MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187106	C	7	7	6	12	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2	NT_187106	T	6	6	2254	2259	0 %	100 %	0 %	0 %	409250881
3	NT_187106	T	6	6	2522	2527	0 %	100 %	0 %	0 %	409250881
4	NT_187106	C	6	6	3908	3913	0 %	0 %	0 %	100 %	409250882
5	NT_187106	A	6	6	4049	4054	100 %	0 %	0 %	0 %	409250882
6	NT_187106	T	6	6	4106	4111	0 %	100 %	0 %	0 %	409250882
7	NT_187106	T	8	8	4283	4290	0 %	100 %	0 %	0 %	409250882
8	NT_187106	T	6	6	4375	4380	0 %	100 %	0 %	0 %	409250883
9	NT_187106	T	6	6	4382	4387	0 %	100 %	0 %	0 %	409250883
10	NT_187106	A	7	7	5322	5328	100 %	0 %	0 %	0 %	409250883
11	NT_187106	A	8	8	5363	5370	100 %	0 %	0 %	0 %	409250883
12	NT_187106	A	6	6	5582	5587	100 %	0 %	0 %	0 %	409250883
13	NT_187106	A	6	6	5727	5732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187106	T	6	6	6154	6159	0 %	100 %	0 %	0 %	409250884
15	NT_187106	A	6	6	6503	6508	100 %	0 %	0 %	0 %	409250884
16	NT_187106	A	6	6	7402	7407	100 %	0 %	0 %	0 %	409250885
17	NT_187106	T	9	9	7504	7512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187106	G	6	6	7722	7727	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187106	A	6	6	9518	9523	100 %	0 %	0 %	0 %	409250886
20	NT_187106	A	6	6	10740	10745	100 %	0 %	0 %	0 %	409250887
21	NT_187106	T	6	6	11595	11600	0 %	100 %	0 %	0 %	409250889
22	NT_187106	T	6	6	11940	11945	0 %	100 %	0 %	0 %	409250889
23	NT_187106	A	6	6	12090	12095	100 %	0 %	0 %	0 %	409250889
24	NT_187106	A	6	6	12490	12495	100 %	0 %	0 %	0 %	409250889
25	NT_187106	A	6	6	12671	12676	100 %	0 %	0 %	0 %	409250889
26	NT_187106	A	6	6	12678	12683	100 %	0 %	0 %	0 %	409250889
27	NT_187106	A	7	7	13161	13167	100 %	0 %	0 %	0 %	409250890
28	NT_187106	T	7	7	13906	13912	0 %	100 %	0 %	0 %	409250891
29	NT_187106	T	6	6	14595	14600	0 %	100 %	0 %	0 %	409250891
30	NT_187106	T	6	6	15196	15201	0 %	100 %	0 %	0 %	409250892
31	NT_187106	A	6	6	16580	16585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187106	A	6	6	18467	18472	100 %	0 %	0 %	0 %	409250894
33	NT_187106	A	6	6	20383	20388	100 %	0 %	0 %	0 %	409250895
34	NT_187106	A	7	7	21335	21341	100 %	0 %	0 %	0 %	409250896
35	NT_187106	A	6	6	21391	21396	100 %	0 %	0 %	0 %	409250896
36	NT_187106	A	7	7	21473	21479	100 %	0 %	0 %	0 %	409250896
37	NT_187106	A	6	6	21795	21800	100 %	0 %	0 %	0 %	409250896
38	NT_187106	A	6	6	22059	22064	100 %	0 %	0 %	0 %	409250896
39	NT_187106	A	6	6	23335	23340	100 %	0 %	0 %	0 %	409250897
40	NT_187106	T	7	7	24071	24077	0 %	100 %	0 %	0 %	409250898
41	NT_187106	A	6	6	24165	24170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187106	A	6	6	24263	24268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187106	T	6	6	24929	24934	0 %	100 %	0 %	0 %	409250900
44	NT_187106	T	7	7	25044	25050	0 %	100 %	0 %	0 %	409250900
45	NT_187106	A	6	6	25666	25671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187106	A	7	7	26895	26901	100 %	0 %	0 %	0 %	409250902
47	NT_187106	T	6	6	27975	27980	0 %	100 %	0 %	0 %	409250903
48	NT_187106	T	6	6	28090	28095	0 %	100 %	0 %	0 %	409250903
49	NT_187106	A	6	6	28995	29000	100 %	0 %	0 %	0 %	409250903
50	NT_187106	A	6	6	30082	30087	100 %	0 %	0 %	0 %	409250904
51	NT_187106	T	6	6	31871	31876	0 %	100 %	0 %	0 %	409250905
52	NT_187106	T	6	6	32032	32037	0 %	100 %	0 %	0 %	409250905
53	NT_187106	T	6	6	38351	38356	0 %	100 %	0 %	0 %	409250913
54	NT_187106	A	6	6	39768	39773	100 %	0 %	0 %	0 %	409250914
55	NT_187106	A	6	6	40220	40225	100 %	0 %	0 %	0 %	409250914
56	NT_187106	A	6	6	40487	40492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187106	G	6	6	40532	40537	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187106	T	7	7	41432	41438	0 %	100 %	0 %	0 %	409250917
59	NT_187106	T	6	6	42347	42352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187106	A	6	6	42374	42379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187106	T	7	7	44161	44167	0 %	100 %	0 %	0 %	409250919
62	NT_187106	T	6	6	45061	45066	0 %	100 %	0 %	0 %	409250919
63	NT_187106	A	6	6	45390	45395	100 %	0 %	0 %	0 %	409250920
64	NT_187106	C	6	6	50265	50270	0 %	0 %	0 %	100 %	409250924
65	NT_187106	T	6	6	55046	55051	0 %	100 %	0 %	0 %	409250929
