MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 260

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187100	AGCG	2	8	829	836	25 %	0 %	50 %	25 %	409249915
2	NT_187100	GCGG	2	8	1327	1334	0 %	0 %	75 %	25 %	409249916
3	NT_187100	TTAA	2	8	1566	1573	50 %	50 %	0 %	0 %	409249916
4	NT_187100	GATG	2	8	2046	2053	25 %	25 %	50 %	0 %	409249917
5	NT_187100	CTGG	2	8	2280	2287	0 %	25 %	50 %	25 %	409249917
6	NT_187100	TGGC	2	8	2579	2586	0 %	25 %	50 %	25 %	409249917
7	NT_187100	TCGC	2	8	2880	2887	0 %	25 %	25 %	50 %	409249918
8	NT_187100	GCTT	2	8	3187	3194	0 %	50 %	25 %	25 %	409249918
9	NT_187100	ATTA	2	8	3340	3347	50 %	50 %	0 %	0 %	409249918
10	NT_187100	CGGG	2	8	3442	3449	0 %	0 %	75 %	25 %	409249918
11	NT_187100	CGCT	2	8	5949	5956	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NT_187100	ACTC	2	8	5991	5998	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NT_187100	AATG	2	8	6185	6192	50 %	25 %	25 %	0 %	409249921
14	NT_187100	GAGC	2	8	6380	6387	25 %	0 %	50 %	25 %	409249921
15	NT_187100	TCTT	2	8	7019	7026	0 %	75 %	0 %	25 %	409249922
16	NT_187100	CAGC	2	8	7779	7786	25 %	0 %	25 %	50 %	409249922
17	NT_187100	GTCA	2	8	8188	8195	25 %	25 %	25 %	25 %	409249922
18	NT_187100	TAGA	2	8	8267	8274	50 %	25 %	25 %	0 %	409249922
19	NT_187100	CTGG	2	8	8511	8518	0 %	25 %	50 %	25 %	409249922
20	NT_187100	CAGG	2	8	8536	8543	25 %	0 %	50 %	25 %	409249922
21	NT_187100	GGCT	2	8	8746	8753	0 %	25 %	50 %	25 %	409249922
22	NT_187100	TGGC	2	8	8843	8850	0 %	25 %	50 %	25 %	409249922
23	NT_187100	GATC	2	8	9135	9142	25 %	25 %	25 %	25 %	409249922
24	NT_187100	GTTG	2	8	9208	9215	0 %	50 %	50 %	0 %	409249922
25	NT_187100	AGTG	2	8	9964	9971	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187100	ATAA	2	8	9992	9999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187100	GTCG	2	8	10280	10287	0 %	25 %	50 %	25 %	409249923
28	NT_187100	GCGG	2	8	10368	10375	0 %	0 %	75 %	25 %	409249923
29	NT_187100	TATT	2	8	10911	10918	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187100	TTTC	2	8	11136	11143	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NT_187100	CGAA	2	8	11403	11410	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NT_187100	AATA	2	8	11418	11425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187100	AACG	2	8	12221	12228	50 %	0 %	25 %	25 %	409249925
34	NT_187100	TGGG	3	12	13106	13117	0 %	25 %	75 %	0 %	409249925
35	NT_187100	ATTT	2	8	13310	13317	25 %	75 %	0 %	0 %	409249926
36	NT_187100	TCTT	2	8	13368	13375	0 %	75 %	0 %	25 %	409249926
37	NT_187100	TAAG	2	8	14244	14251	50 %	25 %	25 %	0 %	409249927
38	NT_187100	CGTG	2	8	14782	14789	0 %	25 %	50 %	25 %	409249927
39	NT_187100	GGTG	2	8	14836	14843	0 %	25 %	75 %	0 %	409249927
40	NT_187100	GGCT	2	8	15061	15068	0 %	25 %	50 %	25 %	409249927
41	NT_187100	CTGG	2	8	16406	16413	0 %	25 %	50 %	25 %	409249929
42	NT_187100	CGTG	2	8	16577	16584	0 %	25 %	50 %	25 %	409249929
43	NT_187100	CTTT	2	8	17219	17226	0 %	75 %	0 %	25 %	409249930
44	NT_187100	CTGG	2	8	17401	17408	0 %	25 %	50 %	25 %	409249930
45	NT_187100	GCGA	2	8	17590	17597	25 %	0 %	50 %	25 %	409249930
46	NT_187100	TCAG	2	8	18395	18402	25 %	25 %	25 %	25 %	409249931
47	NT_187100	CGCC	2	8	18744	18751	0 %	0 %	25 %	75 %	409249932
48	NT_187100	CAGC	2	8	21397	21404	25 %	0 %	25 %	50 %	409249936
