MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187102	TGGCGC	2	12	2181	2192	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409250067
2	NT_187102	GGATGA	2	12	22872	22883	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	409250089
3	NT_187102	GCGCCA	2	12	23170	23181	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409250089
4	NT_187102	CCAGCG	2	12	25425	25436	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409250090
5	NT_187102	TCCGGC	2	12	27673	27684	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409250092
6	NT_187102	CGGTAA	2	12	29202	29213	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409250095
7	NT_187102	TATGAT	2	12	38244	38255	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	409250102
8	NT_187102	TTAATG	2	12	38700	38711	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187102	GCTTCC	2	12	41602	41613	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	409250106
10	NT_187102	TCAGCA	2	12	43923	43934	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409250108
11	NT_187102	ATCGGT	2	12	51329	51340	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409250112
12	NT_187102	TTTGTC	2	12	52477	52488	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	409250113
13	NT_187102	CACTGC	2	12	52732	52743	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409250113
14	NT_187102	AATATC	2	12	53257	53268	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NT_187102	TGGGCG	2	12	56742	56753	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	409250117
16	NT_187102	AAACTG	2	12	70941	70952	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	409250129
17	NT_187102	AAATAT	2	12	76134	76145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250134
18	NT_187102	AATCGC	2	12	83883	83894	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409250142
19	NT_187102	GCTATC	2	12	86190	86201	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409250144
20	NT_187102	GTCACC	2	12	102773	102784	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409250162
21	NT_187102	TGGCGC	2	12	105532	105543	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409250164
22	NT_187102	TCGCCT	2	12	109228	109239	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	409250170
23	NT_187102	ACCTGC	2	12	116258	116269	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409250178
24	NT_187102	CAAAAA	2	12	116678	116689	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	409250179
25	NT_187102	CGTAAC	2	12	116794	116805	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NT_187102	ATCAAA	2	12	124505	124516	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	409250189
27	NT_187102	ACCGCG	2	12	125307	125318	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409250191
28	NT_187102	CGCCAT	2	12	126371	126382	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409250191
29	NT_187102	ACCATT	2	12	126450	126461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250191
30	NT_187102	GTGCTG	2	12	131569	131580	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	409250194
31	NT_187102	CACACC	2	12	132617	132628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NT_187102	CGGCAG	2	12	139132	139143	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409250202
33	NT_187102	TTTCTA	2	12	140858	140869	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	409250204
34	NT_187102	TGCTGG	2	12	141827	141838	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	409250204
35	NT_187102	GATGGC	2	12	143183	143194	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409250207
36	NT_187102	TTATTG	2	12	145201	145212	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	409250213
37	NT_187102	CGGTAT	2	12	146190	146201	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409250214
38	NT_187102	CTGCGC	2	12	146374	146385	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409250214
39	NT_187102	ATCACC	2	12	148371	148382	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	409250215
40	NT_187102	CGAAGG	2	12	154026	154037	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	409250222
41	NT_187102	TCTGGG	2	12	156026	156037	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	409250223
42	NT_187102	ATGGCG	2	12	166976	166987	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409250232
43	NT_187102	ACCGTT	2	12	167841	167852	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409250233
44	NT_187102	ATGCGT	2	12	175262	175273	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409250242
45	NT_187102	TGCCGA	2	12	177968	177979	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409250244
46	NT_187102	CGCCAA	2	12	179397	179408	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	409250246
47	NT_187102	CAGCTC	2	12	197385	197396	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409250267
48	NT_187102	CAGCCT	2	12	198140	198151	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409250268
49	NT_187102	AGCTAC	2	12	199985	199996	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409250269
50	NT_187102	CGGCTG	2	12	200022	200033	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409250269
51	NT_187102	GCGCTG	2	12	202284	202295	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409250271
52	NT_187102	CTAACC	2	12	205011	205022	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	409250273
53	NT_187102	TCCGCC	2	12	207456	207467	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	409250276
54	NT_187102	TCAGTA	2	12	208005	208016	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NT_187102	TAACTC	2	12	222793	222804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250296
56	NT_187102	ATTAAG	2	12	223275	223286	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	409250297
57	NT_187102	TAATAG	2	12	224315	224326	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	409250297
58	NT_187102	AGGCGC	2	12	235639	235650	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409250308
59	NT_187102	GGTCTG	2	12	242139	242150	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	409250312
60	NT_187102	AAGACT	2	12	243516	243527	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NT_187102	CCGATG	2	12	246506	246517	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409250316
62	NT_187102	ATGCCG	2	12	247980	247991	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409250318
63	NT_187102	CGCCAG	2	12	249418	249429	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409250319
64	NT_187102	CAGCGC	2	12	249715	249726	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409250319
65	NT_187102	GCGAGC	2	12	258418	258429	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NT_187102	ATGTCG	2	12	265101	265112	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409250333
67	NT_187102	AATAAA	2	12	265291	265302	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187102	TGGCGA	2	12	269740	269751	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409250337
69	NT_187102	GCGCTT	2	12	273536	273547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250341
70	NT_187102	CGCGCC	2	12	277579	277590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250344
71	NT_187102	CGCCAG	2	12	284404	284415	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409250352
72	NT_187102	TGCCCC	2	12	284969	284980	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	409250352
73	NT_187102	ACGTTT	2	12	289974	289985	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	409250357
74	NT_187102	GTGCTT	2	12	290022	290033	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	409250357
75	NT_187102	TGGGTT	2	12	294896	294907	0 %	50 %	50 %	0 %	409250362
76	NT_187102	CACGTC	2	12	296571	296582	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409250364
77	NT_187102	TCGGCG	2	12	298923	298934	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409250367
78	NT_187102	AGGCTA	2	12	302602	302613	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409250371
79	NT_187102	TCATTC	2	12	306649	306660	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	409250374
80	NT_187102	ATGGCG	2	12	311741	311752	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409250380
81	NT_187102	GGCTTT	2	12	313308	313319	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	409250382
82	NT_187102	TCAGGT	2	12	313439	313450	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409250382
83	NT_187102	CGTCAC	2	12	314030	314041	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409250383
84	NT_187102	CCAGCG	2	12	314831	314842	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409250383
85	NT_187102	CATAAA	2	12	318313	318324	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	409250386
86	NT_187102	GCGAAG	2	12	322603	322614	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	409250391
87	NT_187102	TCCGGC	2	12	322899	322910	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409250391
88	NT_187102	CGCTCG	2	12	325007	325018	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409250392
89	NT_187102	GATCGC	2	12	326244	326255	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409250393
90	NT_187102	CGCCAG	2	12	333690	333701	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409250400
91	NT_187102	GCGACG	2	12	337470	337481	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409250404
92	NT_187102	ATGTCC	2	12	342992	343003	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NT_187102	AAGTTT	2	12	347326	347337	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	409250417
94	NT_187102	TCAGGA	2	12	349310	349321	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409250418
95	NT_187102	GCGCTT	2	12	349719	349730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250418
96	NT_187102	TAATGC	2	12	355954	355965	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	409250426
97	NT_187102	GCCAAA	2	12	358235	358246	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	409250431
98	NT_187102	CGTGAC	2	12	359728	359739	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409250434
99	NT_187102	CTTCAC	2	12	361820	361831	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NT_187102	TATTGC	2	12	367647	367658	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	409250445
101	NT_187102	CAGGTC	2	12	371493	371504	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409250449
102	NT_187102	CATGCC	2	12	371613	371624	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409250450
103	NT_187102	TAAACC	2	12	373444	373455	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NT_187102	GTTTTT	2	12	386588	386599	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.