66	NT_187106	T	7	7	58061	58067	0 %	100 %	0 %	0 %	409250931
67	NT_187106	T	6	6	59426	59431	0 %	100 %	0 %	0 %	409250932
68	NT_187106	A	8	8	61487	61494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187106	T	6	6	61541	61546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187106	G	7	7	61660	61666	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187106	T	6	6	61827	61832	0 %	100 %	0 %	0 %	409250935
72	NT_187106	T	6	6	61867	61872	0 %	100 %	0 %	0 %	409250935
73	NT_187106	A	8	8	61956	61963	100 %	0 %	0 %	0 %	409250935
74	NT_187106	T	6	6	61977	61982	0 %	100 %	0 %	0 %	409250935
75	NT_187106	T	6	6	61998	62003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187106	A	6	6	62625	62630	100 %	0 %	0 %	0 %	409250936
77	NT_187106	C	6	6	63549	63554	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
78	NT_187106	A	6	6	63674	63679	100 %	0 %	0 %	0 %	409250937
79	NT_187106	A	6	6	64677	64682	100 %	0 %	0 %	0 %	409250938
80	NT_187106	T	6	6	65228	65233	0 %	100 %	0 %	0 %	409250939
81	NT_187106	A	6	6	65354	65359	100 %	0 %	0 %	0 %	409250939
82	NT_187106	A	6	6	65503	65508	100 %	0 %	0 %	0 %	409250939
83	NT_187106	A	6	6	65704	65709	100 %	0 %	0 %	0 %	409250939
84	NT_187106	T	6	6	66296	66301	0 %	100 %	0 %	0 %	409250940
85	NT_187106	A	6	6	67218	67223	100 %	0 %	0 %	0 %	409250940
86	NT_187106	A	7	7	69017	69023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187106	A	7	7	69489	69495	100 %	0 %	0 %	0 %	409250943
88	NT_187106	A	6	6	69554	69559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187106	A	7	7	69756	69762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NT_187106	T	7	7	69830	69836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187106	T	6	6	73417	73422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187106	T	6	6	73571	73576	0 %	100 %	0 %	0 %	409250946
93	NT_187106	T	6	6	75283	75288	0 %	100 %	0 %	0 %	409250947
94	NT_187106	T	6	6	76889	76894	0 %	100 %	0 %	0 %	409250949
95	NT_187106	A	6	6	77577	77582	100 %	0 %	0 %	0 %	409250949
96	NT_187106	T	6	6	78137	78142	0 %	100 %	0 %	0 %	409250949
97	NT_187106	T	6	6	78463	78468	0 %	100 %	0 %	0 %	409250950
98	NT_187106	T	6	6	78649	78654	0 %	100 %	0 %	0 %	409250951
99	NT_187106	A	6	6	79212	79217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187106	A	6	6	79267	79272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187106	A	6	6	79441	79446	100 %	0 %	0 %	0 %	409250952
102	NT_187106	A	6	6	80697	80702	100 %	0 %	0 %	0 %	409250953
103	NT_187106	T	6	6	81803	81808	0 %	100 %	0 %	0 %	409250955
104	NT_187106	T	6	6	82463	82468	0 %	100 %	0 %	0 %	409250956
105	NT_187106	A	6	6	82579	82584	100 %	0 %	0 %	0 %	409250956
106	NT_187106	A	6	6	83029	83034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187106	A	6	6	84687	84692	100 %	0 %	0 %	0 %	409250958
108	NT_187106	T	6	6	87190	87195	0 %	100 %	0 %	0 %	409250961
109	NT_187106	T	6	6	87586	87591	0 %	100 %	0 %	0 %	409250962
110	NT_187106	T	7	7	87963	87969	0 %	100 %	0 %	0 %	409250962
111	NT_187106	T	6	6	91156	91161	0 %	100 %	0 %	0 %	409250965
112	NT_187106	T	7	7	91478	91484	0 %	100 %	0 %	0 %	409250965
113	NT_187106	A	6	6	92224	92229	100 %	0 %	0 %	0 %	409250966
114	NT_187106	A	6	6	92947	92952	100 %	0 %	0 %	0 %	409250966
115	NT_187106	T	6	6	94660	94665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187106	A	7	7	95025	95031	100 %	0 %	0 %	0 %	409250968
117	NT_187106	T	6	6	95717	95722	0 %	100 %	0 %	0 %	409250968
118	NT_187106	T	6	6	96920	96925	0 %	100 %	0 %	0 %	409250969
119	NT_187106	A	6	6	98415	98420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NT_187106	T	6	6	101260	101265	0 %	100 %	0 %	0 %	409250973
121	NT_187106	A	6	6	101649	101654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NT_187106	T	6	6	103712	103717	0 %	100 %	0 %	0 %	409250976
123	NT_187106	C	6	6	103767	103772	0 %	0 %	0 %	100 %	409250976
124	NT_187106	A	6	6	105708	105713	100 %	0 %	0 %	0 %	409250978
125	NT_187106	A	6	6	107511	107516	100 %	0 %	0 %	0 %	409250979
126	NT_187106	T	6	6	107675	107680	0 %	100 %	0 %	0 %	409250979
127	NT_187106	C	6	6	107738	107743	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.