MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 264

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187102	TGATT	2	10	2262	2271	20 %	60 %	20 %	0 %	409250067
2	NT_187102	GATAA	2	10	2323	2332	60 %	20 %	20 %	0 %	409250067
3	NT_187102	CGATG	2	10	2987	2996	20 %	20 %	40 %	20 %	409250068
4	NT_187102	CGGCG	2	10	6742	6751	0 %	0 %	60 %	40 %	409250072
5	NT_187102	CCGAT	2	10	10550	10559	20 %	20 %	20 %	40 %	409250077
6	NT_187102	CGCGG	2	10	13861	13870	0 %	0 %	60 %	40 %	409250079
7	NT_187102	ATCCC	2	10	17826	17835	20 %	20 %	0 %	60 %	409250083
8	NT_187102	GTGAT	2	10	23416	23425	20 %	40 %	40 %	0 %	409250089
9	NT_187102	CGTCC	2	10	23986	23995	0 %	20 %	20 %	60 %	409250090
10	NT_187102	AGGGA	2	10	25001	25010	40 %	0 %	60 %	0 %	409250090
11	NT_187102	AGCCG	2	10	25536	25545	20 %	0 %	40 %	40 %	409250091
12	NT_187102	GGCGC	2	10	27388	27397	0 %	0 %	60 %	40 %	409250092
13	NT_187102	TGCCA	2	10	31944	31953	20 %	20 %	20 %	40 %	409250098
14	NT_187102	ACCGA	2	10	32025	32034	40 %	0 %	20 %	40 %	409250098
15	NT_187102	TTAAG	2	10	34143	34152	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187102	TTGCG	2	10	37575	37584	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NT_187102	GGAAA	2	10	39892	39901	60 %	0 %	40 %	0 %	409250104
18	NT_187102	GCCCA	2	10	40784	40793	20 %	0 %	20 %	60 %	409250105
19	NT_187102	GACCG	2	10	42305	42314	20 %	0 %	40 %	40 %	409250107
20	NT_187102	TCCAG	2	10	45453	45462	20 %	20 %	20 %	40 %	409250108
21	NT_187102	CAGTT	2	10	46003	46012	20 %	40 %	20 %	20 %	409250108
22	NT_187102	GCGCG	2	10	48857	48866	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
23	NT_187102	ATAAC	2	10	51121	51130	60 %	20 %	0 %	20 %	409250111
24	NT_187102	GTTGT	2	10	53217	53226	0 %	60 %	40 %	0 %	409250114
25	NT_187102	CAGAG	2	10	53390	53399	40 %	0 %	40 %	20 %	409250115
26	NT_187102	GCTGG	2	10	55670	55679	0 %	20 %	60 %	20 %	409250117
27	NT_187102	TGCGC	2	10	57077	57086	0 %	20 %	40 %	40 %	409250117
28	NT_187102	GAAGG	2	10	58934	58943	40 %	0 %	60 %	0 %	409250119
29	NT_187102	TCGAC	2	10	61970	61979	20 %	20 %	20 %	40 %	409250121
30	NT_187102	CGGCG	2	10	62317	62326	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
31	NT_187102	CAAAG	2	10	63568	63577	60 %	0 %	20 %	20 %	409250124
32	NT_187102	GGCGA	2	10	65257	65266	20 %	0 %	60 %	20 %	409250126
33	NT_187102	CTTTT	2	10	66753	66762	0 %	80 %	0 %	20 %	409250127
34	NT_187102	CCTTA	2	10	67288	67297	20 %	40 %	0 %	40 %	409250128
35	NT_187102	ACGGC	2	10	68393	68402	20 %	0 %	40 %	40 %	409250128
36	NT_187102	GCGAG	2	10	68772	68781	20 %	0 %	60 %	20 %	409250128
37	NT_187102	CGAAG	2	10	69033	69042	40 %	0 %	40 %	20 %	409250128
38	NT_187102	ATCAG	2	10	69825	69834	40 %	20 %	20 %	20 %	409250129
39	NT_187102	GAATG	2	10	71019	71028	40 %	20 %	40 %	0 %	409250129
40	NT_187102	GCACG	2	10	71363	71372	20 %	0 %	40 %	40 %	409250129
41	NT_187102	GATAA	2	10	74021	74030	60 %	20 %	20 %	0 %	409250132
42	NT_187102	AGTCG	2	10	74126	74135	20 %	20 %	40 %	20 %	409250132
43	NT_187102	AACGC	2	10	74232	74241	40 %	0 %	20 %	40 %	409250132
44	NT_187102	TAAAT	2	10	77018	77027	60 %	40 %	0 %	0 %	409250134
45	NT_187102	TGGCC	2	10	77405	77414	0 %	20 %	40 %	40 %	409250134
46	NT_187102	GCGTG	2	10	78176	78185	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NT_187102	AGGGA	2	10	78251	78260	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187102	CATAC	2	10	79387	79396	40 %	20 %	0 %	40 %	409250139
49	NT_187102	GACAC	2	10	79596	79605	40 %	0 %	20 %	40 %	409250139
