCTC	2	8	22601	22608	0 %	25 %	25 %	50 %	409250897
55	NT_187106	GGCA	2	8	23055	23062	25 %	0 %	50 %	25 %	409250897
56	NT_187106	CAGC	2	8	23342	23349	25 %	0 %	25 %	50 %	409250897
57	NT_187106	CGCC	2	8	23993	24000	0 %	0 %	25 %	75 %	409250898
58	NT_187106	AGCA	2	8	24094	24101	50 %	0 %	25 %	25 %	409250898
59	NT_187106	GCAT	2	8	24875	24882	25 %	25 %	25 %	25 %	409250900
60	NT_187106	ATTG	2	8	25006	25013	25 %	50 %	25 %	0 %	409250900
61	NT_187106	CAGG	2	8	25213	25220	25 %	0 %	50 %	25 %	409250900
62	NT_187106	GTTT	2	8	25398	25405	0 %	75 %	25 %	0 %	409250900
63	NT_187106	GCAT	2	8	25537	25544	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NT_187106	CAAT	2	8	25873	25880	50 %	25 %	0 %	25 %	409250901
65	NT_187106	AGCG	2	8	26777	26784	25 %	0 %	50 %	25 %	409250901
66	NT_187106	CCTG	2	8	27551	27558	0 %	25 %	25 %	50 %	409250902
67	NT_187106	CGCC	2	8	27783	27790	0 %	0 %	25 %	75 %	409250902
68	NT_187106	TGCC	2	8	28177	28184	0 %	25 %	25 %	50 %	409250903
69	NT_187106	GCGG	2	8	28517	28524	0 %	0 %	75 %	25 %	409250903
70	NT_187106	TGAA	2	8	28861	28868	50 %	25 %	25 %	0 %	409250903
71	NT_187106	GGAG	2	8	28949	28956	25 %	0 %	75 %	0 %	409250903
72	NT_187106	CGGC	2	8	30279	30286	0 %	0 %	50 %	50 %	409250904
73	NT_187106	TCCG	2	8	30369	30376	0 %	25 %	25 %	50 %	409250904
74	NT_187106	CCAT	2	8	30525	30532	25 %	25 %	0 %	50 %	409250904
75	NT_187106	TCGT	2	8	30579	30586	0 %	50 %	25 %	25 %	409250904
76	NT_187106	GGCT	2	8	31354	31361	0 %	25 %	50 %	25 %	409250905
77	NT_187106	GCGA	2	8	31583	31590	25 %	0 %	50 %	25 %	409250905
78	NT_187106	AAGC	2	8	32433	32440	50 %	0 %	25 %	25 %	409250906
79	NT_187106	CCTC	2	8	32745	32752	0 %	25 %	0 %	75 %	409250907
80	NT_187106	AACC	2	8	33323	33330	50 %	0 %	0 %	50 %	409250908
81	NT_187106	CCCG	2	8	34674	34681	0 %	0 %	25 %	75 %	409250909
82	NT_187106	TCGA	2	8	34965	34972	25 %	25 %	25 %	25 %	409250910
83	NT_187106	CAGT	2	8	35476	35483	25 %	25 %	25 %	25 %	409250910
84	NT_187106	AGCC	2	8	35550	35557	25 %	0 %	25 %	50 %	409250910
85	NT_187106	CTGA	2	8	35603	35610	25 %	25 %	25 %	25 %	409250910
86	NT_187106	ATAA	2	8	36776	36783	75 %	25 %	0 %	0 %	409250912
87	NT_187106	CAGC	2	8	36860	36867	25 %	0 %	25 %	50 %	409250912
88	NT_187106	GCCT	2	8	36904	36911	0 %	25 %	25 %	50 %	409250912
89	NT_187106	TCAG	2	8	36967	36974	25 %	25 %	25 %	25 %	409250912
90	NT_187106	ACCA	2	8	37144	37151	50 %	0 %	0 %	50 %	409250912
91	NT_187106	GCCA	2	8	37490	37497	25 %	0 %	25 %	50 %	409250913
92	NT_187106	CGCC	2	8	37777	37784	0 %	0 %	25 %	75 %	409250913
93	NT_187106	AGCC	2	8	37840	37847	25 %	0 %	25 %	50 %	409250913
94	NT_187106	CCAG	2	8	38056	38063	25 %	0 %	25 %	50 %	409250913
95	NT_187106	TGCC	2	8	38162	38169	0 %	25 %	25 %	50 %	409250913
96	NT_187106	TCAT	2	8	38520	38527	25 %	50 %	0 %	25 %	409250913
97	NT_187106	AGCG	2	8	38588	38595	25 %	0 %	50 %	25 %	409250913
98	NT_187106	CCAG	2	8	38614	38621	25 %	0 %	25 %	50 %	409250913
