MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 273

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187103	CTTT	2	8	10	17	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NT_187103	TAAA	2	8	44	51	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187103	CTTA	2	8	197	204	25 %	50 %	0 %	25 %	409250471
4	NT_187103	ATGA	2	8	553	560	50 %	25 %	25 %	0 %	409250471
5	NT_187103	CCAG	2	8	2043	2050	25 %	0 %	25 %	50 %	409250474
6	NT_187103	AAAC	2	8	2073	2080	75 %	0 %	0 %	25 %	409250474
7	NT_187103	GTTG	2	8	2471	2478	0 %	50 %	50 %	0 %	409250475
8	NT_187103	TCGT	2	8	2828	2835	0 %	50 %	25 %	25 %	409250476
9	NT_187103	TGAT	2	8	3859	3866	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187103	ATTC	2	8	3966	3973	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NT_187103	GACG	2	8	4573	4580	25 %	0 %	50 %	25 %	409250477
12	NT_187103	TCCC	2	8	5475	5482	0 %	25 %	0 %	75 %	409250479
13	NT_187103	ACAA	2	8	5857	5864	75 %	0 %	0 %	25 %	409250479
14	NT_187103	GATA	2	8	6081	6088	50 %	25 %	25 %	0 %	409250479
15	NT_187103	TGAT	2	8	6971	6978	25 %	50 %	25 %	0 %	409250480
16	NT_187103	GCAG	2	8	7455	7462	25 %	0 %	50 %	25 %	409250481
17	NT_187103	CGTT	2	8	7640	7647	0 %	50 %	25 %	25 %	409250482
18	NT_187103	CCAG	2	8	7648	7655	25 %	0 %	25 %	50 %	409250482
19	NT_187103	AAAG	2	8	7961	7968	75 %	0 %	25 %	0 %	409250482
20	NT_187103	CACT	2	8	8498	8505	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NT_187103	TCCA	2	8	8603	8610	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NT_187103	TGTC	2	8	8757	8764	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NT_187103	ACTT	2	8	8829	8836	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NT_187103	ATGG	2	8	9783	9790	25 %	25 %	50 %	0 %	409250483
25	NT_187103	TCAC	2	8	10498	10505	25 %	25 %	0 %	50 %	409250484
26	NT_187103	CCCA	2	8	10795	10802	25 %	0 %	0 %	75 %	409250484
27	NT_187103	AGAT	2	8	11036	11043	50 %	25 %	25 %	0 %	409250484
28	NT_187103	ATCA	2	8	11414	11421	50 %	25 %	0 %	25 %	409250485
29	NT_187103	CCCA	2	8	11638	11645	25 %	0 %	0 %	75 %	409250485
30	NT_187103	GCAA	2	8	12284	12291	50 %	0 %	25 %	25 %	409250487
31	NT_187103	AACA	2	8	12305	12312	75 %	0 %	0 %	25 %	409250487
32	NT_187103	GGCT	2	8	12320	12327	0 %	25 %	50 %	25 %	409250487
33	NT_187103	TGTA	2	8	12384	12391	25 %	50 %	25 %	0 %	409250487
34	NT_187103	GGCG	2	8	12556	12563	0 %	0 %	75 %	25 %	409250487
35	NT_187103	ACTA	2	8	12763	12770	50 %	25 %	0 %	25 %	409250487
36	NT_187103	TAAT	2	8	12861	12868	50 %	50 %	0 %	0 %	409250487
37	NT_187103	CAGG	2	8	12991	12998	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NT_187103	TGAA	2	8	13318	13325	50 %	25 %	25 %	0 %	409250488
39	NT_187103	CAGA	2	8	13516	13523	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NT_187103	ATGA	2	8	13938	13945	50 %	25 %	25 %	0 %	409250489
41	NT_187103	TTCT	2	8	14413	14420	0 %	75 %	0 %	25 %	409250490
42	NT_187103	GGCT	2	8	14446	14453	0 %	25 %	50 %	25 %	409250490
43	NT_187103	GCTC	2	8	14637	14644	0 %	25 %	25 %	50 %	409250490
44	NT_187103	AAAT	2	8	15306	15313	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187103	CAGC	2	8	15492	15499	25 %	0 %	25 %	50 %	409250491
46	NT_187103	AAAT	2	8	16008	16015	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187103	CAGG	2	8	16431	16438	25 %	0 %	50 %	25 %	409250492
