MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187103	TGGTC	2	10	464	473	0 %	40 %	40 %	20 %	409250471
2	NT_187103	CACAG	2	10	2003	2012	40 %	0 %	20 %	40 %	409250474
3	NT_187103	CCCCT	2	10	2245	2254	0 %	20 %	0 %	80 %	409250475
4	NT_187103	AAAGC	2	10	10435	10444	60 %	0 %	20 %	20 %	409250484
5	NT_187103	CCGAA	2	10	16186	16195	40 %	0 %	20 %	40 %	409250492
6	NT_187103	CCCTG	2	10	16776	16785	0 %	20 %	20 %	60 %	409250492
7	NT_187103	GCGCC	2	10	27249	27258	0 %	0 %	40 %	60 %	409250503
8	NT_187103	TAATG	2	10	29559	29568	40 %	40 %	20 %	0 %	409250504
9	NT_187103	ATCGT	2	10	30611	30620	20 %	40 %	20 %	20 %	409250505
10	NT_187103	GCAAA	2	10	32401	32410	60 %	0 %	20 %	20 %	409250508
11	NT_187103	CCGGG	2	10	34222	34231	0 %	0 %	60 %	40 %	409250509
12	NT_187103	CTACC	2	10	35282	35291	20 %	20 %	0 %	60 %	409250510
13	NT_187103	TGGCT	2	10	35623	35632	0 %	40 %	40 %	20 %	409250511
14	NT_187103	ACCAC	2	10	35789	35798	40 %	0 %	0 %	60 %	409250511
15	NT_187103	TTCCA	2	10	35863	35872	20 %	40 %	0 %	40 %	409250511
16	NT_187103	GCGCG	2	10	36444	36453	0 %	0 %	60 %	40 %	409250512
17	NT_187103	CGCCA	2	10	37552	37561	20 %	0 %	20 %	60 %	409250513
18	NT_187103	CGGCG	2	10	38272	38281	0 %	0 %	60 %	40 %	409250513
19	NT_187103	ACGCG	2	10	39823	39832	20 %	0 %	40 %	40 %	409250515
20	NT_187103	CCGGT	2	10	40905	40914	0 %	20 %	40 %	40 %	409250516
21	NT_187103	ACGCG	2	10	41274	41283	20 %	0 %	40 %	40 %	409250516
22	NT_187103	GCCTC	2	10	41791	41800	0 %	20 %	20 %	60 %	409250516
23	NT_187103	CGCGG	2	10	43646	43655	0 %	0 %	60 %	40 %	409250516
24	NT_187103	CACGC	2	10	46360	46369	20 %	0 %	20 %	60 %	409250519
25	NT_187103	TCCGC	2	10	49246	49255	0 %	20 %	20 %	60 %	409250522
26	NT_187103	TACGC	2	10	52079	52088	20 %	20 %	20 %	40 %	409250526
27	NT_187103	ACGCC	2	10	56559	56568	20 %	0 %	20 %	60 %	409250529
28	NT_187103	GTCAG	2	10	59102	59111	20 %	20 %	40 %	20 %	409250532
29	NT_187103	CGTGC	2	10	61780	61789	0 %	20 %	40 %	40 %	409250535
30	NT_187103	CAGCG	2	10	61852	61861	20 %	0 %	40 %	40 %	409250535
31	NT_187103	CGGCG	2	10	65680	65689	0 %	0 %	60 %	40 %	409250539
32	NT_187103	TCGGC	2	10	66681	66690	0 %	20 %	40 %	40 %	409250540
33	NT_187103	GCGCC	2	10	68133	68142	0 %	0 %	40 %	60 %	409250543
34	NT_187103	AAGCG	2	10	68446	68455	40 %	0 %	40 %	20 %	409250543
35	NT_187103	GCATT	2	10	68526	68535	20 %	40 %	20 %	20 %	409250543
36	NT_187103	CCCTT	2	10	69800	69809	0 %	40 %	0 %	60 %	409250545
37	NT_187103	GCCGC	2	10	73718	73727	0 %	0 %	40 %	60 %	409250547
38	NT_187103	CTTTT	2	10	75286	75295	0 %	80 %	0 %	20 %	409250548
39	NT_187103	GATCG	2	10	75826	75835	20 %	20 %	40 %	20 %	409250548
40	NT_187103	GAACG	2	10	76771	76780	40 %	0 %	40 %	20 %	409250549
41	NT_187103	GTCGG	2	10	76873	76882	0 %	20 %	60 %	20 %	409250549
42	NT_187103	AGCGT	2	10	77869	77878	20 %	20 %	40 %	20 %	409250550
43	NT_187103	GCCCT	2	10	80989	80998	0 %	20 %	20 %	60 %	409250553
44	NT_187103	TCATG	2	10	82704	82713	20 %	40 %	20 %	20 %	409250555
45	NT_187103	CGGCG	2	10	84269	84278	0 %	0 %	60 %	40 %	409250557
46	NT_187103	ACGCC	2	10	87252	87261	20 %	0 %	20 %	60 %	409250562
47	NT_187103	CGTCA	2	10	88618	88627	20 %	20 %	20 %	40 %	409250563
48	NT_187103	AAGCC	2	10	90113	90122	40 %	0 %	20 %	40 %	409250565
49	NT_187103	CGCTG	2	10	92895	92904	0 %	20 %	40 %	40 %	409250568
50	NT_187103	GGTGA	2	10	93959	93968	20 %	20 %	60 %	0 %	409250569
51	NT_187103	CGGTT	2	10	95590	95599	0 %	40 %	40 %	20 %	409250572
52	NT_187103	CGGCC	2	10	95833	95842	0 %	0 %	40 %	60 %	409250572
53	NT_187103	TTTCC	2	10	96422	96431	0 %	60 %	0 %	40 %	409250572
54	NT_187103	CGTTG	2	10	97323	97332	0 %	40 %	40 %	20 %	409250575
55	NT_187103	GAAGC	2	10	98073	98082	40 %	0 %	40 %	20 %	409250576
56	NT_187103	CGGCC	2	10	98180	98189	0 %	0 %	40 %	60 %	409250576
57	NT_187103	GTACA	2	10	98743	98752	40 %	20 %	20 %	20 %	409250577
58	NT_187103	CGTTT	2	10	102773	102782	0 %	60 %	20 %	20 %	409250582
59	NT_187103	ACCTT	2	10	105617	105626	20 %	40 %	0 %	40 %	409250583
60	NT_187103	CGATC	2	10	106713	106722	20 %	20 %	20 %	40 %	409250583
61	NT_187103	GCCGC	2	10	108066	108075	0 %	0 %	40 %	60 %	409250584
62	NT_187103	ATTTG	2	10	110887	110896	20 %	60 %	20 %	0 %	409250587
63	NT_187103	CGTAC	2	10	111549	111558	20 %	20 %	20 %	40 %	409250589
64	NT_187103	CCCTG	2	10	115215	115224	0 %	20 %	20 %	60 %	409250594
65	NT_187103	GCCAG	2	10	117488	117497	20 %	0 %	40 %	40 %	409250597
66	NT_187103	ATTTA	2	10	117785	117794	40 %	60 %	0 %	0 %	409250597

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.