MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187100	ATTGAT	2	12	1921	1932	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	409249917
2	NT_187100	GTAGTG	2	12	14897	14908	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	409249927
3	NT_187100	TCCCGA	2	12	16970	16981	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409249929
4	NT_187100	TGTGGC	2	12	17538	17549	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	409249930
5	NT_187100	AAACCG	2	12	21100	21111	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	409249936
6	NT_187100	AGCAAT	2	12	22873	22884	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	409249939
7	NT_187100	CAGATT	2	12	26758	26769	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	409249945
8	NT_187100	GCTGTT	2	12	31006	31017	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	409249949
9	NT_187100	ATATTG	2	12	34771	34782	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	409249952
10	NT_187100	AAAGCG	2	12	38910	38921	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	409249957
11	NT_187100	GAGCGC	2	12	41012	41023	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409249959
12	NT_187100	CCGGCA	2	12	45879	45890	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409249963
13	NT_187100	GAGCTG	2	12	46547	46558	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409249963
14	NT_187100	TGGCAG	2	12	48951	48962	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409249965
15	NT_187100	CATTGC	2	12	55710	55721	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409249973
16	NT_187100	CCTGCG	2	12	55929	55940	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409249973
17	NT_187100	CAAGAC	2	12	56973	56984	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	409249974
18	NT_187100	CAGTTC	2	12	59868	59879	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409249976
19	NT_187100	TGAAGA	2	12	62221	62232	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	409249977
20	NT_187100	CAGCAA	2	12	67423	67434	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	409249981
21	NT_187100	GGAAGC	2	12	70897	70908	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	409249985
22	NT_187100	TGGCTG	2	12	71152	71163	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	409249986
23	NT_187100	GCGTTA	2	12	72013	72024	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409249989
24	NT_187100	CATAGC	2	12	74279	74290	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409249991
25	NT_187100	GGCGCT	2	12	78062	78073	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409249995
26	NT_187100	AACGCA	2	12	78422	78433	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	409249997
27	NT_187100	TGATAT	2	12	79932	79943	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	409249998
28	NT_187100	GGAGCT	2	12	82268	82279	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409250000
29	NT_187100	TGAGGA	2	12	88881	88892	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	409250007
30	NT_187100	CTTCAG	2	12	90714	90725	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409250008
31	NT_187100	GCGACC	2	12	103862	103873	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409250023
32	NT_187100	TCTGAA	2	12	106519	106530	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	409250026

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.