MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187101	GCAAG	2	10	86	95	40 %	0 %	40 %	20 %	409250028
2	NT_187101	CGGCG	2	10	1668	1677	0 %	0 %	60 %	40 %	409250028
3	NT_187101	TTTTA	2	10	3642	3651	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187101	GCGAA	2	10	3975	3984	40 %	0 %	40 %	20 %	409250030
5	NT_187101	GCCGG	2	10	6799	6808	0 %	0 %	60 %	40 %	409250033
6	NT_187101	TTCAG	2	10	10037	10046	20 %	40 %	20 %	20 %	409250037
7	NT_187101	CGTTG	2	10	12359	12368	0 %	40 %	40 %	20 %	409250038
8	NT_187101	TGGTC	2	10	15673	15682	0 %	40 %	40 %	20 %	409250040
9	NT_187101	AAATA	2	10	16080	16089	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187101	TAAGC	2	10	16781	16790	40 %	20 %	20 %	20 %	409250041
11	NT_187101	CACTG	2	10	17276	17285	20 %	20 %	20 %	40 %	409250042
12	NT_187101	GCGCG	2	10	23394	23403	0 %	0 %	60 %	40 %	409250048
13	NT_187101	GCAGG	2	10	24440	24449	20 %	0 %	60 %	20 %	409250049
14	NT_187101	ATGAA	2	10	25134	25143	60 %	20 %	20 %	0 %	409250051
15	NT_187101	CGTTT	2	10	26431	26440	0 %	60 %	20 %	20 %	409250052
16	NT_187101	CAGCG	2	10	27126	27135	20 %	0 %	40 %	40 %	409250053
17	NT_187101	TTTTA	2	10	27571	27580	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187101	GTACG	2	10	27840	27849	20 %	20 %	40 %	20 %	409250054
19	NT_187101	GCCGC	2	10	29245	29254	0 %	0 %	40 %	60 %	409250055
20	NT_187101	GCGCG	2	10	29535	29544	0 %	0 %	60 %	40 %	409250055
21	NT_187101	CGCTG	2	10	29655	29664	0 %	20 %	40 %	40 %	409250055
22	NT_187101	GGCGC	2	10	31383	31392	0 %	0 %	60 %	40 %	409250056
23	NT_187101	CTGTC	2	10	32759	32768	0 %	40 %	20 %	40 %	409250057
24	NT_187101	GATTT	2	10	33506	33515	20 %	60 %	20 %	0 %	409250058
25	NT_187101	CTGCG	2	10	34038	34047	0 %	20 %	40 %	40 %	409250058
26	NT_187101	TGCTG	2	10	36115	36124	0 %	40 %	40 %	20 %	409250060
27	NT_187101	TTTGA	2	10	37729	37738	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187101	CGGGC	2	10	38875	38884	0 %	0 %	60 %	40 %	409250062

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.