MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187103	TGGTC	2	10	464	473	0 %	40 %	40 %	20 %	409250471
2	NT_187103	CACAG	2	10	2003	2012	40 %	0 %	20 %	40 %	409250474
3	NT_187103	CCCCT	2	10	2245	2254	0 %	20 %	0 %	80 %	409250475
4	NT_187103	TTACA	2	10	3684	3693	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NT_187103	CATTT	2	10	3996	4005	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NT_187103	AAAGC	2	10	10435	10444	60 %	0 %	20 %	20 %	409250484
7	NT_187103	TAATG	2	10	12157	12166	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187103	CCGAA	2	10	16186	16195	40 %	0 %	20 %	40 %	409250492
9	NT_187103	CCCTG	2	10	16776	16785	0 %	20 %	20 %	60 %	409250492
10	NT_187103	TATTT	2	10	21599	21608	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187103	GCGCC	2	10	27249	27258	0 %	0 %	40 %	60 %	409250503
12	NT_187103	TAATG	2	10	29559	29568	40 %	40 %	20 %	0 %	409250504
13	NT_187103	ATCGT	2	10	30611	30620	20 %	40 %	20 %	20 %	409250505
14	NT_187103	GCAAA	2	10	32401	32410	60 %	0 %	20 %	20 %	409250508
15	NT_187103	CGGAT	2	10	33392	33401	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NT_187103	GAGAA	2	10	33530	33539	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187103	CCGGG	2	10	34222	34231	0 %	0 %	60 %	40 %	409250509
18	NT_187103	CTACC	2	10	35282	35291	20 %	20 %	0 %	60 %	409250510
19	NT_187103	AACGT	2	10	35486	35495	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NT_187103	TGGCT	2	10	35623	35632	0 %	40 %	40 %	20 %	409250511
21	NT_187103	ACCAC	2	10	35789	35798	40 %	0 %	0 %	60 %	409250511
22	NT_187103	TTCCA	2	10	35863	35872	20 %	40 %	0 %	40 %	409250511
23	NT_187103	GCGCG	2	10	36444	36453	0 %	0 %	60 %	40 %	409250512
24	NT_187103	CGCCA	2	10	37552	37561	20 %	0 %	20 %	60 %	409250513
25	NT_187103	CGGCG	2	10	38272	38281	0 %	0 %	60 %	40 %	409250513
26	NT_187103	ACGCG	2	10	39823	39832	20 %	0 %	40 %	40 %	409250515
27	NT_187103	CCGGT	2	10	40905	40914	0 %	20 %	40 %	40 %	409250516
28	NT_187103	ACGCG	2	10	41274	41283	20 %	0 %	40 %	40 %	409250516
29	NT_187103	GCCTC	2	10	41791	41800	0 %	20 %	20 %	60 %	409250516
30	NT_187103	CGCGG	2	10	43646	43655	0 %	0 %	60 %	40 %	409250516
31	NT_187103	TTAAC	2	10	45742	45751	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NT_187103	CACGC	2	10	46360	46369	20 %	0 %	20 %	60 %	409250519
33	NT_187103	TCCGC	2	10	49246	49255	0 %	20 %	20 %	60 %	409250522
34	NT_187103	TACGC	2	10	52079	52088	20 %	20 %	20 %	40 %	409250526
35	NT_187103	ACGCC	2	10	56559	56568	20 %	0 %	20 %	60 %	409250529
36	NT_187103	GGACA	2	10	56837	56846	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NT_187103	GTCAG	2	10	59102	59111	20 %	20 %	40 %	20 %	409250532
38	NT_187103	CGTGC	2	10	61780	61789	0 %	20 %	40 %	40 %	409250535
39	NT_187103	CAGCG	2	10	61852	61861	20 %	0 %	40 %	40 %	409250535
40	NT_187103	CGGCG	2	10	65680	65689	0 %	0 %	60 %	40 %	409250539
