MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187101	TATT	2	8	15	22	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187101	GATT	2	8	705	712	25 %	50 %	25 %	0 %	409250028
3	NT_187101	CTGG	2	8	1417	1424	0 %	25 %	50 %	25 %	409250028
4	NT_187101	TCCG	2	8	1587	1594	0 %	25 %	25 %	50 %	409250028
5	NT_187101	TGCC	2	8	1764	1771	0 %	25 %	25 %	50 %	409250028
6	NT_187101	TAAG	2	8	2136	2143	50 %	25 %	25 %	0 %	409250028
7	NT_187101	ACGC	2	8	2449	2456	25 %	0 %	25 %	50 %	409250028
8	NT_187101	TGGG	2	8	3866	3873	0 %	25 %	75 %	0 %	409250030
9	NT_187101	ATTG	2	8	4376	4383	25 %	50 %	25 %	0 %	409250031
10	NT_187101	CGTT	2	8	4881	4888	0 %	50 %	25 %	25 %	409250032
11	NT_187101	CATC	2	8	4897	4904	25 %	25 %	0 %	50 %	409250032
12	NT_187101	AATC	2	8	4954	4961	50 %	25 %	0 %	25 %	409250032
13	NT_187101	CATA	2	8	5750	5757	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NT_187101	GTTG	2	8	6188	6195	0 %	50 %	50 %	0 %	409250033
15	NT_187101	CTGC	2	8	6241	6248	0 %	25 %	25 %	50 %	409250033
16	NT_187101	TGAT	2	8	7058	7065	25 %	50 %	25 %	0 %	409250033
17	NT_187101	GGCG	2	8	7098	7105	0 %	0 %	75 %	25 %	409250033
18	NT_187101	CGGG	2	8	7576	7583	0 %	0 %	75 %	25 %	409250033
19	NT_187101	TGGC	2	8	8208	8215	0 %	25 %	50 %	25 %	409250033
20	NT_187101	ATAA	2	8	8567	8574	75 %	25 %	0 %	0 %	409250033
21	NT_187101	AGTC	2	8	10221	10228	25 %	25 %	25 %	25 %	409250037
22	NT_187101	AAAG	2	8	10592	10599	75 %	0 %	25 %	0 %	409250038
23	NT_187101	GAAA	2	8	10643	10650	75 %	0 %	25 %	0 %	409250038
24	NT_187101	GATC	2	8	11579	11586	25 %	25 %	25 %	25 %	409250038
25	NT_187101	GCGT	2	8	11884	11891	0 %	25 %	50 %	25 %	409250038
26	NT_187101	CGTG	2	8	12260	12267	0 %	25 %	50 %	25 %	409250038
27	NT_187101	TGCG	2	8	12805	12812	0 %	25 %	50 %	25 %	409250038
28	NT_187101	CCGC	2	8	12916	12923	0 %	0 %	25 %	75 %	409250038
29	NT_187101	TCGC	2	8	13452	13459	0 %	25 %	25 %	50 %	409250038
30	NT_187101	TTGA	2	8	13812	13819	25 %	50 %	25 %	0 %	409250038
31	NT_187101	ATAA	2	8	14232	14239	75 %	25 %	0 %	0 %	409250038
32	NT_187101	TGGC	2	8	14523	14530	0 %	25 %	50 %	25 %	409250039
33	NT_187101	GAAA	2	8	14876	14883	75 %	0 %	25 %	0 %	409250039
34	NT_187101	GCTG	2	8	14980	14987	0 %	25 %	50 %	25 %	409250039
35	NT_187101	GCAG	2	8	15206	15213	25 %	0 %	50 %	25 %	409250039
36	NT_187101	TTCA	2	8	15357	15364	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NT_187101	TTAT	2	8	15650	15657	25 %	75 %	0 %	0 %	409250040
38	NT_187101	TGAC	2	8	15898	15905	25 %	25 %	25 %	25 %	409250040
39	NT_187101	TTTG	2	8	16748	16755	0 %	75 %	25 %	0 %	409250041
40	NT_187101	GTGA	2	8	16908	16915	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187101	TAAT	2	8	17030	17037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187101	TTTA	2	8	17175	17182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187101	ACCT	2	8	17188	17195	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NT_187101	ACCA	2	8	17431	17438	50 %	0 %	0 %	50 %	409250043
45	NT_187101	GTAA	2	8	17791	17798	50 %	25 %	25 %	0 %	409250043
46	NT_187101	CGAT	2	8	17845	17852	25 %	25 %	25 %	25 %	409250043
47	NT_187101	CAGC	2	8	17990	17997	25 %	0 %	25 %	50 %	409250043
48	NT_187101	GCAG	2	8	18058	18065	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NT_187101	TGGG	2	8	18352	18359	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187101	AGCG	2	8	18393	18400	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NT_187101	GCCA	2	8	18505	18512	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NT_187101	CATA	2	8	18737	18744	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NT_187101	CTAT	2	8	18885	18892	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NT_187101	AACA	2	8	19127	19134	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NT_187101	GGTG	2	8	19568	19575	0 %	25 %	75 %	0 %	409250044