48	NT_187103	TGAT	2	8	16721	16728	25 %	50 %	25 %	0 %	409250492
49	NT_187103	CCCA	2	8	17220	17227	25 %	0 %	0 %	75 %	409250492
50	NT_187103	GACA	2	8	17319	17326	50 %	0 %	25 %	25 %	409250492
51	NT_187103	CAGA	2	8	17669	17676	50 %	0 %	25 %	25 %	409250493
52	NT_187103	TCCA	2	8	18547	18554	25 %	25 %	0 %	50 %	409250493
53	NT_187103	GAAA	2	8	19016	19023	75 %	0 %	25 %	0 %	409250494
54	NT_187103	CCTG	2	8	19833	19840	0 %	25 %	25 %	50 %	409250495
55	NT_187103	CCTT	2	8	20764	20771	0 %	50 %	0 %	50 %	409250497
56	NT_187103	CTGC	2	8	21075	21082	0 %	25 %	25 %	50 %	409250497
57	NT_187103	GGCA	2	8	22144	22151	25 %	0 %	50 %	25 %	409250498
58	NT_187103	CGCA	2	8	22419	22426	25 %	0 %	25 %	50 %	409250499
59	NT_187103	GAAA	2	8	22573	22580	75 %	0 %	25 %	0 %	409250499
60	NT_187103	GTCT	2	8	23217	23224	0 %	50 %	25 %	25 %	409250499
61	NT_187103	CAAA	2	8	23247	23254	75 %	0 %	0 %	25 %	409250499
62	NT_187103	TGCC	2	8	23645	23652	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NT_187103	CTTT	2	8	24523	24530	0 %	75 %	0 %	25 %	409250501
64	NT_187103	AACG	2	8	24786	24793	50 %	0 %	25 %	25 %	409250501
65	NT_187103	AGCG	2	8	25219	25226	25 %	0 %	50 %	25 %	409250501
66	NT_187103	GACC	2	8	25257	25264	25 %	0 %	25 %	50 %	409250501
67	NT_187103	TAAA	2	8	25496	25503	75 %	25 %	0 %	0 %	409250501
68	NT_187103	GCTG	2	8	25779	25786	0 %	25 %	50 %	25 %	409250501
69	NT_187103	TCGG	2	8	26580	26587	0 %	25 %	50 %	25 %	409250502
70	NT_187103	ATAC	2	8	26659	26666	50 %	25 %	0 %	25 %	409250502
71	NT_187103	ATCA	2	8	26757	26764	50 %	25 %	0 %	25 %	409250502
72	NT_187103	TCCT	2	8	27048	27055	0 %	50 %	0 %	50 %	409250502
73	NT_187103	ATAA	2	8	28446	28453	75 %	25 %	0 %	0 %	409250503
74	NT_187103	TCGC	2	8	30437	30444	0 %	25 %	25 %	50 %	409250505
75	NT_187103	CAAA	2	8	30513	30520	75 %	0 %	0 %	25 %	409250505
76	NT_187103	GTTT	2	8	30564	30571	0 %	75 %	25 %	0 %	409250505
77	NT_187103	TCAC	2	8	30575	30582	25 %	25 %	0 %	50 %	409250505
78	NT_187103	ACGC	2	8	31242	31249	25 %	0 %	25 %	50 %	409250506
79	NT_187103	CCTG	2	8	31317	31324	0 %	25 %	25 %	50 %	409250506
80	NT_187103	TGAT	2	8	31500	31507	25 %	50 %	25 %	0 %	409250506
81	NT_187103	GTGA	2	8	31928	31935	25 %	25 %	50 %	0 %	409250506
82	NT_187103	AGAT	2	8	32519	32526	50 %	25 %	25 %	0 %	409250508
83	NT_187103	CCCT	2	8	32752	32759	0 %	25 %	0 %	75 %	409250508
84	NT_187103	ACCT	2	8	32886	32893	25 %	25 %	0 %	50 %	409250508
85	NT_187103	GCTT	2	8	33478	33485	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NT_187103	TCGG	2	8	33607	33614	0 %	25 %	50 %	25 %	409250509
87	NT_187103	GCCA	2	8	34341	34348	25 %	0 %	25 %	50 %	409250509
88	NT_187103	CGAA	2	8	34588	34595	50 %	0 %	25 %	25 %	409250510
89	NT_187103	GAAG	2	8	35150	35157	50 %	0 %	50 %	0 %	409250510
90	NT_187103	TGGA	2	8	35169	35176	25 %	25 %	50 %	0 %	409250510
91	NT_187103	ATGA	2	8	35922	35929	50 %	25 %	25 %	0 %	409250511
92	NT_187103	GCTG	2	8	37035	37042	0 %	25 %	50 %	25 %	409250512
93	NT_187103	CGCC	2	8	37354	37361	0 %	0 %	25 %	75 %	409250513
94	NT_187103	ACGC	2	8	38002	38009	25 %	0 %	25 %	50 %	409250513
95	NT_187103	CAAT	2	8	38433	38440	50 %	25 %	0 %	25 %	409250513
96	NT_187103	CAAT	2	8	38918	38925	50 %	25 %	0 %	25 %	409250514
97	NT_187103	GATA	2	8	38981	38988	50 %	25 %	25 %	0 %	409250514
98	NT_187103	AGGA	2	8	39300	39307	50 %	0 %	50 %	0 %	409250515