41	NT_187103	TCGGC	2	10	66681	66690	0 %	20 %	40 %	40 %	409250540
42	NT_187103	GCGCC	2	10	68133	68142	0 %	0 %	40 %	60 %	409250543
43	NT_187103	AAGCG	2	10	68446	68455	40 %	0 %	40 %	20 %	409250543
44	NT_187103	GCATT	2	10	68526	68535	20 %	40 %	20 %	20 %	409250543
45	NT_187103	TCAGT	2	10	68938	68947	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NT_187103	CCCTT	2	10	69800	69809	0 %	40 %	0 %	60 %	409250545
47	NT_187103	CAAAA	2	10	69978	69987	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NT_187103	GCCGC	2	10	73718	73727	0 %	0 %	40 %	60 %	409250547
49	NT_187103	CTTTT	2	10	75286	75295	0 %	80 %	0 %	20 %	409250548
50	NT_187103	GATCG	2	10	75826	75835	20 %	20 %	40 %	20 %	409250548
51	NT_187103	GAACG	2	10	76771	76780	40 %	0 %	40 %	20 %	409250549
52	NT_187103	GTCGG	2	10	76873	76882	0 %	20 %	60 %	20 %	409250549
53	NT_187103	AGCGT	2	10	77869	77878	20 %	20 %	40 %	20 %	409250550
54	NT_187103	GCCCT	2	10	80989	80998	0 %	20 %	20 %	60 %	409250553
55	NT_187103	TCATG	2	10	82704	82713	20 %	40 %	20 %	20 %	409250555
56	NT_187103	CGGCG	2	10	84269	84278	0 %	0 %	60 %	40 %	409250557
57	NT_187103	ACGCC	2	10	87252	87261	20 %	0 %	20 %	60 %	409250562
58	NT_187103	CGTCA	2	10	88618	88627	20 %	20 %	20 %	40 %	409250563
59	NT_187103	AAGCC	2	10	90113	90122	40 %	0 %	20 %	40 %	409250565
60	NT_187103	CGCTG	2	10	92895	92904	0 %	20 %	40 %	40 %	409250568
61	NT_187103	GGTGA	2	10	93959	93968	20 %	20 %	60 %	0 %	409250569
62	NT_187103	CGGTT	2	10	95590	95599	0 %	40 %	40 %	20 %	409250572
63	NT_187103	CGGCC	2	10	95833	95842	0 %	0 %	40 %	60 %	409250572
64	NT_187103	TTTCC	2	10	96422	96431	0 %	60 %	0 %	40 %	409250572
65	NT_187103	CGTTG	2	10	97323	97332	0 %	40 %	40 %	20 %	409250575
66	NT_187103	GAAGC	2	10	98073	98082	40 %	0 %	40 %	20 %	409250576
67	NT_187103	CGGCC	2	10	98180	98189	0 %	0 %	40 %	60 %	409250576
68	NT_187103	GTACA	2	10	98743	98752	40 %	20 %	20 %	20 %	409250577
69	NT_187103	TCAAA	2	10	101903	101912	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NT_187103	CGTTT	2	10	102773	102782	0 %	60 %	20 %	20 %	409250582
71	NT_187103	ACCTT	2	10	105617	105626	20 %	40 %	0 %	40 %	409250583
72	NT_187103	CGATC	2	10	106713	106722	20 %	20 %	20 %	40 %	409250583
73	NT_187103	GCCGC	2	10	108066	108075	0 %	0 %	40 %	60 %	409250584
74	NT_187103	ATTTG	2	10	110887	110896	20 %	60 %	20 %	0 %	409250587
75	NT_187103	CGTAC	2	10	111549	111558	20 %	20 %	20 %	40 %	409250589
76	NT_187103	ACATA	2	10	112337	112346	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NT_187103	TTTAT	2	10	112641	112650	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187103	CCCTG	2	10	115215	115224	0 %	20 %	20 %	60 %	409250594
79	NT_187103	GCCAG	2	10	117488	117497	20 %	0 %	40 %	40 %	409250597
80	NT_187103	ATTTA	2	10	117785	117794	40 %	60 %	0 %	0 %	409250597

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.