MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 4777

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187102	CAA	2	6	163	168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250064
2	NT_187102	CGC	2	6	326	331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250064
3	NT_187102	ATG	2	6	464	469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250064
4	NT_187102	GAT	2	6	473	478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250064
5	NT_187102	TTC	2	6	492	497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250064
6	NT_187102	TGA	2	6	611	616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250065
7	NT_187102	ATG	2	6	627	632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250065
8	NT_187102	GTA	2	6	699	704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250065
9	NT_187102	AAT	2	6	791	796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250065
10	NT_187102	ATC	2	6	900	905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250065
11	NT_187102	AAT	2	6	959	964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250065
12	NT_187102	GTC	2	6	1202	1207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250065
13	NT_187102	TCA	2	6	1387	1392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250065
14	NT_187102	CAT	2	6	1435	1440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250066
15	NT_187102	CGT	2	6	1448	1453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250066
16	NT_187102	GCG	2	6	1491	1496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250066
17	NT_187102	AGC	2	6	1500	1505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250066
18	NT_187102	GCG	2	6	1509	1514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250066
19	NT_187102	CCG	2	6	1527	1532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250066
20	NT_187102	GCA	2	6	1548	1553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250066
21	NT_187102	TGC	2	6	1605	1610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250066
22	NT_187102	ATC	2	6	1638	1643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250066
23	NT_187102	GCG	2	6	1684	1689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250066
24	NT_187102	TGA	2	6	1832	1837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250066
25	NT_187102	TTG	2	6	1914	1919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250066
26	NT_187102	CGG	2	6	2008	2013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250066
27	NT_187102	ATC	2	6	2034	2039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250066
28	NT_187102	GCG	2	6	2081	2086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250067
29	NT_187102	GCA	2	6	2103	2108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250067
30	NT_187102	AAT	2	6	2359	2364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250067
31	NT_187102	GCC	2	6	2384	2389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250067
32	NT_187102	CAT	2	6	2475	2480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250067
33	NT_187102	ATC	2	6	2483	2488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250067
34	NT_187102	GCT	2	6	2741	2746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250068
35	NT_187102	CCG	2	6	2846	2851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250068
36	NT_187102	CCG	2	6	2939	2944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250068
37	NT_187102	GAT	2	6	3177	3182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250068
38	NT_187102	GGT	2	6	3195	3200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250068
39	NT_187102	CGC	2	6	3266	3271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250068
40	NT_187102	ATG	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250069
41	NT_187102	GCG	2	6	3593	3598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250069
42	NT_187102	GCC	2	6	3607	3612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250069
43	NT_187102	ATG	2	6	3680	3685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250069
44	NT_187102	CGC	2	6	3711	3716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250069
45	NT_187102	ATG	2	6	3815	3820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250069
46	NT_187102	CAG	2	6	3829	3834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250069
47	NT_187102	TGG	2	6	3846	3851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250069
48	NT_187102	GAA	2	6	3919	3924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250069
49	NT_187102	CGC	2	6	4000	4005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250069
50	NT_187102	AAC	2	6	4075	4080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250069
51	NT_187102	AAC	2	6	4193	4198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250069
52	NT_187102	GGC	2	6	4300	4305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250069
53	NT_187102	TCA	2	6	4347	4352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250069
54	NT_187102	GAC	2	6	4357	4362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250069
55	NT_187102	AGT	2	6	4386	4391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250069
56	NT_187102	ATC	2	6	4469	4474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250069
57	NT_187102	ATC	2	6	4559	4564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250069
58	NT_187102	CGG	2	6	4573	4578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250069
59	NT_187102	GAT	2	6	4690	4695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250069
60	NT_187102	ATG	2	6	4703	4708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250069
61	NT_187102	GCC	2	6	4723	4728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250069
62	NT_187102	CGT	3	9	4801	4809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250070
63	NT_187102	CAG	2	6	4820	4825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250070
64	NT_187102	GGC	2	6	4826	4831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250070
65	NT_187102	ACA	2	6	4925	4930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250070
66	NT_187102	TCT	2	6	5032	5037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250070
67	NT_187102	TCA	2	6	5038	5043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250070
68	NT_187102	TGA	2	6	5250	5255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250071
69	NT_187102	ATT	2	6	5287	5292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250071
70	NT_187102	GGT	2	6	5302	5307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250071
71	NT_187102	GCA	2	6	5319	5324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250071
72	NT_187102	CGG	2	6	5329	5334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250071
73	NT_187102	AGG	2	6	5442	5447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250071
74	NT_187102	CGT	2	6	5486	5491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250071