99	NT_187106	ATCA	2	8	39072	39079	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NT_187106	CATC	2	8	39149	39156	25 %	25 %	0 %	50 %	409250914
101	NT_187106	GCAG	2	8	39434	39441	25 %	0 %	50 %	25 %	409250914
102	NT_187106	GTGG	2	8	39900	39907	0 %	25 %	75 %	0 %	409250914
103	NT_187106	CTGG	2	8	40299	40306	0 %	25 %	50 %	25 %	409250914
104	NT_187106	CCAG	2	8	40307	40314	25 %	0 %	25 %	50 %	409250914
105	NT_187106	CCCT	2	8	40445	40452	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
106	NT_187106	AGGG	2	8	40507	40514	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187106	AATT	2	8	41426	41433	50 %	50 %	0 %	0 %	409250917
108	NT_187106	GCGT	2	8	41708	41715	0 %	25 %	50 %	25 %	409250917
109	NT_187106	GTCG	2	8	42208	42215	0 %	25 %	50 %	25 %	409250917
110	NT_187106	GGCA	2	8	42578	42585	25 %	0 %	50 %	25 %	409250918
111	NT_187106	TGAT	2	8	42637	42644	25 %	50 %	25 %	0 %	409250918
112	NT_187106	TGCC	2	8	42821	42828	0 %	25 %	25 %	50 %	409250918
113	NT_187106	GATG	2	8	43169	43176	25 %	25 %	50 %	0 %	409250918
114	NT_187106	GCTG	2	8	44489	44496	0 %	25 %	50 %	25 %	409250919
115	NT_187106	TTTC	2	8	45132	45139	0 %	75 %	0 %	25 %	409250919
116	NT_187106	TTCG	2	8	45975	45982	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NT_187106	AGCG	2	8	47264	47271	25 %	0 %	50 %	25 %	409250922
118	NT_187106	CTGG	2	8	47893	47900	0 %	25 %	50 %	25 %	409250923
119	NT_187106	CAGC	2	8	48526	48533	25 %	0 %	25 %	50 %	409250923
120	NT_187106	GCGT	2	8	49861	49868	0 %	25 %	50 %	25 %	409250924
121	NT_187106	GCGT	2	8	50397	50404	0 %	25 %	50 %	25 %	409250924
122	NT_187106	ACCG	2	8	50729	50736	25 %	0 %	25 %	50 %	409250924
123	NT_187106	ACCG	2	8	51200	51207	25 %	0 %	25 %	50 %	409250924
124	NT_187106	GGCT	2	8	51225	51232	0 %	25 %	50 %	25 %	409250924
125	NT_187106	ATCC	2	8	51260	51267	25 %	25 %	0 %	50 %	409250924
126	NT_187106	CAAT	2	8	51373	51380	50 %	25 %	0 %	25 %	409250924
127	NT_187106	CGAC	2	8	51784	51791	25 %	0 %	25 %	50 %	409250926
128	NT_187106	GGCA	2	8	52888	52895	25 %	0 %	50 %	25 %	409250928
129	NT_187106	GCCA	2	8	53027	53034	25 %	0 %	25 %	50 %	409250928
130	NT_187106	GAGC	2	8	53634	53641	25 %	0 %	50 %	25 %	409250928
131	NT_187106	CCAG	2	8	53841	53848	25 %	0 %	25 %	50 %	409250929
132	NT_187106	TCAA	2	8	54171	54178	50 %	25 %	0 %	25 %	409250929
133	NT_187106	ACGC	2	8	54179	54186	25 %	0 %	25 %	50 %	409250929
134	NT_187106	GGTT	2	8	54300	54307	0 %	50 %	50 %	0 %	409250929
135	NT_187106	CAGC	2	8	54575	54582	25 %	0 %	25 %	50 %	409250929
136	NT_187106	ACCA	2	8	55532	55539	50 %	0 %	0 %	50 %	409250929
137	NT_187106	TGGC	2	8	56317	56324	0 %	25 %	50 %	25 %	409250929
138	NT_187106	GACA	2	8	56457	56464	50 %	0 %	25 %	25 %	409250929
139	NT_187106	CTGC	2	8	56943	56950	0 %	25 %	25 %	50 %	409250930
140	NT_187106	CCGC	2	8	57060	57067	0 %	0 %	25 %	75 %	409250930
141	NT_187106	CCAG	2	8	57820	57827	25 %	0 %	25 %	50 %	409250930
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.