MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 435

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187105	GGC	2	6	34	39	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NT_187105	GGT	2	6	9299	9304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187105	GTT	2	6	9572	9577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187105	CAA	2	6	9641	9646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NT_187105	TCA	2	6	9705	9710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NT_187105	GAG	2	6	10817	10822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187105	GAA	2	6	10843	10848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187105	ACA	2	6	11002	11007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NT_187105	GTA	2	6	11018	11023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187105	CAA	2	6	11038	11043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NT_187105	TAA	2	6	11047	11052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187105	CCA	2	6	11117	11122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NT_187105	TAT	2	6	11138	11143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187105	TTA	2	6	11147	11152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187105	CAG	2	6	12092	12097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NT_187105	CTG	2	6	12108	12113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NT_187105	AAT	2	6	12223	12228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187105	TGT	2	6	12378	12383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187105	AAT	2	6	12396	12401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187105	CAC	2	6	12757	12762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NT_187105	TCC	2	6	12784	12789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NT_187105	TCC	2	6	12791	12796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NT_187105	AGA	2	6	12916	12921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187105	GCA	2	6	12942	12947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NT_187105	AGT	2	6	12968	12973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187105	TTG	2	6	13057	13062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187105	ATG	2	6	13169	13174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187105	TAT	2	6	14121	14126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187105	CGG	2	6	14169	14174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NT_187105	ATT	2	6	14872	14877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187105	TCA	2	6	14906	14911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NT_187105	TGT	2	6	15024	15029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187105	CGG	2	6	15139	15144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NT_187105	AAG	2	6	15240	15245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187105	CCT	2	6	15350	15355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NT_187105	CCA	2	6	15844	15849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NT_187105	GTT	2	6	15921	15926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187105	CAT	2	6	15927	15932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NT_187105	CAC	2	6	15942	15947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NT_187105	ATG	2	6	17006	17011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187105	ATA	2	6	17018	17023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187105	TTA	2	6	17416	17421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187105	CAG	2	6	17853	17858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NT_187105	ATT	2	6	19330	19335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187105	AGG	2	6	19385	19390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187105	GCG	2	6	19414	19419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NT_187105	CCA	2	6	19466	19471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NT_187105	AAG	2	6	19484	19489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187105	GCA	2	6	20244	20249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NT_187105	TTC	2	6	20291	20296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NT_187105	CCA	2	6	20446	20451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NT_187105	CTC	2	6	20733	20738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NT_187105	CCG	2	6	20776	20781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NT_187105	TGC	2	6	20880	20885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NT_187105	TGA	2	6	20921	20926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187105	AAT	2	6	22407	22412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187105	CAA	2	6	22467	22472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NT_187105	TGA	2	6	22475	22480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187105	CCG	2	6	22535	22540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NT_187105	CGG	2	6	22587	22592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NT_187105	ACT	2	6	22812	22817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NT_187105	GTC	2	6	38029	38034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NT_187105	GGT	2	6	40390	40395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187105	GTT	2	6	40466	40471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187105	TCT	2	6	40492	40497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NT_187105	TCC	2	6	40507	40512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NT_187105	GTC	2	6	40555	40560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NT_187105	CAG	2	6	40568	40573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NT_187105	TAA	2	6	40670	40675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187105	TAA	2	6	40784	40789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187105	TCA	2	6	40815	40820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NT_187105	TAT	2	6	40858	40863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187105	TTG	2	6	40865	40870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NT_187105	ATT	2	6	41922	41927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187105	TTA	2	6	41940	41945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187105	CAT	2	6	42066	42071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NT_187105	GCC	2	6	42977	42982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NT_187105	TTG	2	6	42989	42994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187105	ATA	2	6	43112	43117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187105	ATA	2	6	43225	43230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187105	AAT	2	6	43238	43243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187105	AAT	2	6	43253	43258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187105	ATT	2	6	43323	43328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187105	TCT	2	6	43371	43376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NT_187105	TGG	2	6	43713	43718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NT_187105	AAC	2	6	43761	