56	NT_187101	TGGA	2	8	19910	19917	25 %	25 %	50 %	0 %	409250045
57	NT_187101	TGTC	2	8	20385	20392	0 %	50 %	25 %	25 %	409250045
58	NT_187101	CTTT	2	8	20991	20998	0 %	75 %	0 %	25 %	409250045
59	NT_187101	ATTA	2	8	21104	21111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187101	AATG	2	8	21489	21496	50 %	25 %	25 %	0 %	409250047
61	NT_187101	AAAG	2	8	22032	22039	75 %	0 %	25 %	0 %	409250047
62	NT_187101	TTAT	2	8	22498	22505	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187101	GATT	2	8	22635	22642	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187101	GATT	2	8	22751	22758	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187101	GGCG	2	8	24244	24251	0 %	0 %	75 %	25 %	409250049
66	NT_187101	ATCC	2	8	24649	24656	25 %	25 %	0 %	50 %	409250049
67	NT_187101	GAAT	2	8	24732	24739	50 %	25 %	25 %	0 %	409250050
68	NT_187101	AGCC	2	8	25897	25904	25 %	0 %	25 %	50 %	409250051
69	NT_187101	ATGA	2	8	26214	26221	50 %	25 %	25 %	0 %	409250052
70	NT_187101	GTCA	2	8	26307	26314	25 %	25 %	25 %	25 %	409250052
71	NT_187101	GGCA	2	8	26781	26788	25 %	0 %	50 %	25 %	409250053
72	NT_187101	GATC	2	8	27008	27015	25 %	25 %	25 %	25 %	409250053
73	NT_187101	GCAA	2	8	27034	27041	50 %	0 %	25 %	25 %	409250053
74	NT_187101	GTTC	2	8	27320	27327	0 %	50 %	25 %	25 %	409250053
75	NT_187101	GCTG	2	8	27343	27350	0 %	25 %	50 %	25 %	409250053
76	NT_187101	GGCG	2	8	28059	28066	0 %	0 %	75 %	25 %	409250054
77	NT_187101	ATCC	2	8	28843	28850	25 %	25 %	0 %	50 %	409250054
78	NT_187101	AAGG	2	8	29137	29144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187101	GTAT	2	8	30363	30370	25 %	50 %	25 %	0 %	409250055
80	NT_187101	TGCG	2	8	30599	30606	0 %	25 %	50 %	25 %	409250055
81	NT_187101	CAAT	2	8	31027	31034	50 %	25 %	0 %	25 %	409250056
82	NT_187101	TCCT	2	8	31402	31409	0 %	50 %	0 %	50 %	409250056
83	NT_187101	GATA	2	8	31476	31483	50 %	25 %	25 %	0 %	409250056
84	NT_187101	CCCG	2	8	32481	32488	0 %	0 %	25 %	75 %	409250056
85	NT_187101	TCCT	2	8	32655	32662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NT_187101	CCGG	2	8	34270	34277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NT_187101	CCAG	2	8	34416	34423	25 %	0 %	25 %	50 %	409250059
88	NT_187101	CTGC	2	8	35099	35106	0 %	25 %	25 %	50 %	409250059
89	NT_187101	GACA	2	8	35164	35171	50 %	0 %	25 %	25 %	409250059
90	NT_187101	CAGG	2	8	35413	35420	25 %	0 %	50 %	25 %	409250060
91	NT_187101	TGCG	2	8	35511	35518	0 %	25 %	50 %	25 %	409250060
92	NT_187101	ACAG	2	8	35673	35680	50 %	0 %	25 %	25 %	409250060
93	NT_187101	GCCA	2	8	35750	35757	25 %	0 %	25 %	50 %	409250060
94	NT_187101	TAAT	2	8	36648	36655	50 %	50 %	0 %	0 %	409250060
95	NT_187101	GCAT	2	8	36734	36741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NT_187101	AGCC	2	8	36809	36816	25 %	0 %	25 %	50 %	409250061
97	NT_187101	CGGG	2	8	37102	37109	0 %	0 %	75 %	25 %	409250061
98	NT_187101	CTGG	2	8	37114	37121	0 %	25 %	50 %	25 %	409250061
99	NT_187101	TAAT	2	8	37694	37701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187101	ATTG	2	8	37706	37713	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187101	CGAT	2	8	38052	38059	25 %	25 %	25 %	25 %	409250062
102	NT_187101	GCAT	2	8	39169	39176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.