99	NT_187103	TGGC	2	8	39437	39444	0 %	25 %	50 %	25 %	409250515
100	NT_187103	TGCC	2	8	39801	39808	0 %	25 %	25 %	50 %	409250515
101	NT_187103	GCTG	2	8	39909	39916	0 %	25 %	50 %	25 %	409250515
102	NT_187103	CTGG	2	8	39940	39947	0 %	25 %	50 %	25 %	409250515
103	NT_187103	ATGA	2	8	43349	43356	50 %	25 %	25 %	0 %	409250516
104	NT_187103	GATC	2	8	43927	43934	25 %	25 %	25 %	25 %	409250516
105	NT_187103	CGCC	2	8	43978	43985	0 %	0 %	25 %	75 %	409250516
106	NT_187103	TTGC	2	8	44420	44427	0 %	50 %	25 %	25 %	409250517
107	NT_187103	AAAT	2	8	44512	44519	75 %	25 %	0 %	0 %	409250517
108	NT_187103	GCAG	2	8	44633	44640	25 %	0 %	50 %	25 %	409250517
109	NT_187103	CTTA	2	8	45445	45452	25 %	50 %	0 %	25 %	409250518
110	NT_187103	ATTT	2	8	45858	45865	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NT_187103	GTTT	2	8	45895	45902	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NT_187103	GGCT	2	8	46286	46293	0 %	25 %	50 %	25 %	409250519
113	NT_187103	CCTC	2	8	47704	47711	0 %	25 %	0 %	75 %	409250521
114	NT_187103	GCAG	2	8	48010	48017	25 %	0 %	50 %	25 %	409250521
115	NT_187103	CAAC	2	8	48035	48042	50 %	0 %	0 %	50 %	409250521
116	NT_187103	CGAT	2	8	48412	48419	25 %	25 %	25 %	25 %	409250521
117	NT_187103	TTAA	2	8	48708	48715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NT_187103	CGAT	2	8	49164	49171	25 %	25 %	25 %	25 %	409250522
119	NT_187103	TAAA	2	8	49460	49467	75 %	25 %	0 %	0 %	409250522
120	NT_187103	GCTG	2	8	49553	49560	0 %	25 %	50 %	25 %	409250523
121	NT_187103	GGCA	2	8	49889	49896	25 %	0 %	50 %	25 %	409250523
122	NT_187103	CATG	2	8	50062	50069	25 %	25 %	25 %	25 %	409250523
123	NT_187103	CGCC	2	8	50325	50332	0 %	0 %	25 %	75 %	409250523
124	NT_187103	GCCA	2	8	50996	51003	25 %	0 %	25 %	50 %	409250524
125	NT_187103	CTGG	2	8	51139	51146	0 %	25 %	50 %	25 %	409250524
126	NT_187103	GCTG	2	8	51767	51774	0 %	25 %	50 %	25 %	409250525
127	NT_187103	CGCC	2	8	52240	52247	0 %	0 %	25 %	75 %	409250526
128	NT_187103	GCGG	2	8	52401	52408	0 %	0 %	75 %	25 %	409250527
129	NT_187103	CAAG	2	8	53053	53060	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NT_187103	TGCC	2	8	53158	53165	0 %	25 %	25 %	50 %	409250528
131	NT_187103	CTGG	2	8	53762	53769	0 %	25 %	50 %	25 %	409250528
132	NT_187103	ATAA	2	8	53982	53989	75 %	25 %	0 %	0 %	409250528
133	NT_187103	CGCC	2	8	56034	56041	0 %	0 %	25 %	75 %	409250529
134	NT_187103	CCGC	2	8	56606	56613	0 %	0 %	25 %	75 %	409250529
135	NT_187103	CAGC	2	8	56644	56651	25 %	0 %	25 %	50 %	409250529
136	NT_187103	TATT	2	8	56861	56868	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NT_187103	AAAT	2	8	56879	56886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NT_187103	TTTG	2	8	56896	56903	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NT_187103	ATTA	2	8	57030	57037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NT_187103	GCCG	2	8	57361	57368	0 %	0 %	50 %	50 %	409250530
141	NT_187103	GCCA	2	8	58125	58132	25 %	0 %	25 %	50 %	409250531
142	NT_187103	TGGC	2	8	59553	59560	0 %	25 %	50 %	25 %	409250533
143	NT_187103	CAAC	2	8	60481	60488	50 %	0 %	0 %	50 %	409250533
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273	NT_187103	TTGA	2	8	118178	118185	25 %	50 %	25 %	0 %	409250598

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.