43766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NT_187105	GGC	2	6	47444	47449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NT_187105	GTA	2	6	47546	47551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187105	CAA	2	6	47577	47582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NT_187105	ACG	2	6	47599	47604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NT_187105	ACG	2	6	59431	59436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NT_187105	TAA	2	6	59455	59460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187105	GCC	2	6	60836	60841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NT_187105	AGC	2	6	60962	60967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NT_187105	ATT	2	6	64068	64073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187105	CTC	2	6	65432	65437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NT_187105	CCT	2	6	67721	67726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NT_187105	TTA	2	6	67728	67733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187105	TAT	2	6	67762	67767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187105	GTT	2	6	67799	67804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187105	AAT	2	6	67886	67891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187105	CAG	2	6	67892	67897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NT_187105	AAC	2	6	67906	67911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NT_187105	TAA	2	6	67952	67957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NT_187105	ATT	2	6	67974	67979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187105	CCG	2	6	68037	68042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NT_187105	ATG	2	6	68186	68191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187105	ATG	2	6	68313	68318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NT_187105	ATC	2	6	68343	68348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NT_187105	CTA	2	6	68366	68371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NT_187105	CTT	2	6	68538	68543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NT_187105	AAT	2	6	68608	68613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187105	CAG	2	6	68633	68638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NT_187105	CAA	2	6	70954	70959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NT_187105	CGC	2	6	72530	72535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NT_187105	ATA	2	6	72603	72608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NT_187105	ACA	2	6	74045	74050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NT_187105	ATG	2	6	74108	74113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NT_187105	GCG	2	6	74175	74180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NT_187105	ACC	2	6	75200	75205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NT_187105	ACC	2	6	76228	76233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NT_187105	ATC	2	6	76234	76239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NT_187105	CAT	2	6	76242	76247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NT_187105	GTG	2	6	76298	76303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NT_187105	ATC	2	6	76332	76337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NT_187105	ACC	2	6	83598	83603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NT_187105	AAG	2	6	83612	83617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NT_187105	ATT	2	6	84691	84696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NT_187105	ATC	2	6	84713	84718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NT_187105	TCA	2	6	84724	84729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NT_187105	ATG	2	6	85945	85950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NT_187105	AAT	2	6	87612	87617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NT_187105	GAA	2	6	87641	87646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NT_187105	AAT	2	6	87758	87763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NT_187105	GAT	2	6	88918	88923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NT_187105	AAT	2	6	88935	88940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NT_187105	AAT	2	6	88986	88991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NT_187105	TAA	2	6	90570	90575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NT_187105	ATT	2	6	96668	96673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NT_187105	ATA	2	6	96691	96696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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407	NT_187105	TAA	2	6	266190	266195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
408	NT_187105	TAA	2	6	266221	266226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
409	NT_187105	GCA	2	6	266273	266278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
410	NT_187105	GTT	2	6	266371	266376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
411	NT_187105	TAC	2	6	266421	266426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
412	NT_187105	AAT	2	6	266502	266507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
413	NT_187105	TAA	2	6	266513	266518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
414	NT_187105	GCC	2	6	272209	272214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
415	NT_187105	TTG	2	6	274596	274601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
416	NT_187105	CCG	2	6	274661	274666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
417	NT_187105	AGT	2	6	279512	279517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
418	NT_187105	TAA	2	6	279747	279752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
419	NT_187105	ATA	2	6	279785	279790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
420	NT_187105	CAG	2	6	279827	279832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
421	NT_187105	CGT	2	6	279877	279882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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423	NT_187105	TGG	2	6	280457	280462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
424	NT_187105	GCG	2	6	280574	280579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
425	NT_187105	AAT	3	9	282245	282253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
426	NT_187105	GCC	2	6	282275	282280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
427	NT_187105	GCG	2	6	284092	284097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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429	NT_187105	AAT	2	6	286464	286469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NT_187105	TGA	2	6	286632	286637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
431	NT_187105	ATC	2	6	286697	286702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
432	NT_187105	AAT	2	6	286887	286892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NT_187105	AGT	2	6	286922	286927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
434	NT_187105	ACC	2	6	289806	289811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
435	NT_187105	CGC	2	6	290509	290514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.