MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187103	GCCCAC	2	12	1594	1605	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	409250473
2	NT_187103	TCACCA	2	12	2031	2042	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	409250474
3	NT_187103	TTTCAC	2	12	5697	5708	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	409250479
4	NT_187103	TCGTGA	2	12	7220	7231	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409250481
5	NT_187103	TTCCGC	2	12	14520	14531	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	409250490
6	NT_187103	ATACCG	2	12	17782	17793	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409250493
7	NT_187103	GATACC	2	12	18153	18164	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409250493
8	NT_187103	TTGCTT	2	12	19596	19607	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	409250495
9	NT_187103	TTCGCC	2	12	39153	39164	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	409250514
10	NT_187103	ACGGTC	2	12	44747	44758	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409250517
11	NT_187103	CTTTTT	2	12	45396	45407	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NT_187103	CGTGAC	2	12	47015	47026	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409250520
13	NT_187103	CTGGAA	2	12	48438	48449	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409250521
14	NT_187103	TTGCCA	2	12	50086	50097	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409250523
15	NT_187103	TCGCCG	2	12	50779	50790	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409250524
16	NT_187103	ATAAAG	2	12	51998	52009	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	409250526
17	NT_187103	CAGCGC	2	12	58259	58270	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409250531
18	NT_187103	GCCAAA	2	12	61492	61503	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	409250535
19	NT_187103	CGGCAG	2	12	64267	64278	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409250538
20	NT_187103	AGTTAA	2	12	64365	64376	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	409250538
21	NT_187103	CGTCGC	2	12	73995	74006	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409250547
22	NT_187103	CTGCGC	2	12	75784	75795	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409250548
23	NT_187103	ACGCCA	2	12	76721	76732	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	409250549
24	NT_187103	CGCTTT	2	12	78574	78585	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	409250550
25	NT_187103	ACGGTC	2	12	80001	80012	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409250552
26	NT_187103	CCTGCT	2	12	82362	82373	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	409250555
27	NT_187103	ACGGTG	2	12	82736	82747	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409250555
28	NT_187103	TTTCTT	2	12	90333	90344	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	409250565
29	NT_187103	GCGCGG	2	12	91264	91275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250566
30	NT_187103	CCGGAA	2	12	95308	95319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250571
31	NT_187103	AAATAA	2	12	96997	97008	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187103	TCTCGC	2	12	97559	97570	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	409250575
33	NT_187103	ATAATT	2	12	100569	100580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187103	CTGGTG	2	12	107360	107371	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	409250584
35	NT_187103	TGAAGT	2	12	113419	113430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250591
36	NT_187103	CAGCTC	2	12	114100	114111	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409250592
37	NT_187103	CCAGCG	2	12	115180	115191	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409250594
38	NT_187103	TATGCA	2	12	116959	116970	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	409250596

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.