75	NT_187102	GCG	2	6	5661	5666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250071
76	NT_187102	GCC	2	6	5887	5892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250071
77	NT_187102	ATC	2	6	5969	5974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250071
78	NT_187102	CGA	2	6	6012	6017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250071
79	NT_187102	CTG	2	6	6052	6057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250071
80	NT_187102	TGC	2	6	6068	6073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250071
81	NT_187102	TGG	2	6	6377	6382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250072
82	NT_187102	ATT	2	6	6385	6390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250072
83	NT_187102	ACG	2	6	6400	6405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250072
84	NT_187102	ACA	2	6	6480	6485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250072
85	NT_187102	AGG	2	6	6518	6523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250072
86	NT_187102	GCC	2	6	6652	6657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250072
87	NT_187102	TGA	2	6	6725	6730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250072
88	NT_187102	ACG	2	6	6875	6880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250072
89	NT_187102	ATT	2	6	6898	6903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250072
90	NT_187102	CCG	2	6	7010	7015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250073
91	NT_187102	GTC	2	6	7092	7097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250073
92	NT_187102	ATG	2	6	7146	7151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250073
93	NT_187102	ATT	2	6	7290	7295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250073
94	NT_187102	TTG	2	6	7300	7305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250073
95	NT_187102	TCA	2	6	7702	7707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250073
96	NT_187102	TGT	2	6	7726	7731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250073
97	NT_187102	GCC	2	6	7758	7763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250073
98	NT_187102	TAA	2	6	7815	7820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250073
99	NT_187102	TCT	2	6	7829	7834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250073
100	NT_187102	TTC	2	6	7866	7871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250073
101	NT_187102	CAT	2	6	8136	8141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250074
102	NT_187102	GAT	2	6	8154	8159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250074
103	NT_187102	CCA	2	6	8273	8278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250074
104	NT_187102	GTC	2	6	8347	8352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250074
105	NT_187102	GCC	2	6	8368	8373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250074
106	NT_187102	CGG	2	6	8381	8386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250074
107	NT_187102	GAA	2	6	8410	8415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250074
108	NT_187102	AAT	2	6	8452	8457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250074
109	NT_187102	ATG	2	6	8495	8500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250074
110	NT_187102	GCG	2	6	8579	8584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250074
111	NT_187102	CGG	2	6	8591	8596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250074
112	NT_187102	TGC	2	6	8597	8602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250074
113	NT_187102	TGC	2	6	8732	8737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250074
114	NT_187102	TAT	2	6	8898	8903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250074
115	NT_187102	GGA	2	6	8988	8993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250074
116	NT_187102	ATT	2	6	9018	9023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250075
117	NT_187102	GGC	3	9	9067	9075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250075
118	NT_187102	ATG	2	6	9311	9316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250075
119	NT_187102	CGG	2	6	9376	9381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250075
120	NT_187102	TTG	2	6	9393	9398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250075
121	NT_187102	AAG	2	6	9453	9458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250075
122	NT_187102	CGC	2	6	9467	9472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250075
123	NT_187102	GCA	2	6	10008	10013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250076
124	NT_187102	CTG	2	6	10027	10032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250076
125	NT_187102	ACG	2	6	10087	10092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250076
126	NT_187102	AAG	2	6	10148	10153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250076
127	NT_187102	CAA	2	6	10275	10280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250076
128	NT_187102	GTC	2	6	10285	10290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250076
129	NT_187102	GTA	2	6	10294	10299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250076
130	NT_187102	GAT	2	6	10372	10377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250076
131	NT_187102	GCG	2	6	10491	10496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250077
132	NT_187102	ACC	2	6	10742	10747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250077
133	NT_187102	GCG	3	9	10771	10779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250077
134	NT_187102	GGC	2	6	10833	10838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250077
135	NT_187102	GGC	2	6	10845	10850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250077
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152	NT_187102	ATG	3	9	12579	12587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250079
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249	NT_187102	CCT	2	6	22045	22050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250089
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251	NT_187102	GAT	2	6	22192	22197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250089
252	NT_187102	TCG	2	6	22263	22268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250089
253	NT_187102	TTC	2	6	22310	22315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250089
254	NT_187102	GCA	2	6	22333	22338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250089
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258	NT_187102	TCA	2	6	22446	22451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250089
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283	NT_187102	CGG	2	6	24108	24113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250090
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372	NT_187102	ATC	2	6	30677	30682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250096
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