49	NT_187100	ATAA	2	8	21639	21646	75 %	25 %	0 %	0 %	409249937
50	NT_187100	TTCC	2	8	21806	21813	0 %	50 %	0 %	50 %	409249937
51	NT_187100	CAGC	2	8	21888	21895	25 %	0 %	25 %	50 %	409249937
52	NT_187100	GGCA	2	8	21927	21934	25 %	0 %	50 %	25 %	409249937
53	NT_187100	CGCA	2	8	22299	22306	25 %	0 %	25 %	50 %	409249938
54	NT_187100	ATAA	2	8	22444	22451	75 %	25 %	0 %	0 %	409249938
55	NT_187100	CAAC	2	8	22991	22998	50 %	0 %	0 %	50 %	409249939
56	NT_187100	CTGC	2	8	23311	23318	0 %	25 %	25 %	50 %	409249939
57	NT_187100	CATG	2	8	23896	23903	25 %	25 %	25 %	25 %	409249940
58	NT_187100	AGCC	2	8	24029	24036	25 %	0 %	25 %	50 %	409249941
59	NT_187100	GCGT	2	8	24841	24848	0 %	25 %	50 %	25 %	409249942
60	NT_187100	TTCT	2	8	25049	25056	0 %	75 %	0 %	25 %	409249943
61	NT_187100	ATAA	2	8	25380	25387	75 %	25 %	0 %	0 %	409249943
62	NT_187100	TCGC	2	8	25391	25398	0 %	25 %	25 %	50 %	409249943
63	NT_187100	AGCG	2	8	25552	25559	25 %	0 %	50 %	25 %	409249943
64	NT_187100	GTTT	2	8	26520	26527	0 %	75 %	25 %	0 %	409249945
65	NT_187100	TTGC	2	8	27247	27254	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NT_187100	TTGT	2	8	27484	27491	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187100	GCAC	2	8	27838	27845	25 %	0 %	25 %	50 %	409249947
68	NT_187100	AGGT	2	8	27988	27995	25 %	25 %	50 %	0 %	409249947
69	NT_187100	AAAT	2	8	28491	28498	75 %	25 %	0 %	0 %	409249947
70	NT_187100	GCCC	2	8	29854	29861	0 %	0 %	25 %	75 %	409249949
71	NT_187100	GACG	2	8	30325	30332	25 %	0 %	50 %	25 %	409249949
72	NT_187100	AATC	2	8	30493	30500	50 %	25 %	0 %	25 %	409249949
73	NT_187100	TACC	2	8	30529	30536	25 %	25 %	0 %	50 %	409249949
74	NT_187100	CAAT	2	8	31504	31511	50 %	25 %	0 %	25 %	409249950
75	NT_187100	GCCT	2	8	32480	32487	0 %	25 %	25 %	50 %	409249950
76	NT_187100	CGAT	2	8	32547	32554	25 %	25 %	25 %	25 %	409249950
77	NT_187100	ACCG	2	8	32875	32882	25 %	0 %	25 %	50 %	409249951
78	NT_187100	GGCG	2	8	33603	33610	0 %	0 %	75 %	25 %	409249951
79	NT_187100	TAAA	2	8	33706	33713	75 %	25 %	0 %	0 %	409249951
80	NT_187100	CGAC	2	8	33935	33942	25 %	0 %	25 %	50 %	409249951
81	NT_187100	CCGC	2	8	34321	34328	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NT_187100	TCAT	2	8	35065	35072	25 %	50 %	0 %	25 %	409249952
83	NT_187100	ATCC	2	8	35404	35411	25 %	25 %	0 %	50 %	409249953
84	NT_187100	GAAG	2	8	36095	36102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NT_187100	CGTT	2	8	36742	36749	0 %	50 %	25 %	25 %	409249954
86	NT_187100	GCGG	2	8	37507	37514	0 %	0 %	75 %	25 %	409249955
87	NT_187100	GAGC	2	8	38792	38799	25 %	0 %	50 %	25 %	409249957
88	NT_187100	GATG	2	8	38837	38844	25 %	25 %	50 %	0 %	409249957
89	NT_187100	GATC	2	8	39614	39621	25 %	25 %	25 %	25 %	409249957
90	NT_187100	CGAT	2	8	39966	39973	25 %	25 %	25 %	25 %	409249958
91	NT_187100	ATCT	2	8	40712	40719	25 %	50 %	0 %	25 %	409249959
92	NT_187100	CCGG	2	8	41134	41141	0 %	0 %	50 %	50 %	409249959
93	NT_187100	TGCC	2	8	41745	41752	0 %	25 %	25 %	50 %	409249959
94	NT_187100	ACCG	2	8	41975	41982	25 %	0 %	25 %	50 %	409249959
95	NT_187100	GATC	2	8	42415	42422	25 %	25 %	25 %	25 %	409249959
96	NT_187100	GAAG	2	8	42649	42656	50 %	0 %	50 %	0 %	409249959
97	NT_187100	ACTC	2	8	43204	43211	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NT_187100	AGCA	2	8	43504	43511	50 %	0 %	25 %	25 %	409249960
