MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187100	ATTGC	2	10	1202	1211	20 %	40 %	20 %	20 %	409249915
2	NT_187100	CGTCG	2	10	6088	6097	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NT_187100	ACTGC	2	10	6204	6213	20 %	20 %	20 %	40 %	409249921
4	NT_187100	CAGCT	2	10	7222	7231	20 %	20 %	20 %	40 %	409249922
5	NT_187100	AGCGC	2	10	7932	7941	20 %	0 %	40 %	40 %	409249922
6	NT_187100	GTCGG	2	10	8087	8096	0 %	20 %	60 %	20 %	409249922
7	NT_187100	AAACA	2	10	10431	10440	80 %	0 %	0 %	20 %	409249923
8	NT_187100	TTATT	2	10	10974	10983	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187100	CGCAG	2	10	13005	13014	20 %	0 %	40 %	40 %	409249925
10	NT_187100	TACGC	2	10	16289	16298	20 %	20 %	20 %	40 %	409249929
11	NT_187100	GCCGC	2	10	21160	21169	0 %	0 %	40 %	60 %	409249936
12	NT_187100	ATGCG	2	10	21431	21440	20 %	20 %	40 %	20 %	409249936
13	NT_187100	CGAAT	2	10	25267	25276	40 %	20 %	20 %	20 %	409249943
14	NT_187100	CGCTT	2	10	25569	25578	0 %	40 %	20 %	40 %	409249943
15	NT_187100	CATGG	2	10	26329	26338	20 %	20 %	40 %	20 %	409249944
16	NT_187100	TTACA	2	10	27031	27040	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NT_187100	TAGCG	2	10	29210	29219	20 %	20 %	40 %	20 %	409249948
18	NT_187100	GCGGA	2	10	32825	32834	20 %	0 %	60 %	20 %	409249951
19	NT_187100	CGGCG	2	10	33228	33237	0 %	0 %	60 %	40 %	409249951
20	NT_187100	GGGCA	2	10	33413	33422	20 %	0 %	60 %	20 %	409249951
21	NT_187100	GCGCG	2	10	36400	36409	0 %	0 %	60 %	40 %	409249954
22	NT_187100	ACGCA	2	10	38748	38757	40 %	0 %	20 %	40 %	409249957
23	NT_187100	CTGAA	2	10	40677	40686	40 %	20 %	20 %	20 %	409249959
24	NT_187100	CAAAA	2	10	42895	42904	80 %	0 %	0 %	20 %	409249959
25	NT_187100	CAGGA	2	10	43589	43598	40 %	0 %	40 %	20 %	409249960
26	NT_187100	GCGTT	2	10	44317	44326	0 %	40 %	40 %	20 %	409249960
27	NT_187100	TGGCA	2	10	44404	44413	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NT_187100	CCGCG	2	10	44693	44702	0 %	0 %	40 %	60 %	409249961
29	NT_187100	TGGGG	2	10	46026	46035	0 %	20 %	80 %	0 %	409249963
30	NT_187100	GGCCG	2	10	46477	46486	0 %	0 %	60 %	40 %	409249963
31	NT_187100	GTATC	2	10	49900	49909	20 %	40 %	20 %	20 %	409249966
32	NT_187100	CAGCA	2	10	52825	52834	40 %	0 %	20 %	40 %	409249970
33	NT_187100	TAAAA	2	10	52918	52927	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187100	GCTCT	2	10	54026	54035	0 %	40 %	20 %	40 %	409249972
35	NT_187100	CTGTC	2	10	55145	55154	0 %	40 %	20 %	40 %	409249973
36	NT_187100	GTACC	2	10	56610	56619	20 %	20 %	20 %	40 %	409249974
37	NT_187100	TTCGA	2	10	57518	57527	20 %	40 %	20 %	20 %	409249974
38	NT_187100	GCGCG	2	10	58095	58104	0 %	0 %	60 %	40 %	409249974
39	NT_187100	GGTTG	2	10	58779	58788	0 %	40 %	60 %	0 %	409249975
40	NT_187100	TTCTT	2	10	62325	62334	0 %	80 %	0 %	20 %	409249977
41	NT_187100	AGTTC	2	10	62635	62644	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NT_187100	AGTGG	2	10	63082	63091	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187100	GCGTG	2	10	64690	64699	0 %	20 %	60 %	20 %	409249980
44	NT_187100	GAGAG	2	10	65379	65388	40 %	0 %	60 %	0 %	409249980
45	NT_187100	GCGCC	2	10	66221	66230	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
46	NT_187100	GGCCA	2	10	68284	68293	20 %	0 %	40 %	40 %	409249982
47	NT_187100	ACGTC	2	10	71626	71635	20 %	20 %	20 %	40 %	409249987
48	NT_187100	CGCTG	2	10	73814	73823	0 %	20 %	40 %	40 %	409249990
49	NT_187100	CGTCG	2	10	76013	76022	0 %	20 %	40 %	40 %	409249992
50	NT_187100	CGAAG	2	10	77364	77373	40 %	0 %	40 %	20 %	409249994
51	NT_187100	GGCGC	2	10	77547	77556	0 %	0 %	60 %	40 %	409249994
52	NT_187100	TGCAG	2	10	78345	78354	20 %	20 %	40 %	20 %	409249997
53	NT_187100	GCATT	2	10	82223	82232	20 %	40 %	20 %	20 %	409250000
54	NT_187100	GAAGG	2	10	82536	82545	40 %	0 %	60 %	0 %	409250000
55	NT_187100	ATCGC	2	10	84472	84481	20 %	20 %	20 %	40 %	409250002
56	NT_187100	TGAAT	2	10	85857	85866	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187100	CAAAT	2	10	86244	86253	60 %	20 %	0 %	20 %	409250005
58	NT_187100	TACAG	2	10	87516	87525	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NT_187100	ATGAA	2	10	91408	91417	60 %	20 %	20 %	0 %	409250008
60	NT_187100	GACTT	2	10	91776	91785	20 %	40 %	20 %	20 %	409250009
61	NT_187100	CGGCA	2	10	93899	93908	20 %	0 %	40 %	40 %	409250012
62	NT_187100	CGTAA	2	10	95264	95273	40 %	20 %	20 %	20 %	409250014
63	NT_187100	CGCAG	2	10	96611	96620	20 %	0 %	40 %	40 %	409250016
64	NT_187100	GTGAT	2	10	101654	101663	20 %	40 %	40 %	0 %	409250021
65	NT_187100	CGCTG	2	10	101825	101834	0 %	20 %	40 %	40 %	409250021
66	NT_187100	AACTG	2	10	104117	104126	40 %	20 %	20 %	20 %	409250023
67	NT_187100	GGTTG	2	10	104728	104737	0 %	40 %	60 %	0 %	409250024
68	NT_187100	ATCTT	2	10	106267	106276	20 %	60 %	0 %	20 %	409250026

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.