50	NT_187102	CTTTT	2	10	80770	80779	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NT_187102	GCCGG	2	10	81762	81771	0 %	0 %	60 %	40 %	409250141
52	NT_187102	GAAAA	2	10	84995	85004	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187102	TGGCC	2	10	85508	85517	0 %	20 %	40 %	40 %	409250144
54	NT_187102	TGCTC	2	10	85880	85889	0 %	40 %	20 %	40 %	409250144
55	NT_187102	CGGAT	2	10	86370	86379	20 %	20 %	40 %	20 %	409250145
56	NT_187102	GCATG	2	10	87298	87307	20 %	20 %	40 %	20 %	409250145
57	NT_187102	TCGCA	2	10	87413	87422	20 %	20 %	20 %	40 %	409250146
58	NT_187102	TGGAT	2	10	89286	89295	20 %	40 %	40 %	0 %	409250147
59	NT_187102	ATTAA	2	10	89530	89539	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187102	CCCAA	2	10	90194	90203	40 %	0 %	0 %	60 %	409250148
61	NT_187102	GCCTG	2	10	92525	92534	0 %	20 %	40 %	40 %	409250149
62	NT_187102	GCGCC	2	10	92902	92911	0 %	0 %	40 %	60 %	409250150
63	NT_187102	TTAAC	2	10	95195	95204	40 %	40 %	0 %	20 %	409250154
64	NT_187102	TCATA	2	10	97357	97366	40 %	40 %	0 %	20 %	409250157
65	NT_187102	AAATA	2	10	99860	99869	80 %	20 %	0 %	0 %	409250159
66	NT_187102	CCCTG	2	10	100484	100493	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
67	NT_187102	CAATC	2	10	106369	106378	40 %	20 %	0 %	40 %	409250165
68	NT_187102	CTTTT	2	10	108827	108836	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NT_187102	GCTGG	2	10	110006	110015	0 %	20 %	60 %	20 %	409250170
70	NT_187102	ATAAA	2	10	111612	111621	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187102	GTTTG	2	10	112072	112081	0 %	60 %	40 %	0 %	409250174
72	NT_187102	ATATG	2	10	112543	112552	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187102	CTGCT	2	10	113188	113197	0 %	40 %	20 %	40 %	409250176
74	NT_187102	ACGGC	2	10	115532	115541	20 %	0 %	40 %	40 %	409250177
75	NT_187102	AGGAA	2	10	119452	119461	60 %	0 %	40 %	0 %	409250183
76	NT_187102	CTTTC	2	10	119586	119595	0 %	60 %	0 %	40 %	409250183
77	NT_187102	CGCGG	2	10	123875	123884	0 %	0 %	60 %	40 %	409250188
78	NT_187102	TCGGC	2	10	128829	128838	0 %	20 %	40 %	40 %	409250192
79	NT_187102	CCTGG	2	10	132144	132153	0 %	20 %	40 %	40 %	409250195
80	NT_187102	GTTCC	2	10	133005	133014	0 %	40 %	20 %	40 %	409250196
81	NT_187102	GCCGC	2	10	133419	133428	0 %	0 %	40 %	60 %	409250197
82	NT_187102	GATAC	2	10	134268	134277	40 %	20 %	20 %	20 %	409250197
83	NT_187102	GTTGG	2	10	135232	135241	0 %	40 %	60 %	0 %	409250199
84	NT_187102	ACGCT	2	10	140335	140344	20 %	20 %	20 %	40 %	409250203
85	NT_187102	TAAAA	2	10	144223	144232	80 %	20 %	0 %	0 %	409250209
86	NT_187102	CTGCC	2	10	145475	145484	0 %	20 %	20 %	60 %	409250213
87	NT_187102	TCCGT	2	10	145684	145693	0 %	40 %	20 %	40 %	409250213
88	NT_187102	CCGCC	2	10	146706	146715	0 %	0 %	20 %	80 %	409250214
89	NT_187102	CCCGC	2	10	148764	148773	0 %	0 %	20 %	80 %	409250215
90	NT_187102	ATTAA	2	10	149190	149199	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187102	TTAGC	2	10	149222	149231	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NT_187102	GCCGC	2	10	149992	150001	0 %	0 %	40 %	60 %	409250216
93	NT_187102	CTGCG	2	10	151001	151010	0 %	20 %	40 %	40 %	409250217
94	NT_187102	ATTAA	2	10	153466	153475	60 %	40 %	0 %	0 %	409250220
95	NT_187102	TAAGT	2	10	153743	153752	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187102	GAAAA	2	10	153771	153780	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187102	CTTTT	2	10	154960	154969	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NT_187102	ATATC	2	10	156494	156503	40 %	40 %	0 %	20 %	409250223