99	NT_187100	GTCG	2	8	43647	43654	0 %	25 %	50 %	25 %	409249960
100	NT_187100	GCTC	2	8	43682	43689	0 %	25 %	25 %	50 %	409249960
101	NT_187100	TATG	2	8	44253	44260	25 %	50 %	25 %	0 %	409249960
102	NT_187100	GATT	2	8	44529	44536	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187100	TTTA	2	8	44583	44590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187100	TGGC	2	8	44726	44733	0 %	25 %	50 %	25 %	409249961
105	NT_187100	TTAT	2	8	45197	45204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187100	TTTG	2	8	45283	45290	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187100	GCTG	2	8	45433	45440	0 %	25 %	50 %	25 %	409249963
108	NT_187100	TGCC	2	8	45636	45643	0 %	25 %	25 %	50 %	409249963
109	NT_187100	GACT	2	8	45985	45992	25 %	25 %	25 %	25 %	409249963
110	NT_187100	GTGG	2	8	46037	46044	0 %	25 %	75 %	0 %	409249963
111	NT_187100	GGGA	2	8	46131	46138	25 %	0 %	75 %	0 %	409249963
112	NT_187100	ATCC	2	8	46973	46980	25 %	25 %	0 %	50 %	409249963
113	NT_187100	CTGG	2	8	46996	47003	0 %	25 %	50 %	25 %	409249963
114	NT_187100	CTTT	2	8	47286	47293	0 %	75 %	0 %	25 %	409249963
115	NT_187100	CGAC	2	8	47373	47380	25 %	0 %	25 %	50 %	409249963
116	NT_187100	CCGG	2	8	47390	47397	0 %	0 %	50 %	50 %	409249963
117	NT_187100	TGAT	2	8	47850	47857	25 %	50 %	25 %	0 %	409249963
118	NT_187100	CAGG	2	8	48057	48064	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NT_187100	CTTA	3	12	48086	48097	25 %	50 %	0 %	25 %	409249964
120	NT_187100	TTAT	2	8	48852	48859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NT_187100	CTGG	2	8	49553	49560	0 %	25 %	50 %	25 %	409249965
122	NT_187100	GGCG	2	8	49679	49686	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NT_187100	TTGC	2	8	49916	49923	0 %	50 %	25 %	25 %	409249966
124	NT_187100	TGGC	2	8	49951	49958	0 %	25 %	50 %	25 %	409249966
125	NT_187100	GCGA	2	8	51097	51104	25 %	0 %	50 %	25 %	409249967
126	NT_187100	GTCC	2	8	51213	51220	0 %	25 %	25 %	50 %	409249967
127	NT_187100	TCTT	2	8	51664	51671	0 %	75 %	0 %	25 %	409249968
128	NT_187100	GCAG	2	8	52041	52048	25 %	0 %	50 %	25 %	409249968
129	NT_187100	AGGC	2	8	52051	52058	25 %	0 %	50 %	25 %	409249968
130	NT_187100	ATGA	2	8	52361	52368	50 %	25 %	25 %	0 %	409249969
131	NT_187100	CCGT	2	8	52712	52719	0 %	25 %	25 %	50 %	409249970
132	NT_187100	GCCA	2	8	53367	53374	25 %	0 %	25 %	50 %	409249971
133	NT_187100	ATTG	2	8	53852	53859	25 %	50 %	25 %	0 %	409249971
134	NT_187100	ACAG	2	8	53905	53912	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NT_187100	TGCG	2	8	54104	54111	0 %	25 %	50 %	25 %	409249972
136	NT_187100	ATCG	2	8	54670	54677	25 %	25 %	25 %	25 %	409249973
137	NT_187100	CCAG	2	8	55026	55033	25 %	0 %	25 %	50 %	409249973
138	NT_187100	ATAA	2	8	55772	55779	75 %	25 %	0 %	0 %	409249973
139	NT_187100	AAAG	2	8	56278	56285	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NT_187100	GAGC	2	8	56489	56496	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NT_187100	CACT	2	8	57392	57399	25 %	25 %	0 %	50 %	409249974
142	NT_187100	CCAG	2	8	57480	57487	25 %	0 %	25 %	50 %	409249974
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259	NT_187100	GTCA	2	8	106064	106071	25 %	25 %	25 %	25 %	409250025
260	NT_187100	CGAA	2	8	106992	106999	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.