MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187102	TATT	2	8	51	58	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187102	GTCA	2	8	11676	11683	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NT_187102	AAGA	2	8	12347	12354	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187102	ATTA	2	8	16044	16051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187102	ACTC	2	8	17016	17023	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NT_187102	GCAA	2	8	28243	28250	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NT_187102	GAAA	2	8	29717	29724	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187102	TATT	2	8	31095	31102	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187102	GAAG	2	8	31190	31197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187102	ATAA	2	8	34212	34219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187102	GAAA	2	8	37481	37488	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187102	TTGA	2	8	37734	37741	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187102	AGCC	2	8	51628	51635	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NT_187102	GCCC	2	8	53270	53277	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NT_187102	GCCA	2	8	53301	53308	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NT_187102	ACCA	2	8	55083	55090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NT_187102	GAAA	2	8	62496	62503	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187102	AATT	2	8	62802	62809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187102	AAAG	2	8	63101	63108	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187102	GCTC	2	8	63762	63769	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NT_187102	TGCC	2	8	63784	63791	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NT_187102	TTAT	2	8	64020	64027	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187102	GTGG	2	8	69784	69791	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187102	CATT	2	8	79735	79742	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NT_187102	CCCG	2	8	79748	79755	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NT_187102	AATG	2	8	80016	80023	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187102	CTTT	2	8	80273	80280	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NT_187102	TTAA	2	8	80336	80343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187102	TTAT	2	8	84093	84100	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187102	GCTG	2	8	84152	84159	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NT_187102	TAAT	2	8	88080	88087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187102	TAAT	2	8	89336	89343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187102	TAAA	2	8	89463	89470	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187102	ACTA	2	8	89655	89662	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NT_187102	CCAG	2	8	92631	92638	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NT_187102	ATTT	2	8	98522	98529	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187102	AAGT	2	8	98681	98688	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187102	ACAA	2	8	98745	98752	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NT_187102	ATGT	2	8	100544	100551	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187102	CAAT	2	8	104499	104506	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NT_187102	ATTA	2	8	106631	106638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187102	CAGG	2	8	108975	108982	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NT_187102	AAAT	2	8	110319	110326	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187102	GGCA	2	8	110589	110596	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NT_187102	AATT	2	8	112326	112333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187102	TCCG	2	8	112342	112349	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NT_187102	GAAT	2	8	115906	115913	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187102	TACG	2	8	122458	122465	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NT_187102	GAGT	2	8	125184	125191	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187102	TAAT	2	8	139607	139614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187102	TCAC	2	8	142187	142194	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NT_187102	TGAA	2	8	142248	142255	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187102	TGAT	2	8	166668	166675	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187102	TCCC	2	8	168906	168913	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NT_187102	ATCA	2	8	176391	176398	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NT_187102	TCTA	2	8	176483	176490	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NT_187102	CGGA	2	8	176858	176865	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NT_187102	CAAA	2	8	176939	176946	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NT_187102	TTAA	2	8	183922	183929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187102	CTGC	2	8	190194	190201	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NT_187102	TGCC	2	8	193915	193922	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NT_187102	TGCG	2	8	194856	194863	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NT_187102	TGTC	2	8	197977	197984	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NT_187102	AAGA	2	8	197989	197996	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187102	ATGG	2	8	199352	199359	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187102	TCAT	2	8	205490	205497	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NT_187102	TCAT	2	8	208251	208258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NT_187102	GCAA	2	8	208443	208450	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NT_187102	ATTC	2	8	209182	209189	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NT_187102	AAAC	2	8	221036	221043	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NT_187102	GATA	2	8	221301	221308	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187102	CTAA	2	8	221318	221325	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NT_187102	GGCT	2	8	221495	221502	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NT_187102	CTCA	2	8	221557	221564	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NT_187102	ATTT	2	8	224944	224951	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187102	TAAA	2	8	225095	225102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187102	CCCG	2	8	230786	230793	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
78	NT_187102	CATT	2	8	238734	238741	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NT_187102	ATGA	2	8	240871	240878	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187102	TTGT	2	8	243547	243554	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187102	CTGT	2	8	247021	247028	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NT_187102	GACA	2	8	252703	252710	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NT_187102	TAAT	2	8	252804	252811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187102	CCTG	2	8	260654	260661	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NT_187102	TCAG	2	8	269549	269556	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NT_187102	ATTA	2	8	277325	277332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187102	CTGC	2	8	278312	278319	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NT_187102	ATTA	2	8	279579	279586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187102	AATA	2	8	279620	279627	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NT_187102	ACGG	2	8	282118	282125	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NT_187102	TGCC	2	8	282399	282406	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NT_187102	GAAA	2	8	285357	285364	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187102	GATG	2	8	285479	285486	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187102	TAAA	2	8	289454	289461	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187102	GGCA	2	8	289912	289919	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NT_187102	AGCA	2	8	290213	290220	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NT_187102	CAAT	2	8	296122	296129	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NT_187102	CATT	2	8	296166	296173	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NT_187102	TAAA	2	8	296203	296210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187102	TGTC	2	8	302292	302299	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NT_187102	TAAT	2	8	307324	307331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187102	TAAT	2	8	310037	310044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187102	GGCA	2	8	310598	310605	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NT_187102	TTAA	2	8	320011	320018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NT_187102	GCCA	2	8	320059	320066	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NT_187102	GCAG	2	8	327291	327298	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NT_187102	CCAA	2	8	339983	339990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NT_187102	AAAC	2	8	340007	340014	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NT_187102	GATT	2	8	341739	341746	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NT_187102	CAGC	2	8	346366	346373	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NT_187102	TGAA	2	8	351199	351206	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NT_187102	ATAA	2	8	356626	356633	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187102	CTAT	2	8	358666	358673	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NT_187102	TAAA	2	8	359470	359477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NT_187102	GAGT	2	8	362286	362293	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187102	ATGG	2	8	362391	362398	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NT_187102	AGGG	2	8	362454	362461	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
118	NT_187102	ATTG	2	8	364973	364980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NT_187102	AATA	2	8	365004	365011	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NT_187102	TTAC	2	8	365113	365120	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NT_187102	ATTT	2	8	366458	366465	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NT_187102	AGGC	2	8	366616	366623	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NT_187102	TCTG	2	8	374172	374179	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NT_187102	GGTT	2	8	376968	376975	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NT_187102	ATAC	2	8	379077	379084	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NT_187102	TCCT	2	8	379224	379231	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NT_187102	ACCT	2	8	379239	379246	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NT_187102	CAGG	2	8	379352	379359	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NT_187102	AAGC	2	8	380958	380965	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NT_187102	TTAT	2	8	381065	381072	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NT_187102	TTTG	2	8	381189	381196	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NT_187102	ATTT	2	8	381520	381527	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NT_187102	TGGC	2	8	381682	381689	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NT_187102	TATT	2	8	381799	381806	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NT_187102	CTGT	2	8	382828	382835	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NT_187102	CTAT	2	8	383230	383237	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NT_187102	TTTA	2	8	384179	384186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NT_187102	ACTC	2	8	388026	388033	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NT_187102	AATT	2	8	388041	388048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NT_187102	TTTA	2	8	388079	388086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NT_187102	TTTA	2	8	388110	388117	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.