99	NT_187102	GCCAT	2	10	159455	159464	20 %	20 %	20 %	40 %	409250226
100	NT_187102	CCAAG	2	10	161555	161564	40 %	0 %	20 %	40 %	409250227
101	NT_187102	GGCGA	2	10	163339	163348	20 %	0 %	60 %	20 %	409250228
102	NT_187102	TTCTG	2	10	163634	163643	0 %	60 %	20 %	20 %	409250228
103	NT_187102	GCGTG	2	10	164070	164079	0 %	20 %	60 %	20 %	409250229
104	NT_187102	TGCGC	2	10	167638	167647	0 %	20 %	40 %	40 %	409250232
105	NT_187102	ACAGA	2	10	168883	168892	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NT_187102	CATTT	2	10	169893	169902	20 %	60 %	0 %	20 %	409250236
107	NT_187102	CATTA	2	10	169981	169990	40 %	40 %	0 %	20 %	409250236
108	NT_187102	CCTGC	2	10	172542	172551	0 %	20 %	20 %	60 %	409250239
109	NT_187102	CGCTG	2	10	172867	172876	0 %	20 %	40 %	40 %	409250239
110	NT_187102	TTTCC	2	10	173712	173721	0 %	60 %	0 %	40 %	409250240
111	NT_187102	CTCTG	2	10	175047	175056	0 %	40 %	20 %	40 %	409250242
112	NT_187102	TGGTC	2	10	177247	177256	0 %	40 %	40 %	20 %	409250244
113	NT_187102	TCCTG	2	10	179244	179253	0 %	40 %	20 %	40 %	409250246
114	NT_187102	CAATA	2	10	181971	181980	60 %	20 %	0 %	20 %	409250248
115	NT_187102	GCCGT	2	10	183859	183868	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NT_187102	TCCGC	2	10	186914	186923	0 %	20 %	20 %	60 %	409250254
117	NT_187102	TGTGG	2	10	188040	188049	0 %	40 %	60 %	0 %	409250254
118	NT_187102	GCGCC	2	10	190738	190747	0 %	0 %	40 %	60 %	409250258
119	NT_187102	GGCCA	2	10	191275	191284	20 %	0 %	40 %	40 %	409250259
120	NT_187102	CGCGG	2	10	192793	192802	0 %	0 %	60 %	40 %	409250261
121	NT_187102	AAAAG	2	10	194078	194087	80 %	0 %	20 %	0 %	409250263
122	NT_187102	ATAGA	2	10	195515	195524	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NT_187102	GCGCT	2	10	198534	198543	0 %	20 %	40 %	40 %	409250268
124	NT_187102	CAAGC	2	10	199957	199966	40 %	0 %	20 %	40 %	409250269
125	NT_187102	AAACC	2	10	202015	202024	60 %	0 %	0 %	40 %	409250271
126	NT_187102	TTGCT	2	10	202567	202576	0 %	60 %	20 %	20 %	409250271
127	NT_187102	TTTCT	2	10	204419	204428	0 %	80 %	0 %	20 %	409250272
128	NT_187102	CTGTT	2	10	204434	204443	0 %	60 %	20 %	20 %	409250272
129	NT_187102	AATCC	2	10	205669	205678	40 %	20 %	0 %	40 %	409250274
130	NT_187102	TGGCA	2	10	207489	207498	20 %	20 %	40 %	20 %	409250276
131	NT_187102	TTCGC	2	10	207594	207603	0 %	40 %	20 %	40 %	409250277
132	NT_187102	CTCTC	2	10	209248	209257	0 %	40 %	0 %	60 %	409250278
133	NT_187102	GACGA	2	10	209408	209417	40 %	0 %	40 %	20 %	409250278
134	NT_187102	GTCCA	2	10	209850	209859	20 %	20 %	20 %	40 %	409250278
135	NT_187102	AACTC	2	10	210386	210395	40 %	20 %	0 %	40 %	409250278
136	NT_187102	CATAT	2	10	210540	210549	40 %	40 %	0 %	20 %	409250278
137	NT_187102	CCAAC	2	10	210857	210866	40 %	0 %	0 %	60 %	409250278
138	NT_187102	GAAGT	2	10	213278	213287	40 %	20 %	40 %	0 %	409250281
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260	NT_187102	AGAAT	2	10	380564	380573	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
261	NT_187102	CCTCT	2	10	381862	381871	0 %	40 %	0 %	60 %	409250461
262	NT_187102	TTTAC	2	10	382427	382436	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
263	NT_187102	AATAT	2	10	385045	385054	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NT_187102	GTGCC	2	10	387652	387661	0 %	20 %	40 %	40 